src/jalview/ext/ensembl/EnsemblGenomes.java

   1 package jalview.ext.ensembl;
   2
   3 /**
   4  * A class to behave much like EnsemblGene but referencing the ensemblgenomes
   5  * domain and data
   6  *
   7  * @author gmcarstairs
   8  *
   9  */
  10 public class EnsemblGenomes extends EnsemblGene
  11 {
  12   /**
  13    * Constructor sets domain to rest.ensemblgenomes.org instead of the 'usual'
  14    * rest.ensembl.org
  15    */
  16   public EnsemblGenomes()
  17   {
  18     super(ENSEMBL_GENOMES_REST);
  19   }
  20
  21   @Override
  22   public boolean isGeneIdentifier(String query)
  23   {
  24     return true;
  25   }
  26
  27   @Override
  28   public String getDbName()
  29   {
  30     return "EnsemblGenomes";
  31   }
  32
  33   @Override
  34   public String getTestQuery()
  35   {
  36     return "DDB_G0283883";
  37   }
  38
  39   @Override
  40   public String getDbSource()
  41   {
  42     return "EnsemblGenomes";
  43   }
  44
  45 }