src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.schemes.*;\r
  29 \r
  30 public class UserDefinedColours\r
  31     extends Panel implements ActionListener, AdjustmentListener\r
  32 {\r
  33 \r
  34   AlignmentPanel ap;\r
  35   SequenceGroup seqGroup;\r
  36   Button selectedButton;\r
  37   Vector oldColours = new Vector();\r
  38   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  39   Frame frame;\r
  40   MCview.AppletPDBCanvas pdbcanvas;\r
  41   FeatureSettings featureSettings;\r
  42   String feature;\r
  43   Color originalFeatureCol;\r
  44 \r
  45   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  46 \r
  47   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  48   {\r
  49     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  50     return null;\r
  51   }\r
  52 \r
  53   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  54   {\r
  55     this.ap = ap;\r
  56     seqGroup = sg;\r
  57 \r
  58     if (seqGroup != null)\r
  59     {\r
  60       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  61     }\r
  62     else\r
  63     {\r
  64       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  65     }\r
  66 \r
  67     init();\r
  68   }\r
  69 \r
  70   public UserDefinedColours(MCview.AppletPDBCanvas pdb)\r
  71   {\r
  72     this.pdbcanvas = pdb;\r
  73     init();\r
  74   }\r
  75 \r
  76   public UserDefinedColours(FeatureSettings featureSettings,\r
  77                             String feature,\r
  78                             Color col)\r
  79   {\r
  80     this.featureSettings = featureSettings;\r
  81     this.feature = feature;\r
  82     init();\r
  83     remove(buttonPanel);\r
  84     originalFeatureCol = col;\r
  85     setTargetColour(col);\r
  86 \r
  87     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 113, 400, 35));\r
  88     frame.setTitle("User Defined Colours - "+feature);\r
  89     frame.setSize(420, 200);\r
  90   }\r
  91 \r
  92   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  93   {\r
  94     if(evt.getSource()==okButton)\r
  95      okButton_actionPerformed();\r
  96    else if(evt.getSource()==applyButton)\r
  97       applyButton_actionPerformed();\r
  98    else if(evt.getSource()==cancelButton)\r
  99      cancelButton_actionPerformed();\r
 100    else if(evt.getSource()==rText)\r
 101      rText_actionPerformed();\r
 102    else if (evt.getSource() == gText)\r
 103      gText_actionPerformed();\r
 104    else if (evt.getSource() == bText)\r
 105      bText_actionPerformed();\r
 106 }\r
 107 \r
 108   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 109   {\r
 110     if(evt.getSource()==rScroller)\r
 111     rScroller_adjustmentValueChanged();\r
 112   else if(evt.getSource()==gScroller)\r
 113     gScroller_adjustmentValueChanged();\r
 114   else if(evt.getSource()==bScroller)\r
 115     bScroller_adjustmentValueChanged();\r
 116 }\r
 117 \r
 118   void init()\r
 119   {\r
 120     try\r
 121     {\r
 122       jbInit();\r
 123     }\r
 124     catch (Exception e)\r
 125     {\r
 126       e.printStackTrace();\r
 127     }\r
 128     frame = new Frame();\r
 129     frame.add(this);\r
 130     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
 131 \r
 132     if (seqGroup != null)\r
 133     {\r
 134       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + seqGroup.getName() + ")");\r
 135     }\r
 136 \r
 137     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
 138     {\r
 139       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
 140                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
 141     }\r
 142 \r
 143     makeButton("B", "B");\r
 144     makeButton("Z", "Z");\r
 145     makeButton("X", "X");\r
 146     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
 147 \r
 148     validate();\r
 149   }\r
 150   protected void rText_actionPerformed()\r
 151   {\r
 152     try\r
 153     {\r
 154       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
 155       rScroller.setValue(i);\r
 156       rScroller_adjustmentValueChanged();\r
 157     }\r
 158     catch (NumberFormatException ex)\r
 159     {}\r
 160   }\r
 161 \r
 162   protected void gText_actionPerformed()\r
 163   {\r
 164     try\r
 165     {\r
 166       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 167       gScroller.setValue(i);\r
 168       gScroller_adjustmentValueChanged();\r
 169     }\r
 170     catch (NumberFormatException ex)\r
 171     {}\r
 172 \r
 173   }\r
 174 \r
 175   protected void bText_actionPerformed()\r
 176   {\r
 177     try\r
 178     {\r
 179       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 180       bScroller.setValue(i);\r
 181       bScroller_adjustmentValueChanged();\r
