src/jalview/biojava/dasobert/dasregistry/Das1Source.java

   1 /*
   2  *                    BioJava development code
   3  *
   4  * This code may be freely distributed and modified under the
   5  * terms of the GNU Lesser General Public Licence.  This should
   6  * be distributed with the code.  If you do not have a copy,
   7  * see:
   8  *
   9  *      http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
  10  *
  11  * Copyright for this code is held jointly by the individual
  12  * authors.  These should be listed in @author doc comments.
  13  *
  14  * For more information on the BioJava project and its aims,
  15  * or to join the biojava-l mailing list, visit the home page
  16  * at:
  17  *
  18  *      http://www.biojava.org/
  19  *
  20  * Created on 15.04.2004
  21  * @author Andreas Prlic
  22  *
  23  */
  24 package org.biojava.dasobert.dasregistry;
  25
  26 import java.util.Date ;
  27 import java.io.IOException;
  28 import java.io.PrintWriter;
  29 import java.io.StringWriter;
  30
  31
  32 //import org.biojava.dasobert.das2.io.DasSourceWriter;
  33 //import org.biojava.dasobert.das2.io.DasSourceWriterImpl;
  34 //import org.biojava.utils.xml.PrettyXMLWriter;
  35
  36
  37 /** a simple Bean class to be returned via SOAP
  38  * @author Andreas Prlic
  39  */
  40
  41 public class Das1Source implements DasSource {
  42     String url                ;
  43     protected String nickname           ;
  44     String adminemail         ;
  45     String description        ;
  46     DasCoordinateSystem[] coordinateSystem ;
  47     String[] capabilities     ;
  48     String[] labels           ;
  49     String helperurl          ;
  50     Date   registerDate       ;
  51     Date   leaseDate          ;
  52     String id                 ;
  53     boolean local;
  54
  55     boolean alertAdmin;
  56
  57     public static String EMPTY_ID = "UNK:-1" ;
  58
  59     public Das1Source () {
  60         id               = EMPTY_ID;
  61         url              = "";
  62         adminemail       = "" ;
  63         description      = "" ;
  64         //String empty     = "" ;
  65         nickname         = "" ;
  66         coordinateSystem = new DasCoordinateSystem[0];
  67         //coordinateSystem[0] = new DasCoordinateSystem();
  68         capabilities     =  new String[0];
  69         labels           = new String[0];
  70         //capabilities[0]  = empty ;
  71         registerDate     = new Date() ;
  72         leaseDate        = new Date() ;
  73         helperurl        = "";
  74         local=true;
  75     }
  76
  77
  78     public boolean equals(DasSource other){
  79         System.out.println("Das1Source equals, comparing with other DasSource");
  80         if (! (other instanceof Das1Source))
  81             return false;
  82
  83         Das1Source ods = (Das1Source) other;
  84
  85         if ( ods.getUrl().equals(url))
  86             return true;
  87         if ( ods.getNickname().equals(nickname))
  88             return true;
  89         return false;
  90     }
  91
  92     public int hashCode() {
  93         int h = 7;
  94
  95         h = 31 * h + ( null == nickname ? 0 : nickname.hashCode());
  96         h = 31 * h + ( null == url ? 0 : url.hashCode());
  97
  98         return h;
  99     }
 100
 101     /** the DAS2 string representation of this DAS source
 102      *
 103     public String toString() {
 104
 105         StringWriter writer = new StringWriter();
 106
 107         PrintWriter pw = new PrintWriter(writer);
 108         PrettyXMLWriter xw = new PrettyXMLWriter(pw);
 109
 110         DasSourceWriter dswriter = new DasSourceWriterImpl();
 111         try {
 112             dswriter.writeDasSource(xw,this);
 113         } catch (IOException e){
 114             e.printStackTrace();
 115         }
 116
 117         return writer.toString();
 118
 119     }
 120     */
 121     public void setLocal(boolean flag){ local = flag;}
 122     public boolean isLocal(){return local;}
 123
 124     public void setId(String i) { id = i; }
 125
 126     /** get a the Id of the DasSource. The Id is a unique db
 127      * identifier. The public DAS-Registry has Auto_Ids that look like
 128      * DASSOURCE:12345; public look like XYZ:12345, where the XYZ
 129      * prefix can be configured in the config file.
 130      */
 131     public String getId() { return id;}
 132
 133     public void setNickname(String name) {
 134         nickname = name ;
 135     }
 136     public String getNickname(){
 137         return nickname;
 138     }
 139     public void setUrl(String u) {
 140         char lastChar = u.charAt(u.length()-1);
 141         if ( lastChar  != '/')
 142             u += "/";
 143
 144         url = u ;
 145     }
 146
 147     public void setAdminemail (String u) {
 148         adminemail = u ;
 149     }
 150
 151     public void setDescription (String u) {
 152         description = u;
 153     }
 154
 155     public void setCoordinateSystem (DasCoordinateSystem[] u){
 156         coordinateSystem=u ;
 157     }
 158
 159     public void setCapabilities (String[] u){
 160         capabilities = u ;
 161     }
 162
 163     public String getUrl(){return url;}
 164     public String getAdminemail(){return adminemail;}
 165     public String getDescription(){return description;}
 166     public String[] getCapabilities(){return capabilities;}
 167     public DasCoordinateSystem[] getCoordinateSystem(){return coordinateSystem;}
 168
 169     public void setRegisterDate(Date d) {
 170         registerDate = d;
 171     }
 172     public Date getRegisterDate() {
 173         return registerDate ;
 174     }
 175     public void setLeaseDate(Date d) {
 176         leaseDate =d ;
 177     }
 178     public Date getLeaseDate() {
 179         return leaseDate ;
 180     }
 181
 182     public void setLabels(String[] ls) {
 183         labels = ls ;
 184     }
 185
 186     public String[] getLabels() {
 187         return labels;
 188     }
 189
 190     public void setHelperurl(String url) {
 191         helperurl = url;
 192     }
 193
 194     public String getHelperurl() {
 195         return helperurl;
 196     }
 197
 198     public void setAlertAdmin(boolean flag) {
 199         alertAdmin = flag;
 200     }
 201
 202     public boolean getAlertAdmin() {
 203         return alertAdmin;
 204     }
 205
 206 }