src/jalview/binding/JSeq.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with\r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 package jalview.binding;\r
   8 \r
   9 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  10 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  11 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  12 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  13 \r
  14 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  15 \r
  16 //---------------------------------/\r
  17 //- Imported classes and packages -/\r
  18 //---------------------------------/\r
  19 import java.io.IOException;\r
  20 import java.io.Reader;\r
  21 import java.io.Serializable;\r
  22 import java.io.Writer;\r
  23 \r
  24 \r
  25 /**\r
  26  * Class JSeq.\r
  27  *\r
  28  * @version $Revision$ $Date$\r
  29  */\r
  30 public class JSeq implements java.io.Serializable\r
  31 {\r
  32     //--------------------------/\r
  33     //- Class/Member Variables -/\r
  34     //--------------------------/\r
  35 \r
  36     /**\r
  37      * Field _colour\r
  38      */\r
  39     private int _colour;\r
  40 \r
  41     /**\r
  42      * keeps track of state for field: _colour\r
  43      */\r
  44     private boolean _has_colour;\r
  45 \r
  46     /**\r
  47      * Field _start\r
  48      */\r
  49     private int _start;\r
  50 \r
  51     /**\r
  52      * keeps track of state for field: _start\r
  53      */\r
  54     private boolean _has_start;\r
  55 \r
  56     /**\r
  57      * Field _end\r
  58      */\r
  59     private int _end;\r
  60 \r
  61     /**\r
  62      * keeps track of state for field: _end\r
  63      */\r
  64     private boolean _has_end;\r
  65 \r
  66     /**\r
  67      * Field _id\r
  68      */\r
  69     private int _id;\r
  70 \r
  71     /**\r
  72      * keeps track of state for field: _id\r
  73      */\r
  74     private boolean _has_id;\r
  75 \r
  76     //----------------/\r
  77     //- Constructors -/\r
  78     //----------------/\r
  79     public JSeq()\r
  80     {\r
  81         super();\r
  82     }\r
  83 \r
  84     //-- jalview.binding.JSeq()\r
  85     //-----------/\r
  86 \r
  87     /**\r
  88      * DOCUMENT ME!\r
  89      */\r
  90     public void deleteColour()\r
  91     {\r
  92         this._has_colour = false;\r
  93     }\r
  94 \r
  95     //-- void deleteColour() \r
  96 \r
  97     /**\r
  98      * Method deleteEnd\r
  99      *\r
 100      */\r
 101     public void deleteEnd()\r
 102     {\r
 103         this._has_end = false;\r
 104     }\r
 105 \r
 106     //-- void deleteEnd() \r
 107 \r
 108     /**\r
 109      * Method deleteId\r
 110      *\r
 111      */\r
 112     public void deleteId()\r
 113     {\r
 114         this._has_id = false;\r
 115     }\r
 116 \r
 117     //-- void deleteId() \r
 118 \r
 119     /**\r
 120      * Method deleteStart\r
 121      *\r
 122      */\r
 123     public void deleteStart()\r
 124     {\r
 125         this._has_start = false;\r
 126     }\r
 127 \r
 128     //-- void deleteStart() \r
 129 \r
 130     /**\r
 131      * Returns the value of field 'colour'.\r
 132      *\r
 133      * @return int\r
 134      * @return the value of field 'colour'.\r
 135      */\r
 136     public int getColour()\r
 137     {\r
 138         return this._colour;\r
 139     }\r
 140 \r
 141     //-- int getColour() \r
 142 \r
 143     /**\r
 144      * Returns the value of field 'end'.\r
 145      *\r
 146      * @return int\r
 147      * @return the value of field 'end'.\r
 148      */\r
 149     public int getEnd()\r
 150     {\r
 151         return this._end;\r
 152     }\r
 153 \r
 154     //-- int getEnd() \r
 155 \r
 156     /**\r
 157      * Returns the value of field 'id'.\r
 158      *\r
 159      * @return int\r
 160      * @return the value of field 'id'.\r
 161      */\r
 162     public int getId()\r
 163     {\r
 164         return this._id;\r
 165     }\r
 166 \r
 167     //-- int getId() \r
 168 \r
 169     /**\r
 170      * Returns the value of field 'start'.\r
 171      *\r
 172      * @return int\r
 173      * @return the value of field 'start'.\r
 174      */\r
 175     public int getStart()\r
 176     {\r
 177         return this._start;\r
 178     }\r
 179 \r
 180     //-- int getStart() \r
 181 \r
 182     /**\r
 183      * Method hasColour\r
 184      *\r
 185      *\r
 186      *\r
 187      * @return boolean\r
 188      */\r
 189     public boolean hasColour()\r
 190     {\r
 191         return this._has_colour;\r
 192     }\r
 193 \r
 194     //-- boolean hasColour() \r