 182     }\r
 183     catch (NumberFormatException ex)\r
 184     {}\r
 185 \r
 186   }\r
 187 \r
 188   protected void rScroller_adjustmentValueChanged()\r
 189   {\r
 190     R = rScroller.getValue();\r
 191     rText.setText(R + "");\r
 192     colourChanged();\r
 193   }\r
 194 \r
 195   protected void gScroller_adjustmentValueChanged()\r
 196   {\r
 197     G = gScroller.getValue();\r
 198     gText.setText(G + "");\r
 199     colourChanged();\r
 200   }\r
 201 \r
 202   protected void bScroller_adjustmentValueChanged()\r
 203   {\r
 204     B = bScroller.getValue();\r
 205     bText.setText(B + "");\r
 206     colourChanged();\r
 207   }\r
 208 \r
 209   public void colourChanged()\r
 210   {\r
 211     Color col = new Color(R, G, B);\r
 212     target.setBackground(col);\r
 213     target.repaint();\r
 214 \r
 215     if (selectedButton != null)\r
 216     {\r
 217       selectedButton.setBackground(col);\r
 218       selectedButton.repaint();\r
 219     }\r
 220   }\r
 221 \r
 222   void setTargetColour(Color col)\r
 223   {\r
 224     R = col.getRed();\r
 225     G = col.getGreen();\r
 226     B = col.getBlue();\r
 227     rScroller.setValue(R);\r
 228     gScroller.setValue(G);\r
 229     bScroller.setValue(B);\r
 230     rText.setText(R + "");\r
 231     gText.setText(G + "");\r
 232     bText.setText(B + "");\r
 233     colourChanged();\r
 234   }\r
 235 \r
 236   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 237   {\r
 238     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 239     setTargetColour(selectedButton.getBackground());\r
 240   }\r
 241 \r
 242   void makeButton(String label, String aa)\r
 243   {\r
 244     final Button button = new Button();\r
 245     Color col = Color.white;\r
 246 \r
 247     try\r
 248     {\r
 249       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 250     }\r
 251     catch (Exception ex)\r
 252     {}\r
 253 \r
 254     button.setBackground(col);\r
 255     oldColours.addElement(col);\r
 256     button.setLabel(label);\r
 257     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 258     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 259     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 260     {\r
 261       public void mousePressed(MouseEvent e)\r
 262       {\r
 263         colourButtonPressed(e);\r
 264       }\r
 265     });\r
 266 \r
 267     buttonPanel.add(button, null);\r
 268   }\r
 269 \r
 270   protected void okButton_actionPerformed()\r
 271   {\r
 272     applyButton_actionPerformed();\r
 273     frame.setVisible(false);\r
 274   }\r
 275 \r
 276   protected void applyButton_actionPerformed()\r
 277   {\r
 278     if (featureSettings != null)\r
 279     {\r
 280       featureSettings.setUserColour(feature, new Color(R,G,B));\r
 281       return;\r
 282     }\r
 283 \r
 284     Color[] newColours = new Color[24];\r
 285     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 286     {\r
 287       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 288       newColours[i] = button.getBackground();\r
 289     }\r
 290 \r
 291     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 292     if(ap!=null)\r
 293       ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 294 \r
 295     if(ap!=null)\r
 296     {\r
 297       if (seqGroup != null)\r
 298       {\r
 299         seqGroup.cs = ucs;\r
 300       }\r
 301       else\r
 302       {\r
 303         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 304       }\r
 305       ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 306       ap.repaint();\r
 307     }\r
 308     else if(pdbcanvas!=null)\r
 309     {\r
 310       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 311       pdbcanvas.updateSeqColours();\r
 312     }\r
 313   }\r
 314 \r
 315 \r
 316   protected void cancelButton_actionPerformed()\r
 317   {\r
 318     if(featureSettings!=null)\r
 319     {\r
 320       featureSettings.setUserColour(feature, originalFeatureCol);\r
 321       frame.setVisible(false);\r
 322       return;\r
 323     }\r
 324 \r
 325     Color[] newColours = new Color[24];\r
 326     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 327     {\r
 328       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 329       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 330     }\r
 331 \r
 332     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 333 \r
 334    if(ap!=null)\r
 335     {\r
 336       if (seqGroup != null)\r
 337       {\r
 338         seqGroup.cs = ucs;\r
 339       }\r
 340       else\r
 341       {\r
 342         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 343       }\r
 344       ap.repaint();\r
 345     }\r
