src/jalview/bin/Jalview.java

   1 /********************\r
   2  * 2004 Jalview Reengineered\r
   3  * Barton Group\r
   4  * Dundee University\r
   5  *\r
   6  * AM Waterhouse\r
   7  *******************/\r
   8 \r
   9 \r
  10 package jalview.bin;\r
  11 \r
  12 import jalview.gui.*;\r
  13 import javax.swing.*;\r
  14 import java.awt.event.*;\r
  15 import jalview.io.*;\r
  16 \r
  17 import org.apache.log4j.*;\r
  18 \r
  19 public class Jalview extends JApplet\r
  20 {\r
  21   public static JApplet applet;\r
  22   Desktop frame;\r
  23   public void init()\r
  24   {\r
  25     applet = this;\r
  26     Cache.loadProperties();\r
  27 \r
  28     frame = new Desktop();\r
  29     frame.setResizable(true);\r
  30     frame.setVisible(true);\r
  31     frame.setDefaultCloseOperation(JFrame.DO_NOTHING_ON_CLOSE);\r
  32     frame.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
  33     {\r
  34       public void windowClosing(WindowEvent e)\r
  35       {\r
  36           applet.stop();\r
  37           applet.destroy();\r
  38       }\r
  39     });\r
  40 \r
  41     String file = getParameter("alignment");\r
  42 \r
  43     if(file!=null)\r
  44     {\r
  45       jalview.bin.Cache.setProperty("LAST_DIRECTORY", file);\r
  46       String protocol = "File";\r
  47       if (file.indexOf("http:") > -1)\r
  48         protocol = "URL";\r
  49 \r
  50       String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify(file, protocol);\r
  51 \r
  52       frame.LoadFile(file, protocol, format);\r
  53     }\r
  54   }\r
  55 \r
  56   public void destroy()\r
  57   {\r
  58     if(applet!=null)\r
  59       applet.stop();\r
  60     else\r
  61       System.exit(0);\r
  62     frame.setVisible(false);\r
  63   }\r
  64 \r
  65   private static void initLogger() {\r
  66     Logger l = Logger.getLogger("org.apache.axis");\r
  67     if (Cache.getProperty("logs.Axis.Level")==null) {\r
  68       Cache.setProperty("logs.Axis.Level", Level.INFO.toString());\r
  69     }\r
  70 \r
  71     l.setLevel(Level.toLevel(Cache.getProperty("logs.Axis.Level")));\r
  72     ConsoleAppender ap = new ConsoleAppender(new SimpleLayout(),"System.err");\r
  73     ap.setName("Axis");\r
  74     l.addAppender(ap);\r
  75   }\r
  76    public static void main(String[] args) {\r
  77 \r
  78     Cache.loadProperties();\r
  79     try {\r
  80       initLogger();\r
  81     } catch (Exception e) {\r
  82       System.out.println("Problems initializing the log4j system\n"+e);\r
  83     }\r
  84     try{\r
  85        UIManager.setLookAndFeel(\r
  86    //   "javax.swing.plaf.metal.MetalLookAndFeel"\r
  87     //  "javax.swing.plaf.multi.MultiLookAndFeel"\r
  88          UIManager.getSystemLookAndFeelClassName()\r
  89      //    UIManager.getCrossPlatformLookAndFeelClassName()\r
  90        // "com.sun.java.swing.plaf.gtk.GTKLookAndFeel"\r
  91        //   "com.sun.java.swing.plaf.windows.WindowsLookAndFeel"\r
  92        //  "com.sun.java.swing.plaf.motif.MotifLookAndFeel"\r
  93      );\r
  94      }\r
  95      catch (Exception ex)\r
  96      {}\r
  97 \r
  98      Desktop frame = new Desktop();\r
  99      frame.setResizable(true);\r
 100      frame.setVisible(true);\r
 101 \r
 102 \r
 103 \r
 104      if(args!=null && args.length>0)\r
 105      {\r
 106          String file=null;\r
 107          if(args[0].equals("-open"))\r
 108            file = args[1];\r
 109          else\r
 110            file = args[0];\r
 111 \r
 112          String protocol = "File";\r
 113          if(file.indexOf("http:")>-1)\r
 114            protocol = "URL";\r
 115 \r
 116          String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify(file, protocol);\r
 117 \r
 118          frame.LoadFile(file, protocol, format);\r
 119      }\r
 120 \r
 121    }\r
 122 \r
 123 }\r
 124 \r