src/jalview/ext/treeviewer/ExternalTreeI.java

   1 package jalview.ext.treeviewer;
   2
   3 import java.util.Iterator;
   4
   5 public interface ExternalTreeI
   6 {
   7   public ExternalTreeNodeI getRoot();
   8
   9   public ExternalTreeNodeI getNodeWithName(String name);
  10
  11   public ExternalTreeNodeI getFurthestNode();
  12
  13   public String[] getAllLeafNames();
  14
  15   public void setTreeName(String treeTitle);
  16
  17   public void setRerootable(boolean b);
  18
  19   public void setRooted(boolean b);
  20
  21   public boolean isEmpty();
  22
  23   public String getTreeName();
  24
  25   public void setRoot(ExternalTreeNodeI rootNode);
  26
  27   public double getHeight(boolean adjustForCollapsedSubtrees);
  28
  29   public Iterator<ExternalTreeNodeI> iterateInPreOrder();
  30
  31   public Iterator<ExternalTreeNodeI> iterateInLevelOrder();
  32
  33   public Iterator<ExternalTreeNodeI> iterateInPostOrder();
  34
  35   public ExternalTreeFrame createInstanceFromTree(String instanceTitle);
  36
  37
  38 }