 346     else if(pdbcanvas!=null)\r
 347     {\r
 348       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 349     }\r
 350 \r
 351     frame.setVisible(false);\r
 352   }\r
 353 \r
 354 \r
 355   protected Panel buttonPanel = new Panel();\r
 356   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();\r
 357   Panel okcancelPanel = new Panel();\r
 358   protected Button okButton = new Button();\r
 359   protected Button applyButton = new Button();\r
 360   protected Button cancelButton = new Button();\r
 361   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();\r
 362   Label label1 = new Label();\r
 363   protected TextField rText = new TextField();\r
 364   Label label4 = new Label();\r
 365   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();\r
 366   protected TextField gText = new TextField();\r
 367   Label label5 = new Label();\r
 368   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();\r
 369   protected TextField bText = new TextField();\r
 370   protected Panel target = new Panel();\r
 371 \r
 372   private void jbInit() throws Exception {\r
 373       this.setLayout(null);\r
 374       buttonPanel.setLayout(gridLayout);\r
 375       gridLayout.setColumns(6);\r
 376       gridLayout.setRows(4);\r
 377       okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 378       okButton.setLabel("OK");\r
 379       okButton.addActionListener(this);\r
 380       applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 381       applyButton.setLabel("Apply");\r
 382       applyButton.addActionListener(this);\r
 383       cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 384       cancelButton.setLabel("Cancel");\r
 385       cancelButton.addActionListener(this);\r
 386       this.setBackground(new Color(212, 208, 223));\r
 387       okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));\r
 388       buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));\r
 389       rScroller.setMaximum(256);\r
 390       rScroller.setMinimum(0);\r
 391       rScroller.setOrientation(0);\r
 392       rScroller.setUnitIncrement(1);\r
 393   rScroller.setVisibleAmount(1);\r
 394   rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));\r
 395   rScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 396   label1.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 397   label1.setText("R");\r
 398   label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));\r
 399   rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 400   rText.setText("0        ");\r
 401   rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));\r
 402   rText.addActionListener(this);\r
 403   label4.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 404   label4.setText("G");\r
 405   label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));\r
 406   gScroller.setMaximum(256);\r
 407       gScroller.setMinimum(0);\r
 408       gScroller.setOrientation(0);\r
 409       gScroller.setUnitIncrement(1);\r
 410   gScroller.setVisibleAmount(1);\r
 411   gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));\r
 412   gScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 413   gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 414   gText.setText("0        ");\r
 415   gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));\r
 416   gText.addActionListener(this);\r
 417   label5.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 418   label5.setText("B");\r
 419   label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));\r
 420   bScroller.setMaximum(256);\r
 421       bScroller.setMinimum(0);\r
 422       bScroller.setOrientation(0);\r
 423       bScroller.setUnitIncrement(1);\r
 424   bScroller.setVisibleAmount(1);\r
 425   bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));\r
 426   bScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 427   bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 428   bText.setText("0        ");\r
 429   bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));\r
 430   bText.addActionListener(this);\r
 431   target.setBackground(Color.black);\r
 432       target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));\r
 433       this.add(okcancelPanel, null);\r
 434       okcancelPanel.add(okButton, null);\r
 435       okcancelPanel.add(applyButton, null);\r
 436       okcancelPanel.add(cancelButton, null);\r
 437       this.add(buttonPanel, null);\r
 438   this.add(target, null);\r
 439   this.add(gScroller);\r
 440   this.add(rScroller);\r
 441   this.add(bScroller);\r
 442   this.add(label5);\r
 443   this.add(label4);\r
 444   this.add(label1);\r
 445   this.add(gText);\r
 446   this.add(rText);\r
 447   this.add(bText);\r
 448 }\r
 449 \r
 450 }\r