src/jalview/datamodel/xdb/embl/Qualifier.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
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  17  */
  18 package jalview.datamodel.xdb.embl;
  19
  20 public class Qualifier
  21 {
  22   String name;
  23
  24   String[] values;
  25
  26   String[] evidence;
  27
  28   /**
  29    * @return the name
  30    */
  31   public String getName()
  32   {
  33     return name;
  34   }
  35
  36   /**
  37    * @param name
  38    *          the name to set
  39    */
  40   public void setName(String name)
  41   {
  42     this.name = name;
  43   }
  44
  45   /**
  46    * @return the values
  47    */
  48   public String[] getValues()
  49   {
  50     return values;
  51   }
  52
  53   /**
  54    * @param values
  55    *          the values to set
  56    */
  57   public void setValues(String[] values)
  58   {
  59     this.values = values;
  60   }
  61
  62   public void addEvidence(String qevidence)
  63   {
  64     if (evidence == null)
  65     {
  66       evidence = new String[1];
  67     }
  68     else
  69     {
  70       String[] temp = new String[evidence.length + 1];
  71       System.arraycopy(evidence, 0, temp, 0, evidence.length);
  72       evidence = temp;
  73     }
  74     evidence[evidence.length - 1] = qevidence;
  75   }
  76
  77   public void addValues(String value)
  78   {
  79     if (values == null)
  80     {
  81       values = new String[1];
  82     }
  83     else
  84     {
  85       String[] temp = new String[values.length + 1];
  86       System.arraycopy(values, 0, temp, 0, values.length);
  87       values = temp;
  88     }
  89     values[values.length - 1] = value;
  90   }
  91
  92   /**
  93    * @return the evidence
  94    */
  95   public String[] getEvidence()
  96   {
  97     return evidence;
  98   }
  99
 100   /**
 101    * @param evidence
 102    *          the evidence to set
 103    */
 104   public void setEvidence(String[] evidence)
 105   {
 106     this.evidence = evidence;
 107   }
 108 }