src/jalview/gui/AlignmentPanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.datamodel.*;\r
  22 \r
  23 import jalview.jbgui.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.schemes.*;\r
  26 \r
  27 import java.awt.*;\r
  28 import java.awt.event.*;\r
  29 import java.awt.print.*;\r
  30 \r
  31 import java.io.*;\r
  32 \r
  33 import javax.swing.*;\r
  34 \r
  35 \r
  36 /**\r
  37  * DOCUMENT ME!\r
  38  *\r
  39  * @author $author$\r
  40  * @version $Revision$\r
  41  */\r
  42 public class AlignmentPanel extends GAlignmentPanel\r
  43     implements AdjustmentListener, Printable\r
  44 {\r
  45   public AlignViewport av;\r
  46   OverviewPanel overviewPanel;\r
  47   SeqPanel seqPanel;\r
  48   IdPanel idPanel;\r
  49   IdwidthAdjuster idwidthAdjuster;\r
  50 \r
  51   /** DOCUMENT ME!! */\r
  52   public AlignFrame alignFrame;\r
  53   ScalePanel scalePanel;\r
  54   AnnotationPanel annotationPanel;\r
  55   AnnotationLabels alabels;\r
  56 \r
  57   // this value is set false when selection area being dragged\r
  58   boolean fastPaint = true;\r
  59   int hextent = 0;\r
  60   int vextent = 0;\r
  61 \r
  62   /**\r
  63    * Creates a new AlignmentPanel object.\r
  64    *\r
  65    * @param af DOCUMENT ME!\r
  66    * @param av DOCUMENT ME!\r
  67    */\r
  68   public AlignmentPanel(AlignFrame af, final AlignViewport av)\r
  69   {\r
  70     alignFrame = af;\r
  71     this.av = av;\r
  72     seqPanel = new SeqPanel(av, this);\r
  73     idPanel = new IdPanel(av, this);\r
  74 \r
  75     scalePanel = new ScalePanel(av, this);\r
  76 \r
  77     idPanelHolder.add(idPanel, BorderLayout.CENTER);\r
  78     idwidthAdjuster = new IdwidthAdjuster(this);\r
  79     idSpaceFillerPanel1.add(idwidthAdjuster, BorderLayout.CENTER);\r
  80 \r
  81     annotationPanel = new AnnotationPanel(this);\r
  82     alabels = new AnnotationLabels(this);\r
  83 \r
  84 \r
  85     annotationScroller.setViewportView(annotationPanel);\r
  86     annotationSpaceFillerHolder.add(alabels, BorderLayout.CENTER);\r
  87 \r
  88     fontChanged();\r
  89 \r
  90     scalePanelHolder.add(scalePanel, BorderLayout.CENTER);\r
  91     seqPanelHolder.add(seqPanel, BorderLayout.CENTER);\r
  92 \r
  93     setScrollValues(0, 0);\r
  94 \r
  95     adjustAnnotationHeight();\r
  96 \r
  97     setAnnotationVisible(av.getShowAnnotation());\r
  98 \r
  99     hscroll.addAdjustmentListener(this);\r
 100     vscroll.addAdjustmentListener(this);\r
 101 \r
 102     af.addKeyListener(new KeyAdapter()\r
 103     {\r
 104       public void keyPressed(KeyEvent evt)\r
 105       {\r
 106         if(av.cursorMode\r
 107            && evt.getKeyCode()>=KeyEvent.VK_0\r
 108            && evt.getKeyCode()<=KeyEvent.VK_9)\r
 109         {\r
 110           seqPanel.numberPressed(evt.getKeyChar());\r
 111         }\r
 112 \r
 113         switch (evt.getKeyCode())\r
 114         {\r
 115           case 27: // escape key\r
 116             alignFrame.deselectAllSequenceMenuItem_actionPerformed(null);\r
 117 \r
 118             break;\r
 119 \r
 120           case KeyEvent.VK_DOWN:\r
 121             if(av.cursorMode)\r
 122             {\r
 123               seqPanel.moveCursor(0,1);\r
 124             }\r
 125             else\r
 126               alignFrame.moveSelectedSequences(false);\r
 127             break;\r
 128 \r
 129           case KeyEvent.VK_UP:\r
 130             if (av.cursorMode)\r
 131             {\r
 132               seqPanel.moveCursor(0,-1);\r
