src/jalview/datamodel/UniprotEntry.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.datamodel;\r
  20 \r
  21 import java.util.*;\r
  22 \r
  23 public class UniprotEntry\r
  24 {\r
  25 \r
  26   UniprotSequence sequence;\r
  27   Vector name;\r
  28   Vector accession;\r
  29   Vector feature;\r
  30   Vector dbrefs;\r
  31   Vector proteinName;\r
  32 \r
  33   public void setAccession(Vector items)\r
  34   {\r
  35     accession = items;\r
  36   }\r
  37 \r
  38   public void setFeature(Vector items)\r
  39   {\r
  40        feature = items;\r
  41    }\r
  42 \r
  43    public Vector getFeature() {\r
  44        return feature;\r
  45    }\r
  46 \r
  47 \r
  48    public Vector getAccession()\r
  49    {\r
  50      return accession;\r
  51    }\r
  52 \r
  53    public void setProteinName(Vector items)\r
  54    {\r
  55      proteinName = items;\r
  56    }\r
  57 \r
  58    public Vector getProteinName()\r
  59    {\r
  60      return proteinName;\r
  61    }\r
  62 \r
  63   public void setName(Vector na)\r
  64   {\r
  65     name = na;\r
  66   }\r
  67   public Vector getName()\r
  68   {\r
  69     return name;\r
  70   }\r
  71 \r
  72   public UniprotSequence getUniprotSequence()\r
  73   {\r
  74     return sequence;\r
  75   }\r
  76 \r
  77   public void setUniprotSequence(UniprotSequence seq)\r
  78   {\r
  79     sequence = seq;\r
  80   }\r
  81 \r
  82   public Vector getDbReference()\r
  83   {\r
  84     return dbrefs;\r
  85   }\r
  86 \r
  87   public void setDbReference(Vector dbref)\r
  88   {\r
  89    this.dbrefs = dbref;\r
  90   }\r
  91 \r
  92 }\r