src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.schemes.*;\r
  29 \r
  30 public class UserDefinedColours\r
  31     extends Panel implements ActionListener, AdjustmentListener\r
  32 {\r
  33 \r
  34   AlignmentPanel ap;\r
  35   SequenceGroup seqGroup;\r
  36   Button selectedButton;\r
  37   Vector oldColours = new Vector();\r
  38   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  39   Frame frame;\r
  40   MCview.AppletPDBCanvas pdbcanvas;\r
  41 \r
  42   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  43 \r
  44   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  45   {\r
  46     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  47     return null;\r
  48   }\r
  49 \r
  50   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  51   {\r
  52     this.ap = ap;\r
  53     seqGroup = sg;\r
  54 \r
  55     if (seqGroup != null)\r
  56     {\r
  57       oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  58     }\r
  59     else\r
  60     {\r
  61       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  62     }\r
  63 \r
  64     init();\r
  65   }\r
  66 \r
  67   public UserDefinedColours(MCview.AppletPDBCanvas pdb)\r
  68   {\r
  69     this.pdbcanvas = pdb;\r
  70     init();\r
  71   }\r
  72 \r
  73   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  74   {\r
  75     if(evt.getSource()==okButton)\r
  76      okButton_actionPerformed();\r
  77    else if(evt.getSource()==applyButton)\r
  78       applyButton_actionPerformed();\r
  79    else if(evt.getSource()==cancelButton)\r
  80      cancelButton_actionPerformed();\r
  81    else if(evt.getSource()==rText)\r
  82      rText_actionPerformed();\r
  83    else if (evt.getSource() == gText)\r
  84      gText_actionPerformed();\r
  85    else if (evt.getSource() == bText)\r
  86      bText_actionPerformed();\r
  87 }\r
  88 \r
  89   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
  90   {\r
  91     if(evt.getSource()==rScroller)\r
  92     rScroller_adjustmentValueChanged();\r
  93   else if(evt.getSource()==gScroller)\r
  94     gScroller_adjustmentValueChanged();\r
  95   else if(evt.getSource()==bScroller)\r
  96     bScroller_adjustmentValueChanged();\r
  97 }\r
  98 \r
  99   void init()\r
 100   {\r
 101     try\r
 102     {\r
 103       jbInit();\r
 104     }\r
 105     catch (Exception e)\r
 106     {\r
 107       e.printStackTrace();\r
 108     }\r
 109     frame = new Frame();\r
 110     frame.add(this);\r
 111     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);\r
 112 \r
 113     if (seqGroup != null)\r
 114     {\r
 115       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + seqGroup.getName() + ")");\r
 116     }\r
 117 \r
 118     for (int i = 0; i < 20; i++)\r
 119     {\r
 120       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
 121                  "", ResidueProperties.aa[i]);\r
 122     }\r
 123 \r
 124     makeButton("B", "B");\r
 125     makeButton("Z", "Z");\r
 126     makeButton("X", "X");\r
 127     makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
 128 \r
 129     validate();\r
 130   }\r
 131   protected void rText_actionPerformed()\r
 132   {\r
 133     try\r
 134     {\r
 135       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
 136       rScroller.setValue(i);\r
 137       rScroller_adjustmentValueChanged();\r
 138     }\r
 139     catch (NumberFormatException ex)\r
 140     {}\r
 141   }\r
 142 \r
 143   protected void gText_actionPerformed()\r
 144   {\r
 145     try\r
 146     {\r
 147       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
 148       gScroller.setValue(i);\r
 149       gScroller_adjustmentValueChanged();\r
 150     }\r
 151     catch (NumberFormatException ex)\r
 152     {}\r
 153 \r
 154   }\r
 155 \r
 156   protected void bText_actionPerformed()\r
 157   {\r
 158     try\r
 159     {\r
 160       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
 161       bScroller.setValue(i);\r
 162       bScroller_adjustmentValueChanged();\r
 163     }\r
 164     catch (NumberFormatException ex)\r
 165     {}\r
 166 \r
 167   }\r
 168 \r
 169   protected void rScroller_adjustmentValueChanged()\r
 170   {\r
 171     R = rScroller.getValue();\r
 172     rText.setText(R + "");\r
 173     colourChanged();\r
 174   }\r
 175 \r
