src/jalview/binding/Feature.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.binding;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import java.io.IOException;\r
  15 import java.io.Reader;\r
  16 import java.io.Serializable;\r
  17 import java.io.Writer;\r
  18 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  19 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  20 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  21 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  22 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  23 \r
  24 /**\r
  25  * Class Feature.\r
  26  * \r
  27  * @version $Revision$ $Date$\r
  28  */\r
  29 public class Feature implements java.io.Serializable {\r
  30 \r
  31 \r
  32       //--------------------------/\r
  33      //- Class/Member Variables -/\r
  34     //--------------------------/\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field _begin\r
  38      */\r
  39     private int _begin;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * keeps track of state for field: _begin\r
  43      */\r
  44     private boolean _has_begin;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field _end\r
  48      */\r
  49     private int _end;\r
  50 \r
  51     /**\r
  52      * keeps track of state for field: _end\r
  53      */\r
  54     private boolean _has_end;\r
  55 \r
  56     /**\r
  57      * Field _type\r
  58      */\r
  59     private java.lang.String _type;\r
  60 \r
  61     /**\r
  62      * Field _description\r
  63      */\r
  64     private java.lang.String _description;\r
  65 \r
  66     /**\r
  67      * Field _status\r
  68      */\r
  69     private java.lang.String _status;\r
  70 \r
  71     /**\r
  72      * Field _featureGroup\r
  73      */\r
  74     private java.lang.String _featureGroup;\r
  75 \r
  76 \r
  77       //----------------/\r
  78      //- Constructors -/\r
  79     //----------------/\r
  80 \r
  81     public Feature() {\r
  82         super();\r
  83     } //-- jalview.binding.Feature()\r
  84 \r
  85 \r
  86       //-----------/\r
  87      //- Methods -/\r
  88     //-----------/\r
  89 \r
  90     /**\r
  91      * Method deleteBegin\r
  92      * \r
  93      */\r
  94     public void deleteBegin()\r
  95     {\r
  96         this._has_begin= false;\r
  97     } //-- void deleteBegin() \r
  98 \r
  99     /**\r
 100      * Method deleteEnd\r
 101      * \r
 102      */\r
 103     public void deleteEnd()\r
 104     {\r
 105         this._has_end= false;\r
 106     } //-- void deleteEnd() \r
 107 \r
 108     /**\r
 109      * Returns the value of field 'begin'.\r
 110      * \r
 111      * @return int\r
 112      * @return the value of field 'begin'.\r
 113      */\r
 114     public int getBegin()\r
 115     {\r
 116         return this._begin;\r
 117     } //-- int getBegin() \r
 118 \r
 119     /**\r
 120      * Returns the value of field 'description'.\r
 121      * \r
 122      * @return String\r
 123      * @return the value of field 'description'.\r
 124      */\r
 125     public java.lang.String getDescription()\r
 126     {\r
 127         return this._description;\r
 128     } //-- java.lang.String getDescription() \r
 129 \r
 130     /**\r
 131      * Returns the value of field 'end'.\r
 132      * \r
 133      * @return int\r
 134      * @return the value of field 'end'.\r
 135      */\r
 136     public int getEnd()\r
 137     {\r
 138         return this._end;\r
 139     } //-- int getEnd() \r
 140 \r
 141     /**\r
 142      * Returns the value of field 'featureGroup'.\r
 143      * \r
 144      * @return String\r
 145      * @return the value of field 'featureGroup'.\r
 146      */\r
 147     public java.lang.String getFeatureGroup()\r
 148     {\r
 149         return this._featureGroup;\r
 150     } //-- java.lang.String getFeatureGroup() \r
 151 \r
 152     /**\r
 153      * Returns the value of field 'status'.\r
 154      * \r
 155      * @return String\r
 156      * @return the value of field 'status'.\r
 157      */\r
 158     public java.lang.String getStatus()\r
 159     {\r
 160         return this._status;\r
 161     } //-- java.lang.String getStatus() \r
 162 \r
 163     /**\r
 164      * Returns the value of field 'type'.\r
 165      * \r
 166      * @return String\r
 167      * @return the value of field 'type'.\r
 168      */\r
 169     public java.lang.String getType()\r
 170     {\r
 171         return this._type;\r
 172     } //-- java.lang.String getType() \r
 173 \r
 174     /**\r
 175      * Method hasBegin\r
 176      * \r
