src/jalview/datamodel/ContactMatrixI.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 public interface ContactMatrixI
   4 {
   5
   6   ContactListI getContactList(int column);
   7
   8   float getMin();
   9
  10   float getMax();
  11
  12   boolean hasReferenceSeq();
  13
  14   SequenceI getReferenceSeq();
  15
  16   String getAnnotDescr();
  17
  18   String getAnnotLabel();
  19
  20   /**
  21    * string indicating how the contactMatrix should be rendered - stored in
  22    * calcId
  23    *
  24    * @return
  25    */
  26   String getType();
  27
  28   int getWidth();
  29
  30   int getHeight();
  31
  32 }