 176   protected void gScroller_adjustmentValueChanged()\r
 177   {\r
 178     G = gScroller.getValue();\r
 179     gText.setText(G + "");\r
 180     colourChanged();\r
 181   }\r
 182 \r
 183   protected void bScroller_adjustmentValueChanged()\r
 184   {\r
 185     B = bScroller.getValue();\r
 186     bText.setText(B + "");\r
 187     colourChanged();\r
 188   }\r
 189 \r
 190   public void colourChanged()\r
 191   {\r
 192     Color col = new Color(R, G, B);\r
 193     target.setBackground(col);\r
 194     target.repaint();\r
 195 \r
 196     if (selectedButton != null)\r
 197     {\r
 198       selectedButton.setBackground(col);\r
 199       selectedButton.repaint();\r
 200     }\r
 201   }\r
 202 \r
 203   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 204   {\r
 205     selectedButton = (Button) e.getSource();\r
 206     Color col = selectedButton.getBackground();\r
 207     R = col.getRed();\r
 208     G = col.getGreen();\r
 209     B = col.getBlue();\r
 210     rScroller.setValue(R);\r
 211     gScroller.setValue(G);\r
 212     bScroller.setValue(B);\r
 213     rText.setText(R + "");\r
 214     gText.setText(G + "");\r
 215     bText.setText(B + "");\r
 216 \r
 217     colourChanged();\r
 218   }\r
 219 \r
 220   void makeButton(String label, String aa)\r
 221   {\r
 222     final Button button = new Button();\r
 223     Color col = Color.white;\r
 224 \r
 225     try\r
 226     {\r
 227       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 228     }\r
 229     catch (Exception ex)\r
 230     {}\r
 231 \r
 232     button.setBackground(col);\r
 233     oldColours.addElement(col);\r
 234     button.setLabel(label);\r
 235     button.setForeground(col.darker().darker().darker());\r
 236     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 237     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 238     {\r
 239       public void mousePressed(MouseEvent e)\r
 240       {\r
 241         colourButtonPressed(e);\r
 242       }\r
 243     });\r
 244 \r
 245     buttonPanel.add(button, null);\r
 246   }\r
 247 \r
 248   protected void okButton_actionPerformed()\r
 249   {\r
 250     applyButton_actionPerformed();\r
 251     frame.setVisible(false);\r
 252   }\r
 253 \r
 254   protected void applyButton_actionPerformed()\r
 255   {\r
 256     Color[] newColours = new Color[24];\r
 257     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 258     {\r
 259       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);\r
 260       newColours[i] = button.getBackground();\r
 261     }\r
 262 \r
 263     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 264     if(ap!=null)\r
 265       ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 266 \r
 267     if(ap!=null)\r
 268     {\r
 269       if (seqGroup != null)\r
 270       {\r
 271         seqGroup.cs = ucs;\r
 272       }\r
 273       else\r
 274       {\r
 275         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 276       }\r
 277       ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 278       ap.repaint();\r
 279     }\r
 280     else if(pdbcanvas!=null)\r
 281     {\r
 282       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 283       pdbcanvas.updateSeqColours();\r
 284     }\r
 285   }\r
 286 \r
 287 \r
 288   protected void cancelButton_actionPerformed()\r
 289   {\r
 290 \r
 291     Color[] newColours = new Color[24];\r
 292     for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 293     {\r
 294       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);\r
 295       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 296     }\r
 297 \r
 298     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 299 \r
 300    if(ap!=null)\r
 301     {\r
 302       if (seqGroup != null)\r
 303       {\r
 304         seqGroup.cs = ucs;\r
 305       }\r
 306       else\r
 307       {\r
 308         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 309       }\r
 310       ap.repaint();\r
 311     }\r
 312     else if(pdbcanvas!=null)\r
 313     {\r
 314       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);\r
 315     }\r
 316 \r
 317     frame.setVisible(false);\r
 318   }\r
 319 \r
 320 \r
 321   protected Panel buttonPanel = new Panel();\r
 322   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();\r
 323   Panel jPanel2 = new Panel();\r
