debug dialog
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / FeatureProperties.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  * \r
5  * This file is part of Jalview.\r
6  * \r
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
10  * \r
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
15  * \r
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
17  */\r
18 package jalview.datamodel;\r
19 \r
20 /**\r
21  * A set of feature property constants used by jalview\r
22  * \r
23  * @author JimP\r
24  * \r
25  */\r
26 public class FeatureProperties\r
27 {\r
28 \r
29   public static final String EXONPOS = "exon number";\r
30 \r
31   public static final String EXONPRODUCT = "product";\r
32 \r
33   /**\r
34    * lookup feature type for a particular database to see if its a coding region\r
35    * feature\r
36    * \r
37    * @param dbrefsource\r
38    * @param string\r
39    * @return\r
40    */\r
41   public static boolean isCodingFeature(String dbrefsource, String type)\r
42   {\r
43     return ((dbrefsource == null\r
44             || dbrefsource.equalsIgnoreCase(DBRefSource.EMBL) || dbrefsource\r
45             .equalsIgnoreCase(DBRefSource.EMBLCDS)) && type\r
46             .equalsIgnoreCase("CDS"));\r
47   }\r
48 }\r