 177      * \r
 178      * \r
 179      * @return boolean\r
 180      */\r
 181     public boolean hasBegin()\r
 182     {\r
 183         return this._has_begin;\r
 184     } //-- boolean hasBegin() \r
 185 \r
 186     /**\r
 187      * Method hasEnd\r
 188      * \r
 189      * \r
 190      * \r
 191      * @return boolean\r
 192      */\r
 193     public boolean hasEnd()\r
 194     {\r
 195         return this._has_end;\r
 196     } //-- boolean hasEnd() \r
 197 \r
 198     /**\r
 199      * Method isValid\r
 200      * \r
 201      * \r
 202      * \r
 203      * @return boolean\r
 204      */\r
 205     public boolean isValid()\r
 206     {\r
 207         try {\r
 208             validate();\r
 209         }\r
 210         catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
 211             return false;\r
 212         }\r
 213         return true;\r
 214     } //-- boolean isValid() \r
 215 \r
 216     /**\r
 217      * Method marshal\r
 218      * \r
 219      * \r
 220      * \r
 221      * @param out\r
 222      */\r
 223     public void marshal(java.io.Writer out)\r
 224         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 225     {\r
 226         \r
 227         Marshaller.marshal(this, out);\r
 228     } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
 229 \r
 230     /**\r
 231      * Method marshal\r
 232      * \r
 233      * \r
 234      * \r
 235      * @param handler\r
 236      */\r
 237     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
 238         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 239     {\r
 240         \r
 241         Marshaller.marshal(this, handler);\r
 242     } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
 243 \r
 244     /**\r
 245      * Sets the value of field 'begin'.\r
 246      * \r
 247      * @param begin the value of field 'begin'.\r
 248      */\r
 249     public void setBegin(int begin)\r
 250     {\r
 251         this._begin = begin;\r
 252         this._has_begin = true;\r
 253     } //-- void setBegin(int) \r
 254 \r
 255     /**\r
 256      * Sets the value of field 'description'.\r
 257      * \r
 258      * @param description the value of field 'description'.\r
 259      */\r
 260     public void setDescription(java.lang.String description)\r
 261     {\r
 262         this._description = description;\r
 263     } //-- void setDescription(java.lang.String) \r
 264 \r
 265     /**\r
 266      * Sets the value of field 'end'.\r
 267      * \r
 268      * @param end the value of field 'end'.\r
 269      */\r
 270     public void setEnd(int end)\r
 271     {\r
 272         this._end = end;\r
 273         this._has_end = true;\r
 274     } //-- void setEnd(int) \r
 275 \r
 276     /**\r
 277      * Sets the value of field 'featureGroup'.\r
 278      * \r
 279      * @param featureGroup the value of field 'featureGroup'.\r
 280      */\r
 281     public void setFeatureGroup(java.lang.String featureGroup)\r
 282     {\r
 283         this._featureGroup = featureGroup;\r
 284     } //-- void setFeatureGroup(java.lang.String) \r
 285 \r
 286     /**\r
 287      * Sets the value of field 'status'.\r
 288      * \r
 289      * @param status the value of field 'status'.\r
 290      */\r
 291     public void setStatus(java.lang.String status)\r
 292     {\r
 293         this._status = status;\r
 294     } //-- void setStatus(java.lang.String) \r
 295 \r
 296     /**\r
 297      * Sets the value of field 'type'.\r
 298      * \r
 299      * @param type the value of field 'type'.\r
 300      */\r
 301     public void setType(java.lang.String type)\r
 302     {\r
 303         this._type = type;\r
 304     } //-- void setType(java.lang.String) \r
 305 \r
 306     /**\r
 307      * Method unmarshal\r
 308      * \r
 309      * \r
 310      * \r
 311      * @param reader\r
 312      * @return Object\r
 313      */\r
 314     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 315         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 316     {\r
 317         return (jalview.binding.Feature) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.Feature.class, reader);\r
 318     } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
 319 \r
 320     /**\r
 321      * Method validate\r
 322      * \r
 323      */\r
 324     public void validate()\r
 325         throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 326     {\r
 327         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 328         validator.validate(this);\r
 329     } //-- void validate() \r
 330 \r
 331 }\r