src/jalview/ext/ensembl/Species.java

   1 package jalview.ext.ensembl;
   2
   3 /**
   4  * Selected species identifiers used by Ensembl
   5  *
   6  * @author gmcarstairs
   7  * @see http://rest.ensembl.org/info/species?content-type=text/xml
   8  */
   9 enum Species
  10 {
  11   /*
  12    * using any suitably readable alias as the enum name; these are all
  13    * valid species parameters to Ensembl REST services where applicable
  14    */
  15   human(true), mouse(true), s_cerevisiae(true), cow(false), pig(false),
  16   rat(true), celegans(true), sheep(false), horse(false), gorilla(false),
  17   rabbit(false), gibbon(false), dog(false), orangutan(false),
  18   xenopus(true), chimpanzee(false), cat(false), zebrafish(true), chicken(
  19           true), dmelanogaster(true);
  20
  21   boolean modelOrganism;
  22
  23   private Species(boolean model)
  24   {
  25     this.modelOrganism = model;
  26   }
  27
  28   boolean isModelOrganism()
  29   {
  30     return modelOrganism;
  31   }
  32 }