 324   protected Button okButton = new Button();\r
 325   protected Button applyButton = new Button();\r
 326   protected Button cancelButton = new Button();\r
 327   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();\r
 328   Label label1 = new Label();\r
 329   protected TextField rText = new TextField();\r
 330   Label label4 = new Label();\r
 331   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();\r
 332   protected TextField gText = new TextField();\r
 333   Label label5 = new Label();\r
 334   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();\r
 335   protected TextField bText = new TextField();\r
 336   protected Panel target = new Panel();\r
 337 \r
 338   private void jbInit() throws Exception {\r
 339       this.setLayout(null);\r
 340       buttonPanel.setLayout(gridLayout);\r
 341       gridLayout.setColumns(6);\r
 342       gridLayout.setRows(4);\r
 343       okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 344       okButton.setLabel("OK");\r
 345       okButton.addActionListener(this);\r
 346       applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 347       applyButton.setLabel("Apply");\r
 348       applyButton.addActionListener(this);\r
 349       cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 350       cancelButton.setLabel("Cancel");\r
 351       cancelButton.addActionListener(this);\r
 352       this.setBackground(new Color(212, 208, 223));\r
 353       jPanel2.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));\r
 354       buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));\r
 355       rScroller.setMaximum(256);\r
 356       rScroller.setMinimum(0);\r
 357       rScroller.setOrientation(0);\r
 358       rScroller.setUnitIncrement(1);\r
 359   rScroller.setVisibleAmount(1);\r
 360   rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));\r
 361   rScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 362   label1.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 363   label1.setText("R");\r
 364   label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));\r
 365   rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 366   rText.setText("0        ");\r
 367   rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));\r
 368   rText.addActionListener(this);\r
 369   label4.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 370   label4.setText("G");\r
 371   label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));\r
 372   gScroller.setMaximum(256);\r
 373       gScroller.setMinimum(0);\r
 374       gScroller.setOrientation(0);\r
 375       gScroller.setUnitIncrement(1);\r
 376   gScroller.setVisibleAmount(1);\r
 377   gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));\r
 378   gScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 379   gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 380   gText.setText("0        ");\r
 381   gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));\r
 382   gText.addActionListener(this);\r
 383   label5.setAlignment(Label.RIGHT);\r
 384   label5.setText("B");\r
 385   label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));\r
 386   bScroller.setMaximum(256);\r
 387       bScroller.setMinimum(0);\r
 388       bScroller.setOrientation(0);\r
 389       bScroller.setUnitIncrement(1);\r
 390   bScroller.setVisibleAmount(1);\r
 391   bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));\r
 392   bScroller.addAdjustmentListener(this);\r
 393   bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));\r
 394   bText.setText("0        ");\r
 395   bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));\r
 396   bText.addActionListener(this);\r
 397   target.setBackground(Color.black);\r
 398       target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));\r
 399       this.add(jPanel2, null);\r
 400       jPanel2.add(okButton, null);\r
 401       jPanel2.add(applyButton, null);\r
 402       jPanel2.add(cancelButton, null);\r
 403       this.add(buttonPanel, null);\r
 404   this.add(target, null);\r
 405   this.add(gScroller);\r
 406   this.add(rScroller);\r
 407   this.add(bScroller);\r
 408   this.add(label5);\r
 409   this.add(label4);\r
 410   this.add(label1);\r
 411   this.add(gText);\r
 412   this.add(rText);\r
 413   this.add(bText);\r
 414 }\r
 415 \r
 416 }\r