 133             }\r
 134             else\r
 135               alignFrame.moveSelectedSequences(true);\r
 136             break;\r
 137 \r
 138           case KeyEvent.VK_LEFT:\r
 139             if(av.cursorMode)\r
 140             {\r
 141               seqPanel.moveCursor(-1,0);\r
 142             }\r
 143             break;\r
 144 \r
 145           case KeyEvent.VK_RIGHT:\r
 146             if (av.cursorMode)\r
 147             {\r
 148               seqPanel.moveCursor(1,0);\r
 149             }\r
 150             break;\r
 151 \r
 152           case KeyEvent.VK_SPACE:\r
 153             if(av.cursorMode)\r
 154             {\r
 155               seqPanel.insertGapAtCursor(evt.isControlDown() || evt.isShiftDown());\r
 156             }\r
 157             break;\r
 158 \r
 159           case KeyEvent.VK_DELETE:\r
 160           case KeyEvent.VK_BACK_SPACE:\r
 161             if(!av.cursorMode)\r
 162             {\r
 163               alignFrame.cut_actionPerformed(null);\r
 164             }\r
 165             else\r
 166               seqPanel.deleteGapAtCursor(evt.isControlDown() || evt.isShiftDown());\r
 167 \r
 168             break;\r
 169 \r
 170           case KeyEvent.VK_S:\r
 171             if(av.cursorMode)\r
 172             {\r
 173               seqPanel.setCursorRow();\r
 174             }\r
 175             break;\r
 176           case KeyEvent.VK_C:\r
 177             if(av.cursorMode && !evt.isControlDown())\r
 178             {\r
 179               seqPanel.setCursorColumn();\r
 180             }\r
 181             break;\r
 182           case KeyEvent.VK_P:\r
 183             if(av.cursorMode)\r
 184             {\r
 185               seqPanel.setCursorPosition();\r
 186             }\r
 187             break;\r
 188 \r
 189           case KeyEvent.VK_ENTER:\r
 190           case KeyEvent.VK_COMMA:\r
 191             if(av.cursorMode)\r
 192             {\r
 193               seqPanel.setCursorRowAndColumn();\r
 194             }\r
 195             break;\r
 196 \r
 197           case KeyEvent.VK_Q:\r
 198             if(av.cursorMode)\r
 199             {\r
 200               seqPanel.setSelectionAreaAtCursor(true);\r
 201             }\r
 202             break;\r
 203           case KeyEvent.VK_M:\r
 204             if(av.cursorMode)\r
 205             {\r
 206               seqPanel.setSelectionAreaAtCursor(false);\r
 207             }\r
 208             break;\r
 209 \r
 210          case KeyEvent.VK_F2:\r
 211            av.cursorMode = ! av.cursorMode;\r
 212            alignFrame.statusBar.setText("Keyboard editing mode is "+\r
 213                (av.cursorMode ? "on" : "off"));\r
 214            if(av.cursorMode)\r
 215            {\r
 216              seqPanel.seqCanvas.cursorX = av.startRes;\r
 217              seqPanel.seqCanvas.cursorY = av.startSeq;\r
 218            }\r
 219            seqPanel.seqCanvas.repaint();\r
 220            break;\r
 221 \r
 222           case KeyEvent.VK_F1:\r
 223             try\r
 224             {\r
 225               ClassLoader cl = jalview.gui.Desktop.class.getClassLoader();\r
 226               java.net.URL url = javax.help.HelpSet.findHelpSet(cl, "help/help");\r
 227               javax.help.HelpSet hs = new javax.help.HelpSet(cl, url);\r
 228 \r
 229               javax.help.HelpBroker hb = hs.createHelpBroker();\r
 230               hb.setCurrentID("home");\r
 231               hb.setDisplayed(true);\r
 232             }\r
 233             catch (Exception ex)\r
