src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.schemes.*;\r
  29 \r
  30 public class UserDefinedColours\r
  31     extends Panel implements ActionListener, AdjustmentListener\r
  32 {\r
  33 \r
  34   AlignmentPanel ap;\r
  35   SequenceGroup seqGroup;\r
  36   Button selectedButton;\r
  37   Vector oldColours = new Vector();\r
  38   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  39   Frame frame;\r
  40   MCview.AppletPDBCanvas pdbcanvas;\r
  41 \r
  42   Component caller;\r
  43   String originalLabel;\r
  44   Color originalColour;\r
  45 \r
  46   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  47 \r
  48   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  49   {\r
  50     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  51     return null;\r
  52   }\r
  53 \r
  54   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  55   {\r
  56     this.ap = ap;\r
  57     seqGroup = sg;\r
  58 \r
  59     if (seqGroup != null)\r
  60     {\r
  61       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  62     }\r
  63     else\r
  64     {\r
  65       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  66     }\r
  67 \r
  68     init();\r
  69   }\r
  70 \r
  71   public UserDefinedColours(MCview.AppletPDBCanvas pdb)\r
  72   {\r
  73     this.pdbcanvas = pdb;\r
  74     init();\r
  75   }\r
  76 \r
  77   public UserDefinedColours(Component caller,\r
  78                             String label,\r
  79                             Color colour)\r
  80   {\r
  81     this.caller = caller;\r
  82     originalColour = colour;\r
  83     originalLabel = label;\r
  84     init();\r
  85     remove(buttonPanel);\r
  86 \r
  87     setTargetColour(colour);\r
  88 \r
  89     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 113, 400, 35));\r
  90     frame.setTitle("User Defined Colours - "+label);\r
  91     frame.setSize(420, 200);\r
  92   }\r
  93 \r
  94   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  95   {\r
  96     if(evt.getSource()==okButton)\r
  97      okButton_actionPerformed();\r
  98    else if(evt.getSource()==applyButton)\r
  99       applyButton_actionPerformed();\r
 100    else if(evt.getSource()==cancelButton)\r
 101      cancelButton_actionPerformed();\r
 102    else if(evt.getSource()==rText)\r
 103      rText_actionPerformed();\r
 104    else if (evt.getSource() == gText)\r
 105      gText_actionPerformed();\r
 106    else if (evt.getSource() == bText)\r
 107      bText_actionPerformed();\r
 108 }\r
 109 \r
 110   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 111   {\r
 112     if(evt.getSource()==rScroller)\r
 113     rScroller_adjustmentValueChanged();\r
 114   else if(evt.getSource()==gScroller)\r
 115     gScroller_adjustmentValueChanged();\r
 116   else if(evt.getSource()==bScroller)\r
 117     bScroller_adjustmentValueChanged();\r
 118 }\r
 119 \r
 120   void init()\r
 121   {\r
 122     try\r
 123     {\r
 124       jbInit();\r
 125     }\r
 126     catch (Exception e)\r
 127     {\r
 128       e.printStackTrace();\r
 129     }\r
 130     frame = new Frame();\r
 131     frame.add(this);\r
 132     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
 133 \r
 134     if (seqGroup != null)\r
 135     {\r
 136       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + seqGroup.getName() + ")");\r
 137     }\r
 138 \r
 139     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
 140     {\r
 141       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
 142                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
 143     }\r
 144 \r
 145     makeButton("B", "B");\r
 146     makeButton("Z", "Z");\r
 147     makeButton("X", "X");\r
 148     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
 149 \r
 150     validate();\r
 151   }\r
 152   protected void rText_actionPerformed()\r
 153   {\r
 154     try\r
 155     {\r
 156       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
 157       rScroller.setValue(i);\r
 158       rScroller_adjustmentValueChanged();\r
 159     }\r
 160     catch (NumberFormatException ex)\r
 161     {}\r
 162   }\r
 163 \r
 164   protected void gText_actionPerformed()\r
 165   {\r
 166     try\r
 167     {\r
 168       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 169       gScroller.setValue(i);\r
 170       gScroller_adjustmentValueChanged();\r
 171     }\r
 172     catch (NumberFormatException ex)\r
 173     {}\r
 174 \r
 175   }\r
 176 \r
 177   protected void bText_actionPerformed()\r
 178   {\r
 179     try\r
 180     {\r
 181       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 182       bScroller.setValue(i);\r
 183       bScroller_adjustmentValueChanged();\r
 184     }\r
 185     catch (NumberFormatException ex)\r
 186     {}\r
 187 \r
 188   }\r
 189 \r
 190   protected void rScroller_adjustmentValueChanged()\r
 191   {\r
 192     R = rScroller.getValue();\r
 193     rText.setText(R + "");\r
 194     colourChanged();\r
 195   }\r
 196 \r
 197   protected void gScroller_adjustmentValueChanged()\r
