src/jalview/binding/JalviewModelSequence2.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package jalview.binding;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import java.io.IOException;\r
  15 import java.io.Reader;\r
  16 import java.io.Serializable;\r
  17 import java.io.Writer;\r
  18 import java.util.Enumeration;\r
  19 import java.util.Vector;\r
  20 import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
  21 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
  22 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
  23 import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
  24 import org.xml.sax.ContentHandler;\r
  25 \r
  26 /**\r
  27  * Class JalviewModelSequence2.\r
  28  * \r
  29  * @version $Revision$ $Date$\r
  30  */\r
  31 public class JalviewModelSequence2 implements java.io.Serializable {\r
  32 \r
  33 \r
  34       //--------------------------/\r
  35      //- Class/Member Variables -/\r
  36     //--------------------------/\r
  37 \r
  38     /**\r
  39      * Field _items\r
  40      */\r
  41     private java.util.Vector _items;\r
  42 \r
  43 \r
  44       //----------------/\r
  45      //- Constructors -/\r
  46     //----------------/\r
  47 \r
  48     public JalviewModelSequence2() {\r
  49         super();\r
  50         _items = new Vector();\r
  51     } //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2()\r
  52 \r
  53 \r
  54       //-----------/\r
  55      //- Methods -/\r
  56     //-----------/\r
  57 \r
  58     /**\r
  59      * Method addJalviewModelSequence2Item\r
  60      * \r
  61      * \r
  62      * \r
  63      * @param vJalviewModelSequence2Item\r
  64      */\r
  65     public void addJalviewModelSequence2Item(jalview.binding.JalviewModelSequence2Item vJalviewModelSequence2Item)\r
  66         throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
  67     {\r
  68         _items.addElement(vJalviewModelSequence2Item);\r
  69     } //-- void addJalviewModelSequence2Item(jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
  70 \r
  71     /**\r
  72      * Method addJalviewModelSequence2Item\r
  73      * \r
  74      * \r
  75      * \r
  76      * @param index\r
  77      * @param vJalviewModelSequence2Item\r
  78      */\r
  79     public void addJalviewModelSequence2Item(int index, jalview.binding.JalviewModelSequence2Item vJalviewModelSequence2Item)\r
  80         throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
  81     {\r
  82         _items.insertElementAt(vJalviewModelSequence2Item, index);\r
  83     } //-- void addJalviewModelSequence2Item(int, jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
  84 \r
  85     /**\r
  86      * Method enumerateJalviewModelSequence2Item\r
  87      * \r
  88      * \r
  89      * \r
  90      * @return Enumeration\r
  91      */\r
  92     public java.util.Enumeration enumerateJalviewModelSequence2Item()\r
  93     {\r
  94         return _items.elements();\r
  95     } //-- java.util.Enumeration enumerateJalviewModelSequence2Item() \r
  96 \r
  97     /**\r
  98      * Method getJalviewModelSequence2Item\r
  99      * \r
 100      * \r
 101      * \r
 102      * @param index\r
 103      * @return JalviewModelSequence2Item\r
 104      */\r
 105     public jalview.binding.JalviewModelSequence2Item getJalviewModelSequence2Item(int index)\r
 106         throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
 107     {\r
 108         //-- check bounds for index\r
 109         if ((index < 0) || (index > _items.size())) {\r
 110             throw new IndexOutOfBoundsException();\r
 111         }\r
 112         \r
 113         return (jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) _items.elementAt(index);\r
 114     } //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2Item getJalviewModelSequence2Item(int) \r
 115 \r
 116     /**\r
 117      * Method getJalviewModelSequence2Item\r
 118      * \r
 119      * \r
 120      * \r
 121      * @return JalviewModelSequence2Item\r
 122      */\r
 123     public jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] getJalviewModelSequence2Item()\r
 124     {\r
 125         int size = _items.size();\r
 126         jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] mArray = new jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[size];\r
 127         for (int index = 0; index < size; index++) {\r
 128             mArray[index] = (jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) _items.elementAt(index);\r
 129         }\r
 130         return mArray;\r
 131     } //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] getJalviewModelSequence2Item() \r
 132 \r
 133     /**\r
 134      * Method getJalviewModelSequence2ItemCount\r
 135      * \r