 195 \r
 196     /**\r
 197      * Method hasEnd\r
 198      *\r
 199      *\r
 200      *\r
 201      * @return boolean\r
 202      */\r
 203     public boolean hasEnd()\r
 204     {\r
 205         return this._has_end;\r
 206     }\r
 207 \r
 208     //-- boolean hasEnd() \r
 209 \r
 210     /**\r
 211      * Method hasId\r
 212      *\r
 213      *\r
 214      *\r
 215      * @return boolean\r
 216      */\r
 217     public boolean hasId()\r
 218     {\r
 219         return this._has_id;\r
 220     }\r
 221 \r
 222     //-- boolean hasId() \r
 223 \r
 224     /**\r
 225      * Method hasStart\r
 226      *\r
 227      *\r
 228      *\r
 229      * @return boolean\r
 230      */\r
 231     public boolean hasStart()\r
 232     {\r
 233         return this._has_start;\r
 234     }\r
 235 \r
 236     //-- boolean hasStart() \r
 237 \r
 238     /**\r
 239      * Method isValid\r
 240      *\r
 241      *\r
 242      *\r
 243      * @return boolean\r
 244      */\r
 245     public boolean isValid()\r
 246     {\r
 247         try\r
 248         {\r
 249             validate();\r
 250         }\r
 251         catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)\r
 252         {\r
 253             return false;\r
 254         }\r
 255 \r
 256         return true;\r
 257     }\r
 258 \r
 259     //-- boolean isValid() \r
 260 \r
 261     /**\r
 262      * Method marshal\r
 263      *\r
 264      *\r
 265      *\r
 266      * @param out\r
 267      */\r
 268     public void marshal(java.io.Writer out)\r
 269         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
 270             org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 271     {\r
 272         Marshaller.marshal(this, out);\r
 273     }\r
 274 \r
 275     //-- void marshal(java.io.Writer) \r
 276 \r
 277     /**\r
 278      * Method marshal\r
 279      *\r
 280      *\r
 281      *\r
 282      * @param handler\r
 283      */\r
 284     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
 285         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
 286             org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 287     {\r
 288         Marshaller.marshal(this, handler);\r
 289     }\r
 290 \r
 291     //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
 292 \r
 293     /**\r
 294      * Sets the value of field 'colour'.\r
 295      *\r
 296      * @param colour the value of field 'colour'.\r
 297      */\r
 298     public void setColour(int colour)\r
 299     {\r
 300         this._colour = colour;\r
 301         this._has_colour = true;\r
 302     }\r
 303 \r
 304     //-- void setColour(int) \r
 305 \r
 306     /**\r
 307      * Sets the value of field 'end'.\r
 308      *\r
 309      * @param end the value of field 'end'.\r
 310      */\r
 311     public void setEnd(int end)\r
 312     {\r
 313         this._end = end;\r
 314         this._has_end = true;\r
 315     }\r
 316 \r
 317     //-- void setEnd(int) \r
 318 \r
 319     /**\r
 320      * Sets the value of field 'id'.\r
 321      *\r
 322      * @param id the value of field 'id'.\r
 323      */\r
 324     public void setId(int id)\r
 325     {\r
 326         this._id = id;\r
 327         this._has_id = true;\r
 328     }\r
 329 \r
 330     //-- void setId(int) \r
 331 \r
 332     /**\r
 333      * Sets the value of field 'start'.\r
 334      *\r
 335      * @param start the value of field 'start'.\r
 336      */\r
 337     public void setStart(int start)\r
 338     {\r
 339         this._start = start;\r
 340         this._has_start = true;\r
 341     }\r
 342 \r
 343     //-- void setStart(int) \r
 344 \r
 345     /**\r
 346      * Method unmarshal\r
 347      *\r
 348      *\r
 349      *\r
 350      * @param reader\r
 351      * @return Object\r
 352      */\r
 353     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 354         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
 355             org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 356     {\r
 357         return (jalview.binding.JSeq) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.JSeq.class,\r
 358             reader);\r
 359     }\r
 360 \r
 361     //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
 362 \r
 363     /**\r
 364      * Method validate\r
 365      *\r
 366      */\r
 367     public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 368     {\r
 369         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 370         validator.validate(this);\r
 371     }\r
 372 \r
 373     //-- void validate() \r
 374 }\r