src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.schemes.*;\r
  29 \r
  30 public class UserDefinedColours\r
  31     extends Panel\r
  32 {\r
  33 \r
  34   AlignmentPanel ap;\r
  35   SequenceGroup seqGroup;\r
  36   Button selectedButton;\r
  37   Vector oldColours = new Vector();\r
  38   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  39   Frame frame;\r
  40   MCview.AppletPDBCanvas pdbcanvas;\r
  41 \r
  42   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  43 \r
  44   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  45   {\r
  46     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  47     return null;\r
  48   }\r
  49 \r
  50   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  51   {\r
  52     this.ap = ap;\r
  53     seqGroup = sg;\r
  54 \r
  55     if (seqGroup != null)\r
  56     {\r
  57       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  58     }\r
  59     else\r
  60     {\r
  61       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  62     }\r
  63 \r
  64     init();\r
  65   }\r
  66 \r
  67   public UserDefinedColours(MCview.AppletPDBCanvas pdb)\r
  68   {\r
  69     this.pdbcanvas = pdb;\r
  70     init();\r
  71   }\r
  72 \r
  73   void init()\r
  74   {\r
  75     try\r
  76     {\r
  77       jbInit();\r
  78     }\r
  79     catch (Exception e)\r
  80     {\r
  81       e.printStackTrace();\r
  82     }\r
  83     frame = new Frame();\r
  84     frame.add(this);\r
  85     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
  86 \r
  87     if (seqGroup != null)\r
  88     {\r
  89       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + seqGroup.getName() + ")");\r
  90     }\r
  91 \r
  92     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  93     {\r
  94       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  95                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  96     }\r
  97 \r
  98     makeButton("B", "B");\r
  99     makeButton("Z", "Z");\r
 100     makeButton("X", "X");\r
 101     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
 102 \r
 103     validate();\r
 104   }\r
 105   protected void rText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 106   {\r
 107     try\r
 108     {\r
 109       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
 110       rScroller.setValue(i);\r
 111       rScroller_adjustmentValueChanged(null);\r
 112     }\r
 113     catch (NumberFormatException ex)\r
 114     {}\r
 115   }\r
 116 \r
 117   protected void gText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 118   {\r
 119     try\r
 120     {\r
 121       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 122       gScroller.setValue(i);\r
 123       gScroller_adjustmentValueChanged(null);\r
 124     }\r
 125     catch (NumberFormatException ex)\r
 126     {}\r
 127 \r
 128   }\r
 129 \r
 130   protected void bText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 131   {\r
 132     try\r
 133     {\r
 134       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 135       bScroller.setValue(i);\r
 136       bScroller_adjustmentValueChanged(null);\r
 137     }\r
 138     catch (NumberFormatException ex)\r
 139     {}\r
 140 \r
 141   }\r
 142 \r
 143   protected void rScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 144   {\r
 145     R = rScroller.getValue();\r
 146     rText.setText(R + "");\r
 147     colourChanged();\r
 148   }\r
 149 \r
 150   protected void gScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 151   {\r
 152     G = gScroller.getValue();\r
 153     gText.setText(G + "");\r
 154     colourChanged();\r
 155   }\r
 156 \r
 157   protected void bScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 158   {\r
 159     B = bScroller.getValue();\r
 160     bText.setText(B + "");\r
 161     colourChanged();\r
 162   }\r
 163 \r
 164   public void colourChanged()\r
 165   {\r
 166     Color col = new Color(R, G, B);\r
 167     target.setBackground(col);\r
 168     target.repaint();\r
 169 \r
 170     if (selectedButton != null)\r
 171     {\r
 172       selectedButton.setBackground(col);\r
 173       selectedButton.repaint();\r
 174     }\r
 175   }\r
 176 \r
 177   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 178   {\r
 179     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 180     Color col = selectedButton.getBackground();\r
 181     R = col.getRed();\r
 182     G = col.getGreen();\r
 183     B = col.getBlue();\r
 184     rScroller.setValue(R);\r
 185     gScroller.setValue(G);\r
 186     bScroller.setValue(B);\r
 187     rText.setText(R + "");\r
 188     gText.setText(G + "");\r
 189     bText.setText(B + "");\r
 190 \r
 191     colourChanged();\r
 192   }\r
 193 \r
 194   void makeButton(String label, String aa)\r
 195   {\r
 196     final Button button = new Button();\r
 197     Color col = Color.white;\r
 198 \r
 199     try\r
 200     {\r
 201       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 202     }\r
 203     catch (Exception ex)\r
 204     {}\r
 205 \r
 206     button.setBackground(col);\r
 207     oldColours.addElement(col);\r
 208     button.setLabel(label);\r
 209     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 210     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 211     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 212     {\r
 213       public void mousePressed(MouseEvent e)\r
 214       {\r
 215         colourButtonPressed(e);\r
 216       }\r
 217     });\r
 218 \r
 219     buttonPanel.add(button, null);\r
 220   }\r
 221 \r
 222   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 223   {\r
 224     applyButton_actionPerformed(null);\r
 225     frame.setVisible(false);\r
 226   }\r
 227 \r
 228   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 229   {\r
 230     Color[] newColours = new Color[24];\r
 231     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 232     {\r
 233       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 234       newColours[i] = button.getBackground();\r
 235     }\r
 236 \r
 237     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 238     if(ap!=null)\r
 239       ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 240 \r
 241     if(ap!=null)\r
 242     {\r
 243       if (seqGroup != null)\r
 244       {\r
 245         seqGroup.cs = ucs;\r
 246       }\r
 247       else\r
 248       {\r
 249         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 250       }\r
 251       ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 252       ap.repaint();\r
 253     }\r
 254     else if(pdbcanvas!=null)\r
 255     {\r
 256       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 257       pdbcanvas.updateSeqColours();\r
 258     }\r
 259   }\r
 260 \r
 261 \r
 262   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 263   {\r
 264 \r
 265     Color[] newColours = new Color[24];\r
 266     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 267     {\r
