src/jalview/bin/Jalview.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.bin;
  20
  21 import java.io.BufferedReader;
  22 import java.io.File;
  23 import java.io.FileOutputStream;
  24 import java.io.IOException;
  25 import java.io.OutputStreamWriter;
  26 import java.io.PrintWriter;
  27 import java.lang.reflect.Constructor;
  28 import java.net.URL;
  29 import java.util.*;
  30
  31 import javax.swing.*;
  32
  33 import jalview.gui.*;
  34 import jalview.io.AppletFormatAdapter;
  35
  36 /**
  37  * Main class for Jalview Application <br>
  38  * <br>
  39  * start with java -Djava.ext.dirs=$PATH_TO_LIB$ jalview.bin.Jalview
  40  *
  41  * @author $author$
  42  * @version $Revision$
  43  */
  44 public class Jalview
  45 {
  46
  47   /**
  48    * main class for Jalview application
  49    *
  50    * @param args
  51    *                open <em>filename</em>
  52    */
  53   public static void main(String[] args)
  54   {
  55     System.out.println("Java version: "
  56             + System.getProperty("java.version"));
  57     System.out.println(System.getProperty("os.arch") + " "
  58             + System.getProperty("os.name") + " "
  59             + System.getProperty("os.version"));
  60
  61     ArgsParser aparser = new ArgsParser(args);
  62     boolean headless = false;
  63
  64     if (aparser.contains("help") || aparser.contains("h"))
  65     {
  66       System.out
  67               .println("Usage: jalview -open [FILE] [OUTPUT_FORMAT] [OUTPUT_FILE]\n\n"
  68                       + "-nodisplay\tRun Jalview without User Interface.\n"
  69                       + "-props FILE\tUse the given Jalview properties file instead of users default.\n"
  70                       + "-annotations FILE\tAdd precalculated annotations to the alignment.\n"
  71                       + "-tree FILE\tLoad the given newick format tree file onto the alignment\n"
  72                       + "-features FILE\tUse the given file to mark features on the alignment.\n"
  73                       + "-fasta FILE\tCreate alignment file FILE in Fasta format.\n"
  74                       + "-clustal FILE\tCreate alignment file FILE in Clustal format.\n"
  75                       + "-pfam FILE\tCreate alignment file FILE in PFAM format.\n"
  76                       + "-msf FILE\tCreate alignment file FILE in MSF format.\n"
  77                       + "-pileup FILE\tCreate alignment file FILE in Pileup format\n"
  78                       + "-pir FILE\tCreate alignment file FILE in PIR format.\n"
  79                       + "-blc FILE\tCreate alignment file FILE in BLC format.\n"
  80                       + "-jalview FILE\tCreate alignment file FILE in Jalview format.\n"
  81                       + "-png FILE\tCreate PNG image FILE from alignment.\n"
  82                       + "-imgMap FILE\tCreate HTML file FILE with image map of PNG image.\n"
  83                       + "-eps FILE\tCreate EPS file FILE from alignment.\n"
  84                       + "-questionnaire URL\tQueries the given URL for information about any Jalview user questionnaires.\n"
  85                       + "-noquestionnaire\tTurn off questionnaire check.\n"
  86                       + "-sortbytree OR -nosortbytree\tEnable or disable sorting of the given alignment by the given tree\n"
  87                       + "-setprop PROPERTY=VALUE\tSet the given Jalview property, after all other properties files have been read\n\t (quote the 'PROPERTY=VALUE' pair to ensure spaces are passed in correctly)"
  88                       + "-dasserver nickname=URL\tAdd and enable a das server with given nickname (alphanumeric or underscores only) for retrieval of features for all alignments.\n"
  89                       +"\t\tSources that also support the sequence command may be specified by prepending the URL with sequence:\n"
  90                       +"\t\t e.g. sequence:http://localdas.somewhere.org/das/source)\n"
  91                       + "-fetchfrom nickname\tQuery nickname for features for the alignments and display them.\n"
  92                       + "-groovy FILE\tExecute groovy script in FILE, after all other arguments have been processed (if FILE is the text 'STDIN' then the file will be read from STDIN)\n"
  93                       + "\n~Read documentation in Application or visit http://www.jalview.org for description of Features and Annotations file~\n\n");
  94       System.exit(0);
  95     }
  96     Cache.loadProperties(aparser.getValue("props")); // must do this before
  97     // anything else!