 198   {\r
 199     G = gScroller.getValue();\r
 200     gText.setText(G + "");\r
 201     colourChanged();\r
 202   }\r
 203 \r
 204   protected void bScroller_adjustmentValueChanged()\r
 205   {\r
 206     B = bScroller.getValue();\r
 207     bText.setText(B + "");\r
 208     colourChanged();\r
 209   }\r
 210 \r
 211   public void colourChanged()\r
 212   {\r
 213     Color col = new Color(R, G, B);\r
 214     target.setBackground(col);\r
 215     target.repaint();\r
 216 \r
 217     if (selectedButton != null)\r
 218     {\r
 219       selectedButton.setBackground(col);\r
 220       selectedButton.repaint();\r
 221     }\r
 222   }\r
 223 \r
 224   void setTargetColour(Color col)\r
 225   {\r
 226     R = col.getRed();\r
 227     G = col.getGreen();\r
 228     B = col.getBlue();\r
 229     rScroller.setValue(R);\r
 230     gScroller.setValue(G);\r
 231     bScroller.setValue(B);\r
 232     rText.setText(R + "");\r
 233     gText.setText(G + "");\r
 234     bText.setText(B + "");\r
 235     colourChanged();\r
 236   }\r
 237 \r
 238   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 239   {\r
 240     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 241     setTargetColour(selectedButton.getBackground());\r
 242   }\r
 243 \r
 244   void makeButton(String label, String aa)\r
 245   {\r
 246     final Button button = new Button();\r
 247     Color col = Color.white;\r
 248 \r
 249     try\r
 250     {\r
 251       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 252     }\r
 253     catch (Exception ex)\r
 254     {}\r
 255 \r
 256     button.setBackground(col);\r
 257     oldColours.addElement(col);\r
 258     button.setLabel(label);\r
 259     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 260     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 261     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 262     {\r
 263       public void mousePressed(MouseEvent e)\r
 264       {\r
 265         colourButtonPressed(e);\r
 266       }\r
 267     });\r
 268 \r
 269     buttonPanel.add(button, null);\r
 270   }\r
 271 \r
 272   protected void okButton_actionPerformed()\r
 273   {\r
 274     applyButton_actionPerformed();\r
 275     frame.setVisible(false);\r
 276   }\r
 277 \r
 278   protected void applyButton_actionPerformed()\r
 279   {\r
 280     if (caller != null)\r
 281     {\r
 282       if(caller instanceof FeatureSettings)\r
 283         ((FeatureSettings)caller).setUserColour\r
 284             (originalLabel, new Color(R,G,B));\r
 285       else if(caller instanceof AnnotationColourChooser)\r
 286       {\r
 287         if (originalLabel.equals("Min Colour"))\r
 288           ( (AnnotationColourChooser) caller).minColour_actionPerformed\r
 289               (new Color(R, G, B));\r
 290         else\r
 291           ( (AnnotationColourChooser) caller).maxColour_actionPerformed\r
 292               (new Color(R, G, B));\r
 293       }\r
 294       return;\r
 295     }\r
 296 \r
 297 \r
 298     Color[] newColours = new Color[24];\r
 299     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 300     {\r
 301       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 302       newColours[i] = button.getBackground();\r
 303     }\r
 304 \r
 305     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 306     if(ap!=null)\r
 307       ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 308 \r
 309     if(ap!=null)\r
 310     {\r
 311       if (seqGroup != null)\r
 312       {\r
 313         seqGroup.cs = ucs;\r
 314       }\r
 315       else\r
 316       {\r
 317         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 318       }\r
 319       ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 320       ap.repaint();\r
 321     }\r
 322     else if(pdbcanvas!=null)\r
 323     {\r
 324       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 325       pdbcanvas.updateSeqColours();\r
 326     }\r
 327   }\r
 328 \r
 329 \r
 330   protected void cancelButton_actionPerformed()\r
 331   {\r
 332     if (caller != null)\r
 333     {\r
 334       if(caller instanceof FeatureSettings)\r
 335         ((FeatureSettings)caller).setUserColour\r
 336             (originalLabel, originalColour);\r
 337       else if (caller instanceof AnnotationColourChooser)\r
 338       {\r
 339         if (originalLabel.equals("Min Colour"))\r
 340           ( (AnnotationColourChooser) caller).minColour_actionPerformed\r
 341               (originalColour);\r
 342         else\r
 343           ( (AnnotationColourChooser) caller).maxColour_actionPerformed\r
 344               (originalColour);\r
 345       }\r
 346       frame.setVisible(false);\r
 347       return;\r
 348     }\r
 349 \r
 350     Color[] newColours = new Color[24];\r
 351     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 352     {\r
 353       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 354       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 355     }\r
 356 \r
 357     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 358 \r
