src/jalview/bin/Cache.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.bin;\r
  20 \r
  21 import java.io.*;\r
  22 \r
  23 import java.util.*;\r
  24 \r
  25 import java.net.*;\r
  26 \r
  27 \r
  28 /**\r
  29  * Stores and retrieves Jalview Application Properties\r
  30  * <br><br>Current properties include:\r
  31  * <br>logs.Axis.Level - one of the stringified Levels for log4j controlling the logging level for axis (used for web services)\r
  32  * <br>logs.Castor.Level - one of the stringified Levels for log4j controlling the logging level for castor (used for serialization)\r
  33  * <br>jalview.browser - used in the jalview.utils.browserLauncher class if it doesn't know what else to do.\r
  34  * <br>SCREEN_WIDTH,SCREEN_HEIGHT,SCREEN_Y=285,SCREEN_X=371,SHOW_FULLSCREEN\r
  35  * FONT_NAME,FONT_SIZE,FONT_STYLE,GAP_SYMBOL,LAST_DIRECTORY,USER_DEFINED_COLOUR\r
  36  * SHOW_FULL_ID,SHOW_IDENTITY,SHOW_QUALITY,SHOW_ANNOTATIONS,SHOW_CONSERVATION,\r
  37  * DEFAULT_COLOUR,DEFAULT_FILE_FORMAT,STARTUP_FILE,SHOW_STARTUP_FILE\r
  38 \r
  39  * @author $author$\r
  40  * @version $Revision$\r
  41  */\r
  42 public class Cache\r
  43 {\r
  44 \r
  45     /** Jalview Properties */\r
  46     public static Properties applicationProperties;\r
  47 \r
  48     /** Default file is  ~/.jalview_properties */\r
  49     static String propertiesFile;\r
  50 \r
  51     /** Called when Jalview is started */\r
  52     public static void loadProperties(String propsFile)\r
  53     {\r
  54         applicationProperties = new Properties();\r
  55         propertiesFile = propsFile;\r
  56         if (propsFile == null)\r
  57         {\r
  58           propertiesFile = System.getProperty("user.home") + "/.jalview_properties";\r
  59         }\r
  60 \r
  61         try\r
  62         {\r
  63             FileInputStream fis = new FileInputStream(propertiesFile);\r
  64             applicationProperties.load(fis);\r
  65             applicationProperties.remove("LATEST_VERSION");\r
  66             applicationProperties.remove("VERSION");\r
  67             fis.close();\r
  68         }\r
  69         catch (Exception ex)\r
  70         {\r
  71           System.out.println("Error reading properties file: "+ex);\r
  72         }\r
  73 \r
  74         // FIND THE VERSION NUMBER AND BUILD DATE FROM jalview.jar\r
  75         // MUST FOLLOW READING OF LOCAL PROPERTIES FILE AS THE\r
  76         // VERSION MAY HAVE CHANGED SINCE LAST USING JALVIEW\r
  77          try\r
  78          {\r
  79              String buildDetails = "jar:"\r
  80                  .concat(\r
  81                  Cache.class.getProtectionDomain().getCodeSource().getLocation().toString()\r
  82                  .concat("!/.build_properties")\r
  83                  );\r
  84 \r
  85              java.net.URL localJarFileURL = new java.net.URL(buildDetails);\r
  86 \r
  87             InputStream in = localJarFileURL.openStream();\r
  88             applicationProperties.load(in);\r
  89             in.close();\r
  90          }\r
  91          catch (Exception ex)\r
  92          {\r
  93            System.out.println("Error reading build details: "+ex);\r
  94            applicationProperties.remove("VERSION");\r
  95         }\r
  96 \r
  97         String jnlpVersion = System.getProperty("jalview.version");\r
  98         String codeVersion = getProperty("VERSION");\r
  99 \r
 100 \r
 101         if(codeVersion==null)\r
 102         {\r
 103           // THIS SHOULD ONLY BE THE CASE WHEN TESTING!!\r
 104           codeVersion = "Test";\r
 105           jnlpVersion = "Test";\r
 106         }\r
 107 \r
 108 \r
 109         System.out.println("Version: "+codeVersion);\r
 110 \r
 111         // jnlpVersion will be null if we're using InstallAnywhere\r
 112         // Dont do this check if running in headless mode\r
 113         if(jnlpVersion==null && (\r
 114                 System.getProperty("java.awt.headless")==null\r
 115              || System.getProperty("java.awt.headless").equals("false")))\r
 116         {\r
 117           try{\r
 118             java.net.URL url = new java.net.URL("http://www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp");\r
 119             BufferedReader in = new BufferedReader(new InputStreamReader(url.openStream()));\r
 120             String line = null;\r
 121             while( (line = in.readLine()) !=null)\r
 122             {\r
 123               if(line.indexOf("jalview.version")==-1)\r
 124                 continue;\r
 125 \r
 126               line = line.substring(line.indexOf("value=")+7);\r
 127               line = line.substring(0, line.lastIndexOf("\""));\r
 128               jnlpVersion = line;\r
 129               break;\r
 130             }\r
 131           }catch(Exception ex)\r
 132           {  jnlpVersion =  codeVersion; }\r
 133 \r
 134           System.out.println("Latest : "+jnlpVersion);\r
 135         }\r
 136 \r
 137         setProperty("LATEST_VERSION", jnlpVersion);\r
 138         setProperty("VERSION", codeVersion);\r
 139     }\r
 140 \r
 141     /**\r
 142      * Gets Jalview application property of given key. Returns null\r
 143      * if key not found\r
 144      *\r
 145      * @param key Name of property\r
 146      *\r
 147      * @return Property value\r
 148      */\r
 149     public static String getProperty(String key)\r
 150     {\r
 151         return applicationProperties.getProperty(key);\r
 152     }\r
 153 \r
 154     /**\r
 155      * Stores property in the file "HOME_DIR/.jalview_properties"\r
 156      *\r
 157      * @param key Name of object\r
 158      * @param obj String value of property\r
 159      *\r
 160      * @return String value of property\r
 161      */\r
 162     public static String setProperty(String key, String obj)\r
 163     {\r
 164         try\r
 165         {\r
 166             FileOutputStream out = new FileOutputStream(propertiesFile);\r
 167 \r
 168             applicationProperties.setProperty(key, obj);\r
 169 \r
 170             applicationProperties.store(out, "---JalviewX Properties File---");\r
 171             out.close();\r
 172         }\r
 173         catch (Exception ex)\r
 174         {\r
 175         }\r
 176 \r
 177         return obj;\r
 178     }\r
 179 }\r