  98     String defs = aparser.getValue("setprop");
  99     while (defs!=null)
 100     {
 101       int p = defs.indexOf('=');
 102       if ( p==-1 )
 103       {
 104         System.err.println("Ignoring invalid setprop argument : "+defs);
 105       } else {
 106         System.out.println("Executing setprop argument: "+defs);
 107         // DISABLED FOR SECURITY REASONS
 108         // Cache.setProperty(defs.substring(0,p), defs.substring(p+1));
 109       }
 110       defs = aparser.getValue("setprop");
 111     }
 112     if (aparser.contains("nodisplay"))
 113     {
 114       System.setProperty("java.awt.headless", "true");
 115     }
 116     if (System.getProperty("java.awt.headless") != null
 117             && System.getProperty("java.awt.headless").equals("true"))
 118     {
 119       headless = true;
 120     }
 121
 122     try
 123     {
 124       Cache.initLogger();
 125     } catch (java.lang.NoClassDefFoundError error)
 126     {
 127       error.printStackTrace();
 128       System.out
 129               .println("\nEssential logging libraries not found."
 130                       + "\nUse: java -Djava.ext.dirs=$PATH_TO_LIB$ jalview.bin.Jalview");
 131       System.exit(0);
 132     }
 133
 134     Desktop desktop = null;
 135
 136     try
 137     {
 138       UIManager.setLookAndFeel(UIManager.getSystemLookAndFeelClassName()
 139       // UIManager.getCrossPlatformLookAndFeelClassName()
 140               // "com.sun.java.swing.plaf.gtk.GTKLookAndFeel"
 141               // "javax.swing.plaf.metal.MetalLookAndFeel"
 142               // "com.sun.java.swing.plaf.windows.WindowsLookAndFeel"
 143               // "com.sun.java.swing.plaf.motif.MotifLookAndFeel"
 144
 145
 146               );
 147     } catch (Exception ex)
 148     {
 149     }
 150     if (!headless)
 151     {
 152       desktop = new Desktop();
 153       desktop.setVisible(true);
 154       desktop.discoverer.start();
 155       if (!aparser.contains("nousagestats") && Cache.getDefault("USAGESTATS", true)) {
 156         Cache.log.info("Initialising googletracker for usage stats.");
 157         Cache.initGoogleTracker();
 158         Cache.log.debug("Tracking enabled.");
 159       } else {
 160         Cache.log.info("Not enabling Google Tracking.");
 161       }
 162       if (!aparser.contains("noquestionnaire"))
 163       {
 164         String url = aparser.getValue("questionnaire");
 165         if (url != null)
 166         {
 167           // Start the desktop questionnaire prompter with the specified
 168           // questionnaire
 169           Cache.log.debug("Starting questionnaire url at " + url);
 170           desktop.checkForQuestionnaire(url);
 171         }
 172         else
 173         {
 174           if (Cache.getProperty("NOQUESTIONNAIRES") == null)
 175           {
 176             // Start the desktop questionnaire prompter with the specified
 177             // questionnaire
 178             // String defurl =
 179             // "http://anaplog.compbio.dundee.ac.uk/cgi-bin/questionnaire.pl";
 180             // //
 181             String defurl = "http://www.jalview.org/cgi-bin/questionnaire.pl";
 182             Cache.log.debug("Starting questionnaire with default url: "
 183                     + defurl);
 184             desktop.checkForQuestionnaire(defurl);
 185
 186           }
 187         }
 188       }
 189     }
 190
 191     String file = null, protocol = null, format = null, data = null;
 192     jalview.io.FileLoader fileLoader = new jalview.io.FileLoader();
 193     Vector getFeatures = null; // vector of das source nicknames to fetch
 194                                 // features from
 195     // loading is done.
