src/jalview/datamodel/UniprotSequence.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.datamodel;
  20
  21 public class UniprotSequence
  22 {
  23     /**
  24    * internal content storage
  25    */
  26   private java.lang.String _content = "";
  27
  28   public void setContent(String seq)
  29   {
  30     StringBuffer sb = new StringBuffer();
  31     for(int i=0; i<seq.length(); i++)
  32       if(seq.charAt(i)!=' ')
  33       {
  34         sb.append(seq.charAt(i));
  35       }
  36     _content = sb.toString();
  37   }
  38
  39   public String getContent()
  40   { return _content; }
  41
  42 }