JAL-4027 JAL-3858 rename CUSTOM_RENDERER to CONTACT_MATRIX annotation.graph type...
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / ContactMatrixI.java
1 package jalview.datamodel;
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3 public interface ContactMatrixI
4 {
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6   ContactListI getContactList(int column);
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8   float getMin();
9
10   float getMax();
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12   boolean hasReferenceSeq();
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14   SequenceI getReferenceSeq();
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16   String getAnnotDescr();
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18   String getAnnotLabel();
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20   /**
21    * string indicating how the contactMatrix should be rendered - stored in calcId
22    * @return 
23    */
24   String getType();
25
26 }