src/jalview/bin/JalviewJS2.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.bin;
  22
  23 import jalview.util.Platform;
  24
  25 import java.awt.event.ActionEvent;
  26 import java.awt.event.ActionListener;
  27
  28 import javax.swing.Timer;
  29
  30 /**
  31  * Entry point for JalviewJS development.
  32  *
  33  *
  34  *
  35  * @author RM
  36  *
  37  */
  38 public class JalviewJS2
  39 {
  40
  41   static
  42   {
  43     /**
  44      * @ could do it this way:
  45      *
  46      * j2sNative
  47      *
  48      * J2S.thisApplet.__Info.args = [ "open","examples/uniref50.fa",
  49      * "features","examples/exampleFeatures.txt", "noannotation" ];
  50      */
  51   }
  52
  53   public static void main(String[] args) throws Exception
  54   {
  55     if (args.length == 0)
  56     {
  57       args = new String[] {
  58         //  "headless",
  59           "open", "examples/uniref50.fa",
  60 //          "features",
  61 //          "examples/exampleFeatures.txt"
  62 //          , "noannotation"
  63           //, "showoverview"
  64           //, "png", "test-bh.png"
  65       };
  66     }
  67
  68     // String cmds = "nodisplay -open examples/uniref50.fa -sortbytree -props
  69     // test/jalview/io/testProps.jvprops -colour zappo "
  70     // + "-jabaws http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws -nosortbytree "
  71     // + "-features examples/testdata/plantfdx.features -annotations
  72     // examples/testdata/plantfdx.annotations -tree
  73     // examples/testdata/uniref50_test_tree";
  74     // args = cmds.split(" ");
  75     Jalview.main(args);
  76     // showFocusTimer();
  77   }
  78
  79   protected static int focusTime = 0;
  80
  81   private static void showFocusTimer()
  82   {
  83
  84     if (Platform.isJS())
  85     {
  86       Timer t = new Timer(100, new ActionListener()
  87       {
  88
  89         @Override
  90         public void actionPerformed(ActionEvent e)
  91         {
  92           String s = /** @j2sNative document.activeElement.id || */
  93                   null;
  94
  95           s += " " + (++focusTime);
  96
  97           /** @j2sNative document.title = s; */
  98         }
  99
 100       });
 101
 102       t.setRepeats(true);
 103       t.start();
 104     }
 105   }
 106
 107 }