src/jalview/datamodel/UniprotEntry.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.datamodel;
  20
  21 import java.util.*;
  22
  23 public class UniprotEntry
  24 {
  25
  26   UniprotSequence sequence;
  27   Vector name;
  28   Vector accession;
  29   Vector feature;
  30   Vector dbrefs;
  31   UniprotProteinName protName;
  32
  33   public void setAccession(Vector items)
  34   {
  35     accession = items;
  36   }
  37
  38   public void setFeature(Vector items)
  39   {
  40        feature = items;
  41    }
  42
  43    public Vector getFeature() {
  44        return feature;
  45    }
  46
  47
  48    public Vector getAccession()
  49    {
  50      return accession;
  51    }
  52
  53    public void setProtein(UniprotProteinName names)
  54    {
  55      protName = names;
  56    }
  57
  58
  59    public UniprotProteinName getProtein()
  60    {
  61      return protName;
  62    }
  63
  64   public void setName(Vector na)
  65   {
  66     name = na;
  67   }
  68   public Vector getName()
  69   {
  70     return name;
  71   }
  72
  73   public UniprotSequence getUniprotSequence()
  74   {
  75     return sequence;
  76   }
  77
  78   public void setUniprotSequence(UniprotSequence seq)
  79   {
  80     sequence = seq;
  81   }
  82
  83   public Vector getDbReference()
  84   {
  85     return dbrefs;
  86   }
  87
  88   public void setDbReference(Vector dbref)
  89   {
  90    this.dbrefs = dbref;
  91   }
  92
  93 }