src/jalview/datamodel/annotations/AlphaFoldAnnotationRowBuilder.java

   1 package jalview.datamodel.annotations;
   2
   3 import jalview.datamodel.Annotation;
   4
   5 public class AlphaFoldAnnotationRowBuilder extends AnnotationRowBuilder
   6 {
   7   public AlphaFoldAnnotationRowBuilder()
   8   {
   9     super("Alphafold Reliability");
  10     min = 0;
  11     max = 100;
  12     hasMinMax = true;
  13   }
  14
  15   @Override
  16   public void processAnnotation(Annotation annotation)
  17   {
  18     if (annotation.value > 90)
  19     {
  20       // Very High
  21       annotation.colour = new java.awt.Color(0, 83, 214);
  22     }
  23     if (annotation.value <= 90)
  24     {
  25       // High
  26       annotation.colour = new java.awt.Color(101, 203, 243);
  27     }
  28     if (annotation.value <= 70)
  29     {
  30       // Confident
  31       annotation.colour = new java.awt.Color(255, 219, 19);
  32     }
  33     if (annotation.value < 50)
  34     {
  35       annotation.colour = new java.awt.Color(255, 125, 69);
  36     }
  37   }
  38 }