src/jalview/datamodel/Annotation.java

   1 package jalview.datamodel;
   2 import java.awt.*;
   3
   4 public class Annotation
   5 {
   6   public String displayCharacter="";
   7   public String description="";       // currently used as mouse over
   8   public char secondaryStructure=' '; // recognises H and E
   9   public float value;
  10
  11   // add visual cues here
  12   public Color colour = Color.black;
  13
  14   public Annotation(String displayChar, String desc, char ss, float val)
  15   {
  16     displayCharacter = displayChar;
  17     description = desc;
  18     secondaryStructure = ss;
  19     value = val;
  20   }
  21   public Annotation(String displayChar, String desc, char ss, float val, Color colour) {
  22     this(displayChar, desc, ss, val);
  23     this.colour = colour;
  24   }
  25 }