JAL-1834 removed quotes around truncated strings with ellipsis
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / SequencePoint.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.datamodel;
22
23 /**
24  * DOCUMENT ME!
25  * 
26  * @author $author$
27  * @version $Revision$
28  */
29 public class SequencePoint
30 {
31   // SMJS PUBLIC
32   /**
33    * for points with no real physical association with an alignment sequence
34    */
35   public boolean isPlaceholder = false;
36
37   /**
38    * Associated alignment sequence, or dummy sequence object.
39    */
40   public SequenceI sequence;
41
42   /**
43    * array of coordinates in embedded sequence space.
44    */
45   public float[] coord;
46
47   // SMJS ENDPUBLIC
48   public SequencePoint(SequenceI sequence, float[] coord)
49   {
50     this.sequence = sequence;
51     this.coord = coord;
52   }
53 }