 196     String groovyscript = null; // script to execute after all loading is
 197                                 // completed one way or another
 198     // extract groovy argument and execute if necessary
 199     groovyscript = aparser.getValue("groovy");
 200     file = aparser.getValue("open");
 201
 202     if (file == null && desktop == null)
 203     {
 204       System.out.println("No files to open!");
 205       System.exit(1);
 206     }
 207
 208     if (file != null)
 209     {
 210       System.out.println("Opening file: " + file);
 211
 212       if (!file.startsWith("http://"))
 213       {
 214         if (!(new java.io.File(file)).exists())
 215         {
 216           System.out.println("Can't find " + file);
 217           if (headless)
 218           {
 219             System.exit(1);
 220           }
 221         }
 222       }
 223
 224       protocol = checkProtocol(file);
 225
 226       format = new jalview.io.IdentifyFile().Identify(file, protocol);
 227
 228       AlignFrame af = fileLoader.LoadFileWaitTillLoaded(file, protocol,
 229               format);
 230
 231       if (af == null)
 232       {
 233         System.out.println("error");
 234         return;
 235       }
 236
 237       data = aparser.getValue("colour");
 238       if (data != null)
 239       {
 240         data.replaceAll("%20", " ");
 241
 242         jalview.schemes.ColourSchemeI cs = jalview.schemes.ColourSchemeProperty
 243                 .getColour(af.getViewport().getAlignment(), data);
 244
 245         if (cs == null)
 246         {
 247           jalview.schemes.UserColourScheme ucs = new jalview.schemes.UserColourScheme(
 248                   "white");
 249           ucs.parseAppletParameter(data);
 250           cs = ucs;
 251         }
 252
 253         System.out.println("colour is " + data);
 254         af.changeColour(cs);
 255       }
 256
 257       // Must maintain ability to use the groups flag
 258       data = aparser.getValue("groups");
 259       if (data != null)
 260       {
 261         af.parseFeaturesFile(data, checkProtocol(data));
 262         System.out.println("Added " + data);
 263       }
 264       data = aparser.getValue("features");
 265       if (data != null)
 266       {
 267         af.parseFeaturesFile(data, checkProtocol(data));
 268         System.out.println("Added " + data);
 269       }
 270
 271       data = aparser.getValue("annotations");
 272       if (data != null)
 273       {
 274         af.loadJalviewDataFile(data);
 275         System.out.println("Added " + data);
 276       }
 277       // set or clear the sortbytree flag.
 278       if (aparser.contains("sortbytree"))
 279       {
 280         af.getViewport().setSortByTree(true);
 281       }
 282       if (aparser.contains("nosortbytree"))
 283       {
 284         af.getViewport().setSortByTree(false);
 285       }
 286       data = aparser.getValue("tree");
 287       if (data != null)
 288       {
 289         jalview.io.NewickFile fin = null;
 290         try
 291         {
 292           fin = new jalview.io.NewickFile(data, checkProtocol(data));
 293           if (fin != null)
 294           {
 295             af.getViewport().setCurrentTree(
 296                     af.ShowNewickTree(fin, data).getTree());
 297             System.out.println("Added tree " + data);
 298           }
 299         } catch (IOException ex)
 300         {
 301           System.err.println("Couldn't add tree " + data);
 302           ex.printStackTrace(System.err);
 303         }
 304       }
 305       getFeatures = checkDasArguments(aparser);
 306       if (af != null && getFeatures != null)
 307       {
 308         startFeatureFetching(getFeatures);
 309         // need to block until fetching is complete.
 310         while (af.operationInProgress())
 311         {
 312           // wait around until fetching is finished.
 313           try
 314           {
 315             Thread.sleep(10);
 316           } catch (Exception e)
 317           {
 318
 319           }
 320         }
 321       }
 322       if (groovyscript != null)
 323       {
 324         // Execute the groovy script after we've done all the rendering stuff
 325         // and before any images or figures are generated.