 268       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 269       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 270     }\r
 271 \r
 272     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 273 \r
 274    if(ap!=null)\r
 275     {\r
 276       if (seqGroup != null)\r
 277       {\r
 278         seqGroup.cs = ucs;\r
 279       }\r
 280       else\r
 281       {\r
 282         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 283       }\r
 284       ap.repaint();\r
 285     }\r
 286     else if(pdbcanvas!=null)\r
 287     {\r
 288       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 289     }\r
 290 \r
 291     frame.setVisible(false);\r
 292   }\r
 293 \r
 294 \r
 295   protected Panel buttonPanel = new Panel();\r
 296   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();\r
 297   Panel jPanel2 = new Panel();\r
 298   protected Button okButton = new Button();\r
 299   protected Button applyButton = new Button();\r
 300   protected Button cancelButton = new Button();\r
 301   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();\r
 302   Label label1 = new Label();\r
 303   protected TextField rText = new TextField();\r
 304   Label label4 = new Label();\r
 305   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();\r
 306   protected TextField gText = new TextField();\r
 307   Label label5 = new Label();\r
 308   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();\r
 309   protected TextField bText = new TextField();\r
 310   protected Panel target = new Panel();\r
 311 \r
 312   private void jbInit() throws Exception {\r
 313       this.setLayout(null);\r
 314       buttonPanel.setLayout(gridLayout);\r
 315       gridLayout.setColumns(6);\r
 316       gridLayout.setRows(4);\r
 317       okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 318       okButton.setLabel("OK");\r
 319       okButton.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 320               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 321                   okButton_actionPerformed(e);\r
 322               }\r
 323           });\r
 324       applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 325       applyButton.setLabel("Apply");\r
 326       applyButton.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 327               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 328                   applyButton_actionPerformed(e);\r
 329               }\r
 330           });\r
 331       cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 332       cancelButton.setLabel("Cancel");\r
 333       cancelButton.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 334               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 335                   cancelButton_actionPerformed(e);\r
 336               }\r
 337           });\r
 338       this.setBackground(new Color(212, 208, 223));\r
 339       jPanel2.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));\r
 340       buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));\r
 341       rScroller.setMaximum(256);\r
 342       rScroller.setMinimum(0);\r
 343       rScroller.setOrientation(0);\r
 344       rScroller.setUnitIncrement(1);\r
 345   rScroller.setVisibleAmount(1);\r
 346   rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));\r
 347   rScroller.addAdjustmentListener(new java.awt.event.AdjustmentListener() {\r
 348               public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 349                   rScroller_adjustmentValueChanged(e);\r
 350               }\r
 351           });\r
 352   label1.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 353   label1.setText("R");\r
 354   label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));\r
 355   rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 356   rText.setText("0        ");\r
 357   rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));\r
 358   rText.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 359               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 360                   rText_actionPerformed(e);\r
 361               }\r
 362           });\r
 363   label4.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 364   label4.setText("G");\r
 365   label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));\r
 366   gScroller.setMaximum(256);\r
 367       gScroller.setMinimum(0);\r
 368       gScroller.setOrientation(0);\r
 369       gScroller.setUnitIncrement(1);\r
 370   gScroller.setVisibleAmount(1);\r
 371   gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));\r
 372   gScroller.addAdjustmentListener(new java.awt.event.AdjustmentListener() {\r
 373               public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 374                   gScroller_adjustmentValueChanged(e);\r
 375               }\r
 376           });\r
 377   gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 378   gText.setText("0        ");\r
 379   gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));\r
 380   gText.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 381               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 382                   gText_actionPerformed(e);\r
 383               }\r
 384           });\r
 385   label5.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 386   label5.setText("B");\r
 387   label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));\r
 388   bScroller.setMaximum(256);\r
 389       bScroller.setMinimum(0);\r
 390       bScroller.setOrientation(0);\r
 391       bScroller.setUnitIncrement(1);\r
 392   bScroller.setVisibleAmount(1);\r
 393   bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));\r
 394   bScroller.addAdjustmentListener(new java.awt.event.AdjustmentListener() {\r
 395               public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 396                   bScroller_adjustmentValueChanged(e);\r
 397               }\r
 398           });\r
 399   bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 400   bText.setText("0        ");\r
 401   bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));\r
 402   bText.addActionListener(new java.awt.event.ActionListener() {\r
 403               public void actionPerformed(ActionEvent e) {\r
 404                   bText_actionPerformed(e);\r
 405               }\r
 406           });\r
 407   target.setBackground(Color.black);\r
 408       target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));\r
 409       this.add(jPanel2, null);\r
 410       jPanel2.add(okButton, null);\r
 411       jPanel2.add(applyButton, null);\r
 412       jPanel2.add(cancelButton, null);\r
 413       this.add(buttonPanel, null);\r
 414   this.add(target, null);\r
 415   this.add(gScroller);\r
 416   this.add(rScroller);\r
 417   this.add(bScroller);\r
 418   this.add(label5);\r
 419   this.add(label4);\r
 420   this.add(label1);\r
 421   this.add(gText);\r
 422   this.add(rText);\r
 423   this.add(bText);\r
 424 }\r
 425 \r
 426 }\r