JAL-1372 i18n and tweaking set/unset representative sequence
[jalview.git] / src / jalview / commands / OrderCommand.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
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4  * 
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16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.commands;
22
23 import jalview.analysis.*;
24 import jalview.datamodel.*;
25
26 public class OrderCommand implements CommandI
27 {
28   String description;
29
30   SequenceI[] seqs;
31
32   SequenceI[] seqs2;
33
34   AlignmentI al;
35
36   public OrderCommand(String description, SequenceI[] seqs, AlignmentI al)
37   {
38     this.description = description;
39     this.seqs = seqs;
40     this.seqs2 = al.getSequencesArray();
41     this.al = al;
42     doCommand(null);
43   }
44
45   public String getDescription()
46   {
47     return description;
48   }
49
50   public int getSize()
51   {
52     return 1;
53   }
54
55   public void doCommand(AlignmentI[] views)
56   {
57     AlignmentSorter.setOrder(al, seqs2);
58   }
59
60   public void undoCommand(AlignmentI[] views)
61   {
62     AlignmentSorter.setOrder(al, seqs);
63   }
64 }