src/jalview/datamodel/CigarSimple.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel;
  22
  23 public abstract class CigarSimple extends CigarBase
  24 {
  25   /**
  26    * Return a symbol sequence with edits (gaps, insertions and deletions)
  27    * applied
  28    *
  29    * @param GapChar
  30    *          char
  31    * @return String
  32    */
  33   public abstract String getSequenceString(char GapChar);
  34
  35 }