src/jalview/datamodel/MappingType.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 /**
   4  * An enumeration of the kinds of mapping (from nucleotide or peptide, to
   5  * nucleotide or peptide), and the corresponding word lengths
   6  */
   7 public enum MappingType
   8 {
   9   NucleotideToPeptide(3, 1)
  10   {
  11     @Override
  12     public MappingType getInverse()
  13     {
  14       return PeptideToNucleotide;
  15     }
  16   },
  17   PeptideToNucleotide(1, 3)
  18   {
  19     @Override
  20     public MappingType getInverse()
  21     {
  22       return NucleotideToPeptide;
  23     }
  24   },
  25   NucleotideToNucleotide(1, 1)
  26   {
  27     @Override
  28     public MappingType getInverse()
  29     {
  30       return NucleotideToNucleotide;
  31     }
  32   },
  33   PeptideToPeptide(1, 1)
  34   {
  35     @Override
  36     public MappingType getInverse()
  37     {
  38       return PeptideToPeptide;
  39     }
  40   };
  41
  42   private int fromRatio;
  43
  44   private int toRatio;
  45
  46   private MappingType(int fromSize, int toSize)
  47   {
  48     fromRatio = fromSize;
  49     toRatio = toSize;
  50   }
  51
  52   public abstract MappingType getInverse();
  53
  54   public int getFromRatio()
  55   {
  56     return fromRatio;
  57   }
  58
  59   public int getToRatio()
  60   {
  61     return toRatio;
  62   }
  63 }