src/jalview/datamodel/UniprotSequence.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.datamodel;\r
  20 \r
  21 public class UniprotSequence\r
  22 {\r
  23   /**\r
  24    * internal content storage\r
  25    */\r
  26   private java.lang.String _content = "";\r
  27 \r
  28   public void setContent(String seq)\r
  29   {\r
  30     StringBuffer sb = new StringBuffer();\r
  31     for (int i = 0; i < seq.length(); i++)\r
  32     {\r
  33       if (seq.charAt(i) != ' ')\r
  34       {\r
  35         sb.append(seq.charAt(i));\r
  36       }\r
  37     }\r
  38     _content = sb.toString();\r
  39   }\r
  40 \r
  41   public String getContent()\r
  42   {\r
  43     return _content;\r
  44   }\r
  45 \r
  46 }\r