 234             {\r
 235               ex.printStackTrace();\r
 236             }\r
 237             break;\r
 238           case KeyEvent.VK_H:\r
 239           {\r
 240             boolean toggleSeqs = !evt.isControlDown();\r
 241             boolean toggleCols = !evt.isShiftDown();\r
 242 \r
 243             boolean hide = false;\r
 244 \r
 245             SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 246             if(toggleSeqs)\r
 247              {\r
 248                if(sg != null && sg.getSize(false) != av.alignment.getHeight())\r
 249                {\r
 250                  alignFrame.hideSelSequences_actionPerformed(null);\r
 251                  hide = true;\r
 252                }\r
 253                else\r
 254                  alignFrame.showAllSeqs_actionPerformed(null);\r
 255              }\r
 256 \r
 257              if (toggleCols)\r
 258              {\r
 259                if(av.colSel.getSelected().size() > 0)\r
 260                  alignFrame.hideSelColumns_actionPerformed(null);\r
 261                else if(!hide)\r
 262                  alignFrame.showAllColumns_actionPerformed(null);\r
 263              }\r
 264             break;\r
 265           }\r
 266 \r
 267         }\r
 268       }\r
 269     });\r
 270   }\r
 271 \r
 272   /**\r
 273    * DOCUMENT ME!\r
 274    */\r
 275   public void fontChanged()\r
 276   {\r
 277     // set idCanvas bufferedImage to null\r
 278     // to prevent drawing old image\r
 279     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
 280 \r
 281     scalePanelHolder.setPreferredSize(new Dimension(10,\r
 282         av.charHeight + fm.getDescent()));\r
 283     idSpaceFillerPanel1.setPreferredSize(new Dimension(10,\r
 284         av.charHeight + fm.getDescent()));\r
 285 \r
 286     idPanel.idCanvas.gg = null;\r
 287     seqPanel.seqCanvas.img = null;\r
 288     annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 289 \r
 290     Dimension d = calculateIdWidth();\r
 291     d.setSize(d.width + 4, d.height);\r
 292     idPanel.idCanvas.setPreferredSize(d);\r
 293     hscrollFillerPanel.setPreferredSize(d);\r
 294 \r
 295     if (av.getWrapAlignment())\r
 296     {\r
 297       int max = av.alignment.getWidth() /\r
 298           seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth());\r
 299       vscroll.setMaximum(max);\r
 300       vscroll.setUnitIncrement(1);\r
 301       vscroll.setVisibleAmount(1);\r
 302     }\r
 303     else\r
 304     {\r
 305       setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 306     }\r
 307 \r
 308     if (overviewPanel != null)\r
 309       overviewPanel.setBoxPosition();\r
 310 \r
 311     repaint();\r
 312   }\r
 313 \r
 314   /**\r
 315    * DOCUMENT ME!\r
 316    *\r
 317    * @return DOCUMENT ME!\r
 318    */\r
 319   public Dimension calculateIdWidth()\r
 320   {\r
 321     Container c = new Container();\r
 322 \r
 323     FontMetrics fm = c.getFontMetrics(av.font);\r
 324     AlignmentI al = av.getAlignment();\r
 325 \r
 326     int i = 0;\r
 327     int idWidth = 0;\r
 328     String id;\r
 329 \r
 330     while ( (i < al.getHeight()) && (al.getSequenceAt(i) != null))\r
 331     {\r
 332       SequenceI s = al.getSequenceAt(i);\r
 333 \r
 334       id = s.getDisplayId(av.getShowJVSuffix());\r
 335 \r
 336       if (fm.stringWidth(id) > idWidth)\r
 337       {\r
 338         idWidth = fm.stringWidth(id);\r
 339       }\r
 340 \r
 341       i++;\r
 342     }\r
 343 \r
