src/jalview/datamodel/CigarSimple.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
   3  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.datamodel;
  20
  21 /**
  22  * <p>Title: </p>
  23  *
  24  * <p>Description: </p>
  25  *
  26  * <p>Copyright: Copyright (c) 2004</p>
  27  *
  28  * <p>Company: Dundee University</p>
  29  *
  30  * @author not attributable
  31  * @version 1.0
  32  */
  33 public abstract class CigarSimple
  34     extends CigarBase
  35 {
  36   /**
  37    * Return a symbol sequence with edits (gaps, insertions and deletions) applied
  38    * @param GapChar char
  39    * @return String
  40    */
  41   public abstract String getSequenceString(char GapChar);
  42
  43 }