src/jalview/datamodel/ContactMatrixTest.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 import java.awt.Color;
   4
   5 public class ContactMatrixTest implements ContactMatrixI
   6 {
   7   private int width = 0;
   8
   9   public ContactMatrixTest(int width)
  10   {
  11     this.width = width;
  12   }
  13   @Override
  14   public ContactListI getContactList(final int column)
  15   {
  16     if (column<0 || column >= width)
  17     {
  18       return null;
  19     }
  20     return new ContactListI() {
  21       int p = column;
  22       @Override
  23       public Color getColorForScore(int column)
  24       {
  25         return jalview.util.ColorUtils.getGraduatedColour(Math.abs(column-p), 0, Color.white, width, Color.magenta);
  26       }
  27       @Override
  28       public Color getColorForRange(int i, int j)
  29       {
  30         return jalview.util.ColorUtils.getGraduatedColour(
  31                 Math.abs(j + i - 2 * p) / 2, 0, Color.white, width,
  32                 Color.magenta);
  33       }
  34
  35       @Override
  36       public int getColumnWidth()
  37       {
  38         return 1;
  39       }
  40       @Override
  41       public int getContactHeight()
  42       {
  43         return width;
  44
  45       }
  46
  47       @Override
  48       public double getContactAt(int column)
  49       {
  50         return Math.abs(column - p);
  51       }
  52     };
  53   }
  54
  55 }