src/jalview/datamodel/UniprotEntry.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.datamodel;\r
  20 \r
  21 import java.util.*;\r
  22 \r
  23 public class UniprotEntry\r
  24 {\r
  25 \r
  26   UniprotSequence sequence;\r
  27   Vector name;\r
  28   Vector accession;\r
  29   Vector feature;\r
  30   Vector dbrefs;\r
  31   UniprotProteinName protName;\r
  32 \r
  33   public void setAccession(Vector items)\r
  34   {\r
  35     accession = items;\r
  36   }\r
  37 \r
  38   public void setFeature(Vector items)\r
  39   {\r
  40        feature = items;\r
  41    }\r
  42 \r
  43    public Vector getFeature() {\r
  44        return feature;\r
  45    }\r
  46 \r
  47 \r
  48    public Vector getAccession()\r
  49    {\r
  50      return accession;\r
  51    }\r
  52 \r
  53    public void setProtein(UniprotProteinName names)\r
  54    {\r
  55      protName = names;\r
  56    }\r
  57 \r
  58 \r
  59    public UniprotProteinName getProtein()\r
  60    {\r
  61      return protName;\r
  62    }\r
  63 \r
  64   public void setName(Vector na)\r
  65   {\r
  66     name = na;\r
  67   }\r
  68   public Vector getName()\r
  69   {\r
  70     return name;\r
  71   }\r
  72 \r
  73   public UniprotSequence getUniprotSequence()\r
  74   {\r
  75     return sequence;\r
  76   }\r
  77 \r
  78   public void setUniprotSequence(UniprotSequence seq)\r
  79   {\r
  80     sequence = seq;\r
  81   }\r
  82 \r
  83   public Vector getDbReference()\r
  84   {\r
  85     return dbrefs;\r
  86   }\r
  87 \r
  88   public void setDbReference(Vector dbref)\r
  89   {\r
  90    this.dbrefs = dbref;\r
  91   }\r
  92 \r
  93 }\r