 326         if (jalview.bin.Cache.groovyJarsPresent())
 327         {
 328           System.out.println("Executing script " + groovyscript);
 329           executeGroovyScript(groovyscript, desktop);
 330         }
 331         else
 332         {
 333           System.err
 334                   .println("Sorry. Groovy Support is not available, so ignoring the provided groovy script "
 335                           + groovyscript);
 336         }
 337         groovyscript = null;
 338       }
 339       String imageName = "unnamed.png";
 340       while (aparser.getSize() > 1)
 341       {
 342         format = aparser.nextValue();
 343         file = aparser.nextValue();
 344
 345         if (format.equalsIgnoreCase("png"))
 346         {
 347           af.createPNG(new java.io.File(file));
 348           imageName = (new java.io.File(file)).getName();
 349           System.out.println("Creating PNG image: " + file);
 350           continue;
 351         }
 352         else if (format.equalsIgnoreCase("imgMap"))
 353         {
 354           af.createImageMap(new java.io.File(file), imageName);
 355           System.out.println("Creating image map: " + file);
 356           continue;
 357         }
 358         else if (format.equalsIgnoreCase("eps"))
 359         {
 360           System.out.println("Creating EPS file: " + file);
 361           af.createEPS(new java.io.File(file));
 362           continue;
 363         }
 364
 365         if (af.saveAlignment(file, format))
 366         {
 367           System.out.println("Written alignment in " + format
 368                   + " format to " + file);
 369         }
 370         else
 371         {
 372           System.out.println("Error writing file " + file + " in " + format
 373                   + " format!!");
 374         }
 375
 376       }
 377
 378       while (aparser.getSize() > 0)
 379       {
 380         System.out.println("Unknown arg: " + aparser.nextValue());
 381       }
 382     }
 383     AlignFrame startUpAlframe = null;
 384     // We'll only open the default file if the desktop is visible.
 385     // And the user
 386     // ////////////////////
 387     if (!headless && file == null
 388             && jalview.bin.Cache.getDefault("SHOW_STARTUP_FILE", true))
 389     {
 390       file = jalview.bin.Cache.getDefault("STARTUP_FILE",
 391               "http://www.jalview.org/examples/exampleFile_2_3.jar");
 392
 393       protocol = "File";
 394
 395       if (file.indexOf("http:") > -1)
 396       {
 397         protocol = "URL";
 398       }
 399
 400       if (file.endsWith(".jar"))
 401       {
 402         format = "Jalview";
 403       }
 404       else
 405       {
 406         format = new jalview.io.IdentifyFile().Identify(file, protocol);
 407       }
 408
 409       startUpAlframe = fileLoader.LoadFileWaitTillLoaded(file, protocol,
 410               format);
 411       getFeatures = checkDasArguments(aparser);
 412       // extract groovy arguments before anything else.
 413     }
 414     // Once all loading is done. Retrieve features.
 415     if (getFeatures != null)
 416     {
 417       if (startUpAlframe != null)
 418       {
 419         startFeatureFetching(getFeatures);
 420       }
 421     }
 422     if (groovyscript != null)
 423     {
 424       if (jalview.bin.Cache.groovyJarsPresent())
 425       {
 426         System.out.println("Executing script " + groovyscript);
 427         executeGroovyScript(groovyscript, desktop);
 428       }
 429       else
 430       {
 431         System.err
 432                 .println("Sorry. Groovy Support is not available, so ignoring the provided groovy script "
 433                         + groovyscript);
 434       }
 435     }
 436
 437     // Once all other stuff is done, execute any groovy scripts (in order)
 438   }
 439
 440   /**
 441    * Locate the given string as a file and pass it to the groovy interpreter.
 442    *
 443    * @param groovyscript
 444    *                the script to execute
 445    * @param jalviewContext
 446    *                the Jalview Desktop object passed in to the groovy binding
 447    *                as the 'Jalview' object.