 344     // Also check annotation label widths\r
 345     i = 0;\r
 346 \r
 347     if (al.getAlignmentAnnotation() != null)\r
 348     {\r
 349       fm = c.getFontMetrics(alabels.getFont());\r
 350 \r
 351       while (i < al.getAlignmentAnnotation().length)\r
 352       {\r
 353         String label = al.getAlignmentAnnotation()[i].label;\r
 354 \r
 355         if (fm.stringWidth(label) > idWidth)\r
 356         {\r
 357           idWidth = fm.stringWidth(label);\r
 358         }\r
 359 \r
 360         i++;\r
 361       }\r
 362     }\r
 363 \r
 364     return new Dimension(idWidth, 12);\r
 365   }\r
 366 \r
 367   /**\r
 368    * DOCUMENT ME!\r
 369    *\r
 370    * @param results DOCUMENT ME!\r
 371    */\r
 372   public void highlightSearchResults(SearchResults results)\r
 373   {\r
 374     seqPanel.seqCanvas.highlightSearchResults(results);\r
 375 \r
 376     // do we need to scroll the panel?\r
 377     if (results != null)\r
 378     {\r
 379       SequenceI seq = results.getResultSequence(0);\r
 380       int seqIndex = av.alignment.findIndex(seq);\r
 381       int start = seq.findIndex(results.getResultStart(0)) - 1;\r
 382       int end = seq.findIndex(results.getResultEnd(0)) - 1;\r
 383 \r
 384       if(!av.wrapAlignment)\r
 385       {\r
 386         if ( (av.getStartRes() > end)  || (av.getEndRes() < start) ||\r
 387            ( (av.getStartSeq() > seqIndex) || (av.getEndSeq() < seqIndex)))\r
 388         {\r
 389           setScrollValues(start, seqIndex);\r
 390         }\r
 391       }\r
 392       else\r
 393       {\r
 394         scrollToWrappedVisible(start);\r
 395       }\r
 396     }\r
 397   }\r
 398 \r
 399   void scrollToWrappedVisible(int res)\r
 400   {\r
 401     int cwidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth());\r
 402     if( res<=av.getStartRes() || res>=(av.getStartRes()+cwidth) )\r
 403     {\r
 404       vscroll.setValue(res / cwidth);\r
 405       av.startRes = vscroll.getValue() * cwidth;\r
 406     }\r
 407   }\r
 408 \r
 409   /**\r
 410    * DOCUMENT ME!\r
 411    *\r
 412    * @return DOCUMENT ME!\r
 413    */\r
 414   public OverviewPanel getOverviewPanel()\r
 415   {\r
 416     return overviewPanel;\r
 417   }\r
 418 \r
 419   /**\r
 420    * DOCUMENT ME!\r
 421    *\r
 422    * @param op DOCUMENT ME!\r
 423    */\r
 424   public void setOverviewPanel(OverviewPanel op)\r
 425   {\r
 426     overviewPanel = op;\r
 427   }\r
 428 \r
 429   /**\r
 430    * DOCUMENT ME!\r
 431    *\r
 432    * @param b DOCUMENT ME!\r
 433    */\r
 434   public void setAnnotationVisible(boolean b)\r
 435   {\r
 436     if (!av.wrapAlignment)\r
 437     {\r
 438       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(b);\r
 439       annotationScroller.setVisible(b);\r
 440     }\r
 441     repaint();\r
 442   }\r
 443 \r
 444   public void adjustAnnotationHeight()\r
 445   {\r
 446     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 447     {\r
 448       public void run()\r
 449       {\r
 450           while(alignFrame.getHeight()==0)\r
 451           {\r
 452             Thread.yield();\r
 453           }\r
 454 \r
 455         int height = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 456 \r
 457         if (height > alignFrame.getHeight() / 2)\r
 458         {\r
 459           height = alignFrame.getHeight() / 2;\r
 460         }\r
 461 \r
 462         annotationScroller.setPreferredSize(\r
 463             new Dimension(annotationScroller.getWidth(),\r
 464                           height));\r
