src/jalview/datamodel/FeatureProperties.java

   1 package jalview.datamodel;\r
   2 \r
   3 /**\r
   4  * A set of feature property constants used by jalview\r
   5  * @author JimP\r
   6  *\r
   7  */\r
   8 public class FeatureProperties\r
   9 {\r
  10 \r
  11   public static final String EXONPOS = "exon number";\r
  12   public static final String EXONPRODUCT = "product";\r
  13   /**\r
  14    * lookup feature type for a particular database to see if its a coding region feature\r
  15    * @param dbrefsource\r
  16    * @param string\r
  17    * @return\r
  18    */\r
  19   public static boolean isCodingFeature(String dbrefsource, String type)\r
  20   {\r
  21     return ((dbrefsource==null || dbrefsource.equalsIgnoreCase(DBRefSource.EMBL))\r
  22             && type.equalsIgnoreCase("CDS"));\r
  23   }\r
  24 }\r