src/jalview/ext/archaeopteryx/ExternalLoadedTreeAssociationI.java

   1 package jalview.ext.archaeopteryx;
   2
   3 import jalview.datamodel.SequenceI;
   4
   5 /**
   6  * Interface for associating the leaves of a loaded in (not calculated) tree to
   7  * the alignment sequences in Jalview. Note that this will take anything as a
   8  * Tree object as no assumptions can be made about the inheritance structure of
   9  * Tree (besides being an Object).
  10  *
  11  * @author kjvanderheide
  12  *
  13  * @param <T>
  14  *          Tree object.
  15  */
  16 interface ExternalLoadedTreeAssociationI<T>
  17 {
  18   public void associateLeavesToSequences(SequenceI[] seqs, T tree);
  19 }