src/jalview/datamodel/HistoryItem.java

   1 package jalview.datamodel;\r
   2 \r
   3 import java.util.*;\r
   4 \r
   5 public class HistoryItem\r
   6 {\r
   7   public static final int EDIT = 0;\r
   8   public static final int SORT = 1;\r
   9   public static final int HIDE = 2;\r
  10   public static final int PASTE= 3;\r
  11 \r
  12   final int type;\r
  13   Vector sequences;\r
  14   Vector alignIndex;\r
  15   String description;\r
  16   Vector hiddenSeqs;\r
  17 \r
  18   public HistoryItem(String description, AlignmentI al, int type)\r
  19   {\r
  20     this.type = type;\r
  21     this.description = description;\r
  22     sequences = new Vector();\r
  23     alignIndex = new Vector();\r
  24     hiddenSeqs = new Vector();\r
  25 \r
  26     for (int i = 0; i < al.getHeight(); i++)\r
  27     {\r
  28       SequenceI seq = al.getSequenceAt(i);\r
  29       sequences.addElement(seq);\r
  30       alignIndex.addElement(i + "");\r
  31       hiddenSeqs.addElement(seq.getSequence().toString());\r
  32     }\r
  33   }\r
  34 \r
  35   public int getType()\r
  36   {return type;}\r
  37 \r
  38   public Vector getSequences()\r
  39   {return sequences;}\r
  40 \r
  41   public String getDescription()\r
  42   {return description; }\r
  43 \r
  44   public Vector getHidden()\r
  45   { return hiddenSeqs; }\r
  46 \r
  47   public int getAlignIndex(int seq)\r
  48   {\r
  49     return Integer.parseInt(alignIndex.elementAt(seq).toString());\r
  50   }\r
  51 \r
  52 }\r