src/jalview/datamodel/AlignmentExportData.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 import jalview.api.AlignExportSettingI;
   4
   5 public class AlignmentExportData
   6 {
   7   private AlignmentI alignment;
   8
   9   private String[] omitHidden;
  10
  11   private int[] startEnd;
  12
  13   private AlignExportSettingI settings;
  14
  15   public AlignmentExportData(AlignmentI align, String[] ommit,
  16           int[] startEnd, AlignExportSettingI settings)
  17   {
  18     this.alignment = align;
  19     this.omitHidden = ommit;
  20     this.startEnd = startEnd;
  21     this.settings = settings;
  22   }
  23
  24   public AlignmentI getAlignment()
  25   {
  26     return alignment;
  27   }
  28
  29   public void setAlignment(AlignmentI alignment)
  30   {
  31     this.alignment = alignment;
  32   }
  33
  34   public String[] getOmitHidden()
  35   {
  36     return omitHidden;
  37   }
  38
  39   public void setOmitHidden(String[] omitHidden)
  40   {
  41     this.omitHidden = omitHidden;
  42   }
  43
  44   public int[] getStartEndPostions()
  45   {
  46     return startEnd;
  47   }
  48
  49   public void setStartEndPostions(int[] startEnd)
  50   {
  51     this.startEnd = startEnd;
  52   }
  53
  54   public AlignExportSettingI getSettings()
  55   {
  56     return settings;
  57   }
  58
  59   public void setSettings(AlignExportSettingI settings)
  60   {
  61     this.settings = settings;
  62   }
  63 }