pid and conservation changes
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / Annotation.java
1 package jalview.datamodel;
2 import java.awt.*;
3
4 public class Annotation
5 {
6   public String displayCharacter="";
7   public String description="";       // currently used as mouse over
8   public char secondaryStructure=' '; // recognises H and E
9   public float value;
10
11   // add visual cues here
12   public Color colour = Color.black;
13
14   public Annotation(String displayChar, String desc, char ss, float val)
15   {
16     displayCharacter = displayChar;
17     description = desc;
18     secondaryStructure = ss;
19     value = val;
20   }
21   public Annotation(String displayChar, String desc, char ss, float val, Color colour) {
22     this(displayChar, desc, ss, val);
23     this.colour = colour;
24   }
25 }