src/jalview/datamodel/SearchResultMatchI.java

   1 package jalview.datamodel;
   2
   3 /**
   4  * An interface that describes one matched region of an alignment, as one
   5  * contiguous portion of a single dataset sequence
   6  */
   7 public interface SearchResultMatchI
   8 {
   9   /**
  10    * Returns the matched sequence
  11    *
  12    * @return
  13    */
  14   SequenceI getSequence();
  15
  16   /**
  17    * Returns the start position of the match in the sequence (base 1)
  18    *
  19    * @return
  20    */
  21   int getStart();
  22
  23   /**
  24    * Returns the end position of the match in the sequence (base 1)
  25    *
  26    * @return
  27    */
  28   int getEnd();
  29
  30 }