 465 \r
 466         annotationSpaceFillerHolder.setPreferredSize(new Dimension(\r
 467             annotationSpaceFillerHolder.getWidth(),\r
 468             height));\r
 469 \r
 470         annotationPanel.repaint();\r
 471       }\r
 472     });\r
 473   }\r
 474 \r
 475   /**\r
 476    * DOCUMENT ME!\r
 477    *\r
 478    * @param wrap DOCUMENT ME!\r
 479    */\r
 480   public void setWrapAlignment(boolean wrap)\r
 481   {\r
 482     av.startSeq = 0;\r
 483     scalePanelHolder.setVisible(!wrap);\r
 484     hscroll.setVisible(!wrap);\r
 485     idwidthAdjuster.setVisible(!wrap);\r
 486 \r
 487     if (wrap)\r
 488     {\r
 489       annotationScroller.setVisible(false);\r
 490       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(false);\r
 491     }\r
 492     else if (av.showAnnotation)\r
 493     {\r
 494       annotationScroller.setVisible(true);\r
 495       annotationSpaceFillerHolder.setVisible(true);\r
 496     }\r
 497 \r
 498     idSpaceFillerPanel1.setVisible(!wrap);\r
 499 \r
 500     repaint();\r
 501   }\r
 502 \r
 503   // return value is true if the scroll is valid\r
 504   public boolean scrollUp(boolean up)\r
 505   {\r
 506     if (up)\r
 507     {\r
 508       if (vscroll.getValue() < 1)\r
 509       {\r
 510         return false;\r
 511       }\r
 512 \r
 513       fastPaint = false;\r
 514       vscroll.setValue(vscroll.getValue() - 1);\r
 515     }\r
 516     else\r
 517     {\r
 518       if ( (vextent + vscroll.getValue()) >= av.getAlignment().getHeight())\r
 519       {\r
 520         return false;\r
 521       }\r
 522 \r
 523       fastPaint = false;\r
 524       vscroll.setValue(vscroll.getValue() + 1);\r
 525     }\r
 526 \r
 527     fastPaint = true;\r
 528 \r
 529     return true;\r
 530   }\r
 531 \r
 532   /**\r
 533    * DOCUMENT ME!\r
 534    *\r
 535    * @param right DOCUMENT ME!\r
 536    *\r
 537    * @return DOCUMENT ME!\r
 538    */\r
 539   public boolean scrollRight(boolean right)\r
 540   {\r
 541     if (!right)\r
 542     {\r
 543       if (hscroll.getValue() < 1)\r
 544       {\r
 545         return false;\r
 546       }\r
 547 \r
 548       fastPaint = false;\r
 549       hscroll.setValue(hscroll.getValue() - 1);\r
 550     }\r
 551     else\r
 552     {\r
 553       if ( (hextent + hscroll.getValue()) >= av.getAlignment().getWidth())\r
 554       {\r
 555         return false;\r
 556       }\r
 557 \r
 558       fastPaint = false;\r
 559       hscroll.setValue(hscroll.getValue() + 1);\r
 560     }\r
 561 \r
 562     fastPaint = true;\r
 563 \r
 564     return true;\r
 565   }\r
 566 \r
 567   /**\r
 568    * DOCUMENT ME!\r
 569    *\r
 570    * @param x DOCUMENT ME!\r
 571    * @param y DOCUMENT ME!\r
 572    */\r
 573   public void setScrollValues(int x, int y)\r
 574   {\r
 575 \r
 576     int width = av.alignment.getWidth();\r
 577     int height = av.alignment.getHeight();\r
 578 \r
 579     if(av.hasHiddenColumns)\r
 580      width = av.getColumnSelection().findColumnPosition(width);\r
 581 \r
 582     av.setEndRes( (x + (seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.charWidth)) -1);\r
 583 \r
 584     hextent = seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.charWidth;\r
 585     vextent = seqPanel.seqCanvas.getHeight() / av.charHeight;\r
 586 \r
 587     if (hextent > width)\r
 588     {\r
 589       hextent = width;\r
 590     }\r
 591 \r
 592     if (vextent > height)\r
 593     {\r
 594       vextent = height;\r
 595     }\r
