Associate trees with views
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / UniprotEntry.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  *\r
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
9  *\r
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
13  * GNU General Public License for more details.\r
14  *\r
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
18  */\r
19 package jalview.datamodel;\r
20 \r
21 import java.util.*;\r
22 \r
23 public class UniprotEntry\r
24 {\r
25 \r
26   UniprotSequence sequence;\r
27   Vector name;\r
28   Vector accession;\r
29   Vector feature;\r
30   Vector dbrefs;\r
31   UniprotProteinName protName;\r
32 \r
33   public void setAccession(Vector items)\r
34   {\r
35     accession = items;\r
36   }\r
37 \r
38   public void setFeature(Vector items)\r
39   {\r
40        feature = items;\r
41    }\r
42 \r
43    public Vector getFeature() {\r
44        return feature;\r
45    }\r
46 \r
47 \r
48    public Vector getAccession()\r
49    {\r
50      return accession;\r
51    }\r
52 \r
53    public void setProtein(UniprotProteinName names)\r
54    {\r
55      protName = names;\r
56    }\r
57 \r
58 \r
59    public UniprotProteinName getProtein()\r
60    {\r
61      return protName;\r
62    }\r
63 \r
64   public void setName(Vector na)\r
65   {\r
66     name = na;\r
67   }\r
68   public Vector getName()\r
69   {\r
70     return name;\r
71   }\r
72 \r
73   public UniprotSequence getUniprotSequence()\r
74   {\r
75     return sequence;\r
76   }\r
77 \r
78   public void setUniprotSequence(UniprotSequence seq)\r
79   {\r
80     sequence = seq;\r
81   }\r
82 \r
83   public Vector getDbReference()\r
84   {\r
85     return dbrefs;\r
86   }\r
87 \r
88   public void setDbReference(Vector dbref)\r
89   {\r
90    this.dbrefs = dbref;\r
91   }\r
92 \r
93 }\r