 448    */
 449   private static void executeGroovyScript(String groovyscript,
 450           Object jalviewContext)
 451   {
 452     if (jalviewContext == null)
 453     {
 454       System.err
 455               .println("Sorry. Groovy support is currently only available when running with the Jalview GUI enabled.");
 456     }
 457     File sfile = null;
 458     if (groovyscript.trim().equals("STDIN"))
 459     {
 460       // read from stdin into a tempfile and execute it
 461       try
 462       {
 463         sfile = File.createTempFile("jalview", "groovy");
 464         PrintWriter outfile = new PrintWriter(new OutputStreamWriter(
 465                 new FileOutputStream(sfile)));
 466         BufferedReader br = new BufferedReader(
 467                 new java.io.InputStreamReader(System.in));
 468         String line = null;
 469         while ((line = br.readLine()) != null)
 470         {
 471           outfile.write(line + "\n");
 472         }
 473         br.close();
 474         outfile.flush();
 475         outfile.close();
 476
 477       } catch (Exception ex)
 478       {
 479         System.err.println("Failed to read from STDIN into tempfile "
 480                 + ((sfile == null) ? "(tempfile wasn't created)" : sfile
 481                         .toString()));
 482         ex.printStackTrace();
 483         return;
 484       }
 485     }
 486     else
 487     {
 488       sfile = new File(groovyscript);
 489     }
 490     if (!sfile.exists())
 491     {
 492       System.err.println("File '" + groovyscript + "' does not exist.");
 493       return;
 494     }
 495     if (!sfile.canRead())
 496     {
 497       System.err.println("File '" + groovyscript + "' cannot be read.");
 498       return;
 499     }
 500     if (sfile.length() < 1)
 501     {
 502       System.err.println("File '" + groovyscript + "' is empty.");
 503       return;
 504     }
 505     boolean success = false;
 506     try
 507     {
 508       /*
 509        * The following code performs the GroovyScriptEngine invocation using
 510        * reflection, and is equivalent to this fragment from the embedding
 511        * groovy documentation on the groovy site: <code> import
 512        * groovy.lang.Binding; import groovy.util.GroovyScriptEngine;
 513        *
 514        * String[] roots = new String[] { "/my/groovy/script/path" };
 515        * GroovyScriptEngine gse = new GroovyScriptEngine(roots); Binding binding =
 516        * new Binding(); binding.setVariable("input", "world");
 517        * gse.run("hello.groovy", binding); </code>
 518        */
 519       ClassLoader cl = jalviewContext.getClass().getClassLoader();
 520       Class gbindingc = cl.loadClass("groovy.lang.Binding");
 521       Constructor gbcons = gbindingc.getConstructor(null);
 522       Object gbinding = gbcons.newInstance(null);
 523       java.lang.reflect.Method setvar = gbindingc.getMethod("setVariable",
 524               new Class[]
 525               { String.class, Object.class });
 526       setvar.invoke(gbinding, new Object[]
 527       { "Jalview", jalviewContext });
 528       Class gsec = cl.loadClass("groovy.util.GroovyScriptEngine");
 529       Constructor gseccons = gsec.getConstructor(new Class[]
 530       { URL[].class }); // String[].class });
 531       Object gse = gseccons.newInstance(new Object[]
 532       { new URL[]
 533       { sfile.toURL() } }); // .toString() } });
 534       java.lang.reflect.Method run = gsec.getMethod("run", new Class[]
 535       { String.class, gbindingc });
 536       run.invoke(gse, new Object[]
 537       { sfile.getName(), gbinding });
 538       success = true;
 539     } catch (Exception e)
 540     {
 541       System.err.println("Exception Whilst trying to execute file " + sfile
 542               + " as a groovy script.");
 543       e.printStackTrace(System.err);
 544
 545     }
 546     if (success && groovyscript.equals("STDIN"))
 547     {
 548       // delete temp file that we made - but only if it was successfully
 549       // executed
 550       sfile.delete();
 551     }
 552   }
 553
 554   /**
 555    * Check commandline for any das server definitions or any fetchfrom switches
 556    *
 557    * @return vector of DAS source nicknames to retrieve from
 558    */
 559   private static Vector checkDasArguments(ArgsParser aparser)
 560   {
 561     Vector source = null;
 562     String data;
 563     String locsources = Cache.getProperty(Cache.DAS_LOCAL_SOURCE);
 564     while ((data = aparser.getValue("dasserver")) != null)
 565     {
 566       String nickname = null;
 567       String url = null;
 568       boolean seq=false,feat=true;
 569       int pos = data.indexOf('=');
 570       // determine capabilities
 571       if (pos > 0)
 572       {
 573         nickname = data.substring(0, pos);
 574       }
 575       url = data.substring(pos + 1);
 576       if (url != null && (url.startsWith("http:") || url.startsWith("sequence:http:")))
 577       {
 578         if (nickname == null)
 579         {
 580           nickname = url;
 581         }
 582         if (locsources == null)
 583         {
 584           locsources = "";
 585         }
 586         else
 587         {
 588           locsources += "\t";
 589         }
 590         locsources = locsources + nickname + "|" + url;
 591         System.err
 592                 .println("NOTE! dasserver parameter not yet really supported (got args of "
 593                         + nickname + "|" + url);
 594         if (source == null)
 595         {
 596           source = new Vector();
 597         }
 598         source.addElement(nickname);
 599       }
 600     } // loop until no more server entries are found.