 359    if(ap!=null)\r
 360     {\r
 361       if (seqGroup != null)\r
 362       {\r
 363         seqGroup.cs = ucs;\r
 364       }\r
 365       else\r
 366       {\r
 367         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 368       }\r
 369       ap.repaint();\r
 370     }\r
 371     else if(pdbcanvas!=null)\r
 372     {\r
 373       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 374     }\r
 375 \r
 376     frame.setVisible(false);\r
 377   }\r
 378 \r
 379 \r
 380   protected Panel buttonPanel = new Panel();\r
 381   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();\r
 382   Panel okcancelPanel = new Panel();\r
 383   protected Button okButton = new Button();\r
 384   protected Button applyButton = new Button();\r
 385   protected Button cancelButton = new Button();\r
 386   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();\r
 387   Label label1 = new Label();\r
 388   protected TextField rText = new TextField();\r
 389   Label label4 = new Label();\r
 390   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();\r
 391   protected TextField gText = new TextField();\r
 392   Label label5 = new Label();\r
 393   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();\r
 394   protected TextField bText = new TextField();\r
 395   protected Panel target = new Panel();\r
 396 \r
 397   private void jbInit() throws Exception {\r
 398       this.setLayout(null);\r
 399       buttonPanel.setLayout(gridLayout);\r
 400       gridLayout.setColumns(6);\r
 401       gridLayout.setRows(4);\r
 402       okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 403       okButton.setLabel("OK");\r
 404       okButton.addActionListener(this);\r
 405       applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 406       applyButton.setLabel("Apply");\r
 407       applyButton.addActionListener(this);\r
 408       cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 409       cancelButton.setLabel("Cancel");\r
 410       cancelButton.addActionListener(this);\r
 411       this.setBackground(new Color(212, 208, 223));\r
 412       okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));\r
 413       buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));\r
 414       rScroller.setMaximum(256);\r
 415       rScroller.setMinimum(0);\r
 416       rScroller.setOrientation(0);\r
 417       rScroller.setUnitIncrement(1);\r
 418   rScroller.setVisibleAmount(1);\r
 419   rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));\r
 420   rScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 421   label1.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 422   label1.setText("R");\r
 423   label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));\r
 424   rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 425   rText.setText("0        ");\r
 426   rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));\r
 427   rText.addActionListener(this);\r
 428   label4.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 429   label4.setText("G");\r
 430   label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));\r
 431   gScroller.setMaximum(256);\r
 432       gScroller.setMinimum(0);\r
 433       gScroller.setOrientation(0);\r
 434       gScroller.setUnitIncrement(1);\r
 435   gScroller.setVisibleAmount(1);\r
 436   gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));\r
 437   gScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 438   gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 439   gText.setText("0        ");\r
 440   gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));\r
 441   gText.addActionListener(this);\r
 442   label5.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 443   label5.setText("B");\r
 444   label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));\r
 445   bScroller.setMaximum(256);\r
 446       bScroller.setMinimum(0);\r
 447       bScroller.setOrientation(0);\r
 448       bScroller.setUnitIncrement(1);\r
 449   bScroller.setVisibleAmount(1);\r
 450   bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));\r
 451   bScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 452   bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 453   bText.setText("0        ");\r
 454   bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));\r
 455   bText.addActionListener(this);\r
 456   target.setBackground(Color.black);\r
 457       target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));\r
 458       this.add(okcancelPanel, null);\r
 459       okcancelPanel.add(okButton, null);\r
 460       okcancelPanel.add(applyButton, null);\r
 461       okcancelPanel.add(cancelButton, null);\r
 462       this.add(buttonPanel, null);\r
 463   this.add(target, null);\r
 464   this.add(gScroller);\r
 465   this.add(rScroller);\r
 466   this.add(bScroller);\r
 467   this.add(label5);\r
 468   this.add(label4);\r
 469   this.add(label1);\r
 470   this.add(gText);\r
 471   this.add(rText);\r
 472   this.add(bText);\r
 473 }\r
 474 \r
 475 }\r