src/jalview/ext/archaeopteryx/AptxTreePanel.java

   1 package jalview.ext.archaeopteryx;
   2
   3 import jalview.ext.treeviewer.ExternalTreeI;
   4 import jalview.ext.treeviewer.ExternalTreeNodeI;
   5 import jalview.ext.treeviewer.ExternalTreePanel;
   6
   7 import java.io.File;
   8 import java.util.Set;
   9
  10 public class AptxTreePanel extends ExternalTreePanel
  11 {
  12   private final org.forester.archaeopteryx.TreePanel treeView;
  13
  14   public AptxTreePanel(org.forester.archaeopteryx.TreePanel aptxTreePanel)
  15   {
  16     treeView = aptxTreePanel;
  17
  18   }
  19
  20   @Override
  21   public void setTreeFile(File file)
  22   {
  23     treeView.setTreeFile(file);
  24   }
  25
  26   @Override
  27   public ExternalTreeI getTree()
  28   {
  29     return new Tree(treeView.getPhylogeny());
  30   }
  31
  32   @Override
  33   public File getTreeFile()
  34   {
  35     return treeView.getTreeFile();
  36   }
  37
  38   @Override
  39   public ExternalTreeNodeI findNode(int x, int y)
  40   {
  41     return new TreeNode(treeView.findNode(x, y));
  42   }
  43
  44   @Override
  45   public void setMatchingNodes(Set<Long> hashSet)
  46   {
  47     treeView.setFoundNodes0(hashSet);
  48
  49   }
  50
  51   @Override
  52   public Set<Long> getMatchingNodes()
  53   {
  54     return treeView.getFoundNodes0();
  55   }
  56 }