src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.jbappletgui.*;\r
  29 import jalview.schemes.*;\r
  30 \r
  31 public class UserDefinedColours\r
  32     extends GUserDefinedColours\r
  33 {\r
  34 \r
  35   AlignmentPanel ap;\r
  36   SequenceGroup seqGroup;\r
  37   Button selectedButton;\r
  38   Vector oldColours = new Vector();\r
  39   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  40   Frame frame;\r
  41 \r
  42   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  43 \r
  44   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  45   {\r
  46     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  47     return null;\r
  48   }\r
  49 \r
  50   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  51   {\r
  52     super();\r
  53     frame = new Frame();\r
  54     frame.add(this);\r
  55     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
  56 \r
  57     if (sg != null)\r
  58     {\r
  59       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + sg.getName() + ")");\r
  60     }\r
  61 \r
  62     this.ap = ap;\r
  63     seqGroup = sg;\r
  64 \r
  65     if (seqGroup != null)\r
  66     {\r
  67       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  68     }\r
  69     else\r
  70     {\r
  71       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  72     }\r
  73 \r
  74     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  75     {\r
  76       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  77                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  78     }\r
  79 \r
  80     makeButton("B", "B");\r
  81     makeButton("Z", "Z");\r
  82     makeButton("X", "X");\r
  83     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
  84 \r
  85     validate();\r
  86 \r
  87   }\r
  88 \r
  89   protected void rText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
  90   {\r
  91     try\r
  92     {\r
  93       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
  94       rScroller.setValue(i);\r
  95     }\r
  96     catch (NumberFormatException ex)\r
  97     {}\r
  98   }\r
  99 \r
 100   protected void gText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 101   {\r
 102     try\r
 103     {\r
 104       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 105       gScroller.setValue(i);\r
 106     }\r
 107     catch (NumberFormatException ex)\r
 108     {}\r
 109 \r
 110   }\r
 111 \r
 112   protected void bText_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 113   {\r
 114     try\r
 115     {\r
 116       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 117       bScroller.setValue(i);\r
 118     }\r
 119     catch (NumberFormatException ex)\r
 120     {}\r
 121 \r
 122   }\r
 123 \r
 124   protected void rScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 125   {\r
 126     R = rScroller.getValue();\r
 127     rText.setText(R + "");\r
 128     colourChanged();\r
 129   }\r
 130 \r
 131   protected void gScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 132   {\r
 133     G = gScroller.getValue();\r
 134     gText.setText(G + "");\r
 135     colourChanged();\r
 136   }\r
 137 \r
 138   protected void bScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e)\r
 139   {\r
 140     B = bScroller.getValue();\r
 141     bText.setText(B + "");\r
 142     colourChanged();\r
 143   }\r
 144 \r
 145   public void colourChanged()\r
 146   {\r
 147     Color col = new Color(R, G, B);\r
 148     target.setBackground(col);\r
 149 \r
 150     if (selectedButton != null)\r
 151     {\r
 152       selectedButton.setBackground(col);\r
 153     }\r
 154   }\r
 155 \r
 156   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 157   {\r
 158     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 159     Color col = selectedButton.getBackground();\r
 160     R = col.getRed();\r
 161     G = col.getGreen();\r
 162     B = col.getBlue();\r
 163     rScroller.setValue(R);\r
 164     gScroller.setValue(G);\r
 165     bScroller.setValue(B);\r
 166     rText.setText(R + "");\r
 167     gText.setText(G + "");\r
 168     bText.setText(B + "");\r
 169 \r
 170     colourChanged();\r
 171   }\r
 172 \r
 173   void makeButton(String label, String aa)\r
 174   {\r
 175     final Button button = new Button();\r
 176     Color col = Color.white;\r
 177 \r
 178     try\r
 179     {\r
 180       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 181     }\r
 182     catch (Exception ex)\r
 183     {}\r
 184 \r
 185     button.setBackground(col);\r
 186     oldColours.addElement(col);\r
 187     button.setLabel(label);\r
 188     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 189     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 190     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 191     {\r
 192       public void mousePressed(MouseEvent e)\r
 193       {\r
 194         colourButtonPressed(e);\r
 195       }\r
 196     });\r
 197 \r
 198     buttonPanel.add(button, null);\r
 199   }\r
 200 \r
 201   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 202   {\r
 203     applyButton_actionPerformed(null);\r
 204     frame.setVisible(false);\r
 205   }\r
 206 \r
 207   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 208   {\r
 209 \r
 210     Color[] newColours = new Color[24];\r
 211     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 212     {\r
 213       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 214       newColours[i] = button.getBackground();\r
 215     }\r
 216 \r
 217     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 218     ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 219 \r
 220     if (seqGroup != null)\r
 221     {\r
 222       seqGroup.cs = ucs;\r
 223     }\r
 224     else\r
 225     {\r
 226       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 227     }\r
 228 \r
 229     ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 230     ap.repaint();\r
 231   }\r
 232 \r
 233 \r
 234   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 235   {\r
 236 \r
 237     Color[] newColours = new Color[24];\r
 238     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 239     {\r
 240       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 241       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 242     }\r
 243 \r
 244     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 245 \r
 246     if (seqGroup != null)\r
 247     {\r
 248       seqGroup.cs = ucs;\r
 249     }\r
 250     else\r
 251     {\r
 252       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 253     }\r
 254 \r
 255     ap.repaint();\r
 256 \r
 257     frame.setVisible(false);\r
 258   }\r
 259 \r
 260 }\r