src/jalview/datamodel/UniprotSequence.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
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  17  */
  18 package jalview.datamodel;
  19
  20 public class UniprotSequence
  21 {
  22   /**
  23    * internal content storage
  24    */
  25   private java.lang.String _content = "";
  26
  27   public void setContent(String seq)
  28   {
  29     StringBuffer sb = new StringBuffer();
  30     for (int i = 0; i < seq.length(); i++)
  31     {
  32       if (seq.charAt(i) != ' ')
  33       {
  34         sb.append(seq.charAt(i));
  35       }
  36     }
  37     _content = sb.toString();
  38   }
  39
  40   public String getContent()
  41   {
  42     return _content;
  43   }
  44
  45 }