 136      * \r
 137      * \r
 138      * @return int\r
 139      */\r
 140     public int getJalviewModelSequence2ItemCount()\r
 141     {\r
 142         return _items.size();\r
 143     } //-- int getJalviewModelSequence2ItemCount() \r
 144 \r
 145     /**\r
 146      * Method isValid\r
 147      * \r
 148      * \r
 149      * \r
 150      * @return boolean\r
 151      */\r
 152     public boolean isValid()\r
 153     {\r
 154         try {\r
 155             validate();\r
 156         }\r
 157         catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
 158             return false;\r
 159         }\r
 160         return true;\r
 161     } //-- boolean isValid() \r
 162 \r
 163     /**\r
 164      * Method marshal\r
 165      * \r
 166      * \r
 167      * \r
 168      * @param out\r
 169      */\r
 170     public void marshal(java.io.Writer out)\r
 171         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 172     {\r
 173         \r
 174         Marshaller.marshal(this, out);\r
 175     } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
 176 \r
 177     /**\r
 178      * Method marshal\r
 179      * \r
 180      * \r
 181      * \r
 182      * @param handler\r
 183      */\r
 184     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
 185         throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 186     {\r
 187         \r
 188         Marshaller.marshal(this, handler);\r
 189     } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
 190 \r
 191     /**\r
 192      * Method removeAllJalviewModelSequence2Item\r
 193      * \r
 194      */\r
 195     public void removeAllJalviewModelSequence2Item()\r
 196     {\r
 197         _items.removeAllElements();\r
 198     } //-- void removeAllJalviewModelSequence2Item() \r
 199 \r
 200     /**\r
 201      * Method removeJalviewModelSequence2Item\r
 202      * \r
 203      * \r
 204      * \r
 205      * @param index\r
 206      * @return JalviewModelSequence2Item\r
 207      */\r
 208     public jalview.binding.JalviewModelSequence2Item removeJalviewModelSequence2Item(int index)\r
 209     {\r
 210         java.lang.Object obj = _items.elementAt(index);\r
 211         _items.removeElementAt(index);\r
 212         return (jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) obj;\r
 213     } //-- jalview.binding.JalviewModelSequence2Item removeJalviewModelSequence2Item(int) \r
 214 \r
 215     /**\r
 216      * Method setJalviewModelSequence2Item\r
 217      * \r
 218      * \r
 219      * \r
 220      * @param index\r
 221      * @param vJalviewModelSequence2Item\r
 222      */\r
 223     public void setJalviewModelSequence2Item(int index, jalview.binding.JalviewModelSequence2Item vJalviewModelSequence2Item)\r
 224         throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
 225     {\r
 226         //-- check bounds for index\r
 227         if ((index < 0) || (index > _items.size())) {\r
 228             throw new IndexOutOfBoundsException();\r
 229         }\r
 230         _items.setElementAt(vJalviewModelSequence2Item, index);\r
 231     } //-- void setJalviewModelSequence2Item(int, jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
 232 \r
 233     /**\r
 234      * Method setJalviewModelSequence2Item\r
 235      * \r
 236      * \r
 237      * \r
 238      * @param jalviewModelSequence2ItemArray\r
 239      */\r
 240     public void setJalviewModelSequence2Item(jalview.binding.JalviewModelSequence2Item[] jalviewModelSequence2ItemArray)\r
 241     {\r
 242         //-- copy array\r
 243         _items.removeAllElements();\r
 244         for (int i = 0; i < jalviewModelSequence2ItemArray.length; i++) {\r
 245             _items.addElement(jalviewModelSequence2ItemArray[i]);\r
 246         }\r
 247     } //-- void setJalviewModelSequence2Item(jalview.binding.JalviewModelSequence2Item) \r
 248 \r
 249     /**\r
 250      * Method unmarshal\r
 251      * \r
 252      * \r
 253      * \r
 254      * @param reader\r
 255      * @return Object\r
 256      */\r
 257     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
 258         throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 259     {\r
 260         return (jalview.binding.JalviewModelSequence2) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.JalviewModelSequence2.class, reader);\r
 261     } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
 262 \r
 263     /**\r
 264      * Method validate\r
 265      * \r
 266      */\r
 267     public void validate()\r
 268         throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
 269     {\r
 270         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
 271         validator.validate(this);\r
 272     } //-- void validate() \r
 273 \r
 274 }\r