 601     if (locsources != null && locsources.indexOf('|') > -1)
 602     {
 603       Cache.log.debug("Setting local source list in properties file to:\n"
 604               + locsources);
 605       Cache.setProperty(Cache.DAS_LOCAL_SOURCE, locsources);
 606     }
 607     while ((data = aparser.getValue("fetchfrom")) != null)
 608     {
 609       System.out.println("adding source '" + data + "'");
 610       if (source == null)
 611       {
 612         source = new Vector();
 613       }
 614       source.addElement(data);
 615     }
 616     return source;
 617   }
 618
 619   /**
 620    * start a feature fetcher for every alignment frame
 621    *
 622    * @param dasSources
 623    */
 624   private static void startFeatureFetching(final Vector dasSources)
 625   {
 626     AlignFrame afs[] = Desktop.getAlignframes();
 627     if (afs == null || afs.length == 0)
 628     {
 629       return;
 630     }
 631     for (int i = 0; i < afs.length; i++)
 632     {
 633       final AlignFrame af = afs[i];
 634       SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
 635       {
 636
 637         public void run()
 638         {
 639           af.featureSettings_actionPerformed(null);
 640           af.featureSettings.fetchDasFeatures(dasSources);
 641         }
 642       });
 643     }
 644   }
 645
 646   private static String checkProtocol(String file)
 647   {
 648     String protocol = jalview.io.FormatAdapter.FILE;
 649
 650     if (file.indexOf("http:") > -1 || file.indexOf("file:") > -1)
 651     {
 652       protocol = jalview.io.FormatAdapter.URL;
 653     }
 654     return protocol;
 655   }
 656 }
 657
 658 /**
 659  * Notes: this argParser does not distinguish between parameter switches,
 660  * parameter values and argument text. If an argument happens to be identical to
 661  * a parameter, it will be taken as such (even though it didn't have a '-'
 662  * prefixing it).
 663  *
 664  * @author Andrew Waterhouse and JBP documented.
 665  *
 666  */
 667 class ArgsParser
 668 {
 669   Vector vargs = null;
 670
 671   public ArgsParser(String[] args)
 672   {
 673     vargs = new Vector();
 674     for (int i = 0; i < args.length; i++)
 675     {
 676       String arg = args[i].trim();
 677       if (arg.charAt(0) == '-')
 678       {
 679         arg = arg.substring(1);
 680       }
 681       vargs.addElement(arg);
 682     }
 683   }
 684
 685   /**
 686    * check for and remove first occurence of arg+parameter in arglist.
 687    *
 688    * @param arg
 689    * @return return the argument following the given arg if arg was in list.
 690    */
 691   public String getValue(String arg)
 692   {
 693     int index = vargs.indexOf(arg);
 694     String ret = null;
 695     if (index != -1)
 696     {
 697       ret = vargs.elementAt(index + 1).toString();
 698       vargs.removeElementAt(index);
 699       vargs.removeElementAt(index);
 700     }
 701     return ret;
 702   }
 703
 704   /**
 705    * check for and remove first occurence of arg in arglist.
 706    *
 707    * @param arg
 708    * @return true if arg was present in argslist.
 709    */
 710   public boolean contains(String arg)
 711   {
 712     if (vargs.contains(arg))
 713     {
 714       vargs.removeElement(arg);
 715       return true;
 716     }
 717     else
 718     {
 719       return false;
 720     }
 721   }
 722
 723   public String nextValue()
 724   {
 725     return vargs.remove(0).toString();
 726   }
 727
 728   public int getSize()
 729   {
 730     return vargs.size();
 731   }
 732
 733 }