 596 \r
 597     if ( (hextent + x) > width)\r
 598     {\r
 599       x = width - hextent;\r
 600     }\r
 601 \r
 602     if ( (vextent + y) > height)\r
 603     {\r
 604       y = height - vextent;\r
 605     }\r
 606 \r
 607     if (y < 0)\r
 608     {\r
 609       y = 0;\r
 610     }\r
 611 \r
 612     if (x < 0)\r
 613     {\r
 614       x = 0;\r
 615     }\r
 616 \r
 617     hscroll.setValues(x, hextent, 0, width);\r
 618     vscroll.setValues(y, vextent, 0, height);\r
 619   }\r
 620 \r
 621   /**\r
 622    * DOCUMENT ME!\r
 623    *\r
 624    * @param evt DOCUMENT ME!\r
 625    */\r
 626   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 627   {\r
 628 \r
 629     int oldX = av.getStartRes();\r
 630     int oldY = av.getStartSeq();\r
 631 \r
 632     if (evt.getSource() == hscroll)\r
 633     {\r
 634       int x = hscroll.getValue();\r
 635       av.setStartRes(x);\r
 636       av.setEndRes( (x +\r
 637                      (seqPanel.seqCanvas.getWidth() / av.getCharWidth())) - 1);\r
 638     }\r
 639 \r
 640     if (evt.getSource() == vscroll)\r
 641     {\r
 642       int offy = vscroll.getValue();\r
 643 \r
 644       if (av.getWrapAlignment())\r
 645       {\r
 646         if(offy>-1)\r
 647         {\r
 648           int rowSize = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.\r
 649               seqCanvas.getWidth());\r
 650           av.setStartRes(offy * rowSize);\r
 651           av.setEndRes( (offy + 1) * rowSize);\r
 652         }\r
 653         else\r
 654         {\r
 655           //This is only called if file loaded is a jar file that\r
 656           //was wrapped when saved and user has wrap alignment true\r
 657           //as preference setting\r
 658           SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 659               {\r
 660                 public void run()\r
 661                 {\r
 662                   setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 663                 }\r
 664               });\r
 665         }\r
 666       }\r
 667       else\r
 668       {\r
 669         av.setStartSeq(offy);\r
 670         av.setEndSeq(offy +\r
 671                      (seqPanel.seqCanvas.getHeight() / av.getCharHeight()));\r
 672       }\r
 673     }\r
 674 \r
 675     if (overviewPanel != null)\r
 676     {\r
 677       overviewPanel.setBoxPosition();\r
 678     }\r
 679 \r
 680     int scrollX = av.startRes - oldX;\r
 681     int scrollY = av.startSeq - oldY;\r
 682 \r
 683     if (av.getWrapAlignment() || !fastPaint)\r
 684     {\r
 685       repaint();\r
 686     }\r
 687     else\r
 688     {\r
 689       // Make sure we're not trying to draw a panel\r
 690       // larger than the visible window\r
 691       if(scrollX>av.endRes-av.startRes)\r
 692         scrollX = av.endRes-av.startRes;\r
 693       else if(scrollX<av.startRes-av.endRes)\r
 694         scrollX = av.startRes - av.endRes;\r
 695 \r
 696       if(scrollX!=0 || scrollY!=0)\r
 697       {\r
 698         idPanel.idCanvas.fastPaint(scrollY);\r
 699         seqPanel.seqCanvas.fastPaint(scrollX,\r
 700                                      scrollY);\r
 701         scalePanel.repaint();\r
 702 \r
 703         if (av.getShowAnnotation())\r
 704         {\r
 705           annotationPanel.fastPaint(scrollX);\r
 706         }\r
 707       }\r
 708     }\r
 709   }\r
 710 \r
 711   /**\r
 712    * DOCUMENT ME!\r
 713    *\r
 714    * @param g DOCUMENT ME!\r
 715    */\r
 716   public void paintComponent(Graphics g)\r
