src/jalview/ext/ensembl/EnsemblInfo.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ext.ensembl;
  22
  23 /**
  24  * A data class to model the data and rest version of one Ensembl domain,
  25  * currently for rest.ensembl.org and rest.ensemblgenomes.org
  26  *
  27  * @author gmcarstairs
  28  */
  29 class EnsemblInfo
  30 {
  31   /*
  32    * The http domain this object is holding data values for
  33    */
  34   String domain;
  35
  36   /*
  37    * The latest version Jalview has tested for, e.g. "4.5"; a minor version change should be
  38    * ok, a major version change may break stuff
  39    */
  40   String expectedRestVersion;
  41
  42   /*
  43    * Major / minor / point version e.g. "4.5.1"
  44    * @see http://rest.ensembl.org/info/rest/?content-type=application/json
  45    */
  46   String restVersion;
  47
  48   /*
  49    * data version
  50    * @see http://rest.ensembl.org/info/data/?content-type=application/json
  51    */
  52   String dataVersion;
  53
  54   /*
  55    * true when http://rest.ensembl.org/info/ping/?content-type=application/json
  56    * returns response code 200 and not {"error":"Database is unavailable"}
  57    */
  58   boolean restAvailable;
  59
  60   /*
  61    * absolute time when availability was last checked
  62    */
  63   long lastAvailableCheckTime;
  64
  65   /*
  66    * absolute time when version numbers were last checked
  67    */
  68   long lastVersionCheckTime;
  69
  70   // flag set to true if REST major version is not the one expected
  71   boolean restMajorVersionMismatch;
  72
  73   /**
  74    * Constructor given expected REST version number e.g 4.5 or 3.4.3
  75    *
  76    * @param restExpected
  77    */
  78   EnsemblInfo(String theDomain, String restExpected)
  79   {
  80     domain = theDomain;
  81     expectedRestVersion = restExpected;
  82     lastAvailableCheckTime = -1;
  83     lastVersionCheckTime = -1;
  84   }
  85
  86 }