src/jalview/ext/ensembl/EnsemblGenomes.java

   1 package jalview.ext.ensembl;
   2
   3
   4 /**
   5  * A class to behave much like EnsemblGene but referencing the ensemblgenomes
   6  * domain and data
   7  *
   8  * @author gmcarstairs
   9  *
  10  */
  11 public class EnsemblGenomes extends EnsemblGene
  12 {
  13   /**
  14    * Constructor sets domain to rest.ensemblgenomes.org instead of the 'usual'
  15    * rest.ensembl.org
  16    */
  17   public EnsemblGenomes()
  18   {
  19     super(ENSEMBL_GENOMES_REST);
  20   }
  21
  22   @Override
  23   public boolean isGeneIdentifier(String query)
  24   {
  25     return true;
  26   }
  27
  28   @Override
  29   public String getDbName()
  30   {
  31     return "EnsemblGenomes";
  32   }
  33
  34   @Override
  35   public String getTestQuery()
  36   {
  37     return "DDB_G0283883";
  38   }
  39
  40   @Override
  41   public String getDbSource()
  42   {
  43     return "EnsemblGenomes";
  44   }
  45
  46 }