 717   {\r
 718     invalidate();\r
 719 \r
 720     Dimension d = idPanel.idCanvas.getPreferredSize();\r
 721     idPanelHolder.setPreferredSize(d);\r
 722     hscrollFillerPanel.setPreferredSize(new Dimension(d.width, 12));\r
 723     validate();\r
 724 \r
 725     if (av.getWrapAlignment())\r
 726     {\r
 727       int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
 728 \r
 729       if (av.hasHiddenColumns)\r
 730         maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
 731 \r
 732       int max = maxwidth /\r
 733           seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(seqPanel.seqCanvas.getWidth()) +\r
 734           1;\r
 735 \r
 736 \r
 737       vscroll.setMaximum(max);\r
 738       vscroll.setUnitIncrement(1);\r
 739       vscroll.setVisibleAmount(1);\r
 740     }\r
 741     else\r
 742     {\r
 743       setScrollValues(av.getStartRes(), av.getStartSeq());\r
 744     }\r
 745 \r
 746     if( this.getVisibleRect().getBounds() == g.getClipBounds()\r
 747         && overviewPanel != null)\r
 748         overviewPanel.updateOverviewImage();\r
 749 \r
 750   }\r
 751 \r
 752   /**\r
 753    * DOCUMENT ME!\r
 754    *\r
 755    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 756    * @param pf DOCUMENT ME!\r
 757    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 758    *\r
 759    * @return DOCUMENT ME!\r
 760    *\r
 761    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 762    */\r
 763   public int print(Graphics pg, PageFormat pf, int pi)\r
 764       throws PrinterException\r
 765   {\r
 766     pg.translate( (int) pf.getImageableX(), (int) pf.getImageableY());\r
 767 \r
 768     int pwidth = (int) pf.getImageableWidth();\r
 769     int pheight = (int) pf.getImageableHeight();\r
 770 \r
 771     if (av.getWrapAlignment())\r
 772     {\r
 773       return printWrappedAlignment(pg, pwidth, pheight, pi);\r
 774     }\r
 775     else\r
 776     {\r
 777       return printUnwrapped(pg, pwidth, pheight, pi);\r
 778     }\r
 779   }\r
 780 \r
 781   /**\r
 782    * DOCUMENT ME!\r
 783    *\r
 784    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 785    * @param pwidth DOCUMENT ME!\r
 786    * @param pheight DOCUMENT ME!\r
 787    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 788    *\r
 789    * @return DOCUMENT ME!\r
 790    *\r
 791    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 792    */\r
 793   public int printUnwrapped(Graphics pg, int pwidth, int pheight, int pi)\r
 794       throws PrinterException\r
 795   {\r
 796     int idWidth = calculateIdWidth().width + 4;\r
 797     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
 798     int scaleHeight = av.charHeight + fm.getDescent();\r
 799 \r
 800     pg.setColor(Color.white);\r
 801     pg.fillRect(0, 0, pwidth, pheight);\r
 802     pg.setFont(av.getFont());\r
 803 \r
 804     ////////////////////////////////////\r
 805     /// How many sequences and residues can we fit on a printable page?\r
 806     int totalRes = (pwidth - idWidth) / av.getCharWidth();\r
 807 \r
 808     int totalSeq = (int) ( (pheight - scaleHeight) / av.getCharHeight()) -\r
 809         1;\r
 810 \r
 811     int pagesWide = (av.getAlignment().getWidth() / totalRes) + 1;\r
 812 \r
 813     /////////////////////////////\r
 814     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 815     int startRes;\r
 816 \r
 817     /////////////////////////////\r
 818     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 819     int endRes;\r
 820 \r
 821     /////////////////////////////\r
 822     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 823     int startSeq;\r
 824 \r
 825     /////////////////////////////\r
 826     /// Only print these sequences and residues on this page\r
 827     int endSeq;\r
 828     startRes = (pi % pagesWide) * totalRes;\r
 829     endRes = (startRes + totalRes) - 1;\r
 830 \r
 831     if (endRes > (av.getAlignment().getWidth() - 1))\r
 832     {\r
 833       endRes = av.getAlignment().getWidth() - 1;\r
 834     }\r
 835 \r
 836     startSeq = (pi / pagesWide) * totalSeq;\r
 837     endSeq = startSeq + totalSeq;\r
 838 \r
 839     if (endSeq > av.getAlignment().getHeight())\r
 840     {\r
 841       endSeq = av.getAlignment().getHeight();\r
 842     }\r
 843 \r
 844     int pagesHigh = ( (av.alignment.getHeight() / totalSeq) + 1) * pheight;\r
 845 \r
 846     if (av.showAnnotation)\r
 847     {\r
 848       pagesHigh += annotationPanel.adjustPanelHeight() + 3;\r
 849     }\r
 850 \r
 851     pagesHigh /= pheight;\r
 852 \r
 853     if (pi >= (pagesWide * pagesHigh))\r
 854     {\r
 855       return Printable.NO_SUCH_PAGE;\r
 856     }\r
 857 \r
 858     //draw Scale\r
 859     pg.translate(idWidth, 0);\r
 860     scalePanel.drawScale(pg, startRes, endRes, pwidth - idWidth, scaleHeight);\r
 861     pg.translate( -idWidth, scaleHeight);\r
 862 \r
 863     ////////////////\r
 864     // Draw the ids\r
 865     Color currentColor = null;\r
 866     Color currentTextColor = null;\r
 867 \r
 868     pg.setFont(new Font(av.getFont().getName(),\r
 869                         Font.ITALIC,\r
 870                         av.getFont().getSize()));\r
 871     for (int i = startSeq; i < endSeq; i++)\r
 872     {\r
 873       if ( (av.getSelectionGroup() != null) &&\r
 874           av.getSelectionGroup().getSequences(false).contains(\r
 875               av.getAlignment().getSequenceAt(i)))\r
 876       {\r
 877         currentColor = Color.gray;\r
 878         currentTextColor = Color.black;\r
 879       }\r
 880       else\r
 881       {\r
 882         currentColor = av.getAlignment().getSequenceAt(i).getColor();\r
 883         currentTextColor = Color.black;\r
 884       }\r
 885 \r
 886       pg.setColor(currentColor);\r
 887       pg.fillRect(0, (i - startSeq) * av.charHeight, idWidth,\r
 888                   av.getCharHeight());\r
 889 \r
 890       pg.setColor(currentTextColor);\r
 891 \r
 892       String string = av.getAlignment().getSequenceAt(i).getDisplayId\r
 893           ( av.getShowJVSuffix());\r
 894 \r
 895       pg.drawString(string, 0,\r
 896                     ( ( (i - startSeq) * av.charHeight) + av.getCharHeight()) -\r
 897                     (av.getCharHeight() / 5));\r
 898     }\r
 899 \r
 900     pg.setFont(av.getFont());\r
 901 \r
 902     // draw main sequence panel\r
 903     pg.translate(idWidth, 0);\r
 904     seqPanel.seqCanvas.drawPanel(pg, startRes, endRes, startSeq, endSeq, 0);\r
 905 \r
 906     if (av.showAnnotation && (endSeq == av.alignment.getHeight()))\r
 907     {\r
 908       pg.translate( -idWidth-3, (endSeq - startSeq) * av.charHeight + 3);\r
 909       alabels.drawComponent( (Graphics2D) pg, idWidth);\r
 910       pg.translate(idWidth+3, 0);\r
 911       annotationPanel.drawComponent( (Graphics2D) pg, startRes, endRes +\r
 912                                     1);\r
 913     }\r
 914 \r
 915     return Printable.PAGE_EXISTS;\r
 916   }\r
 917 \r
 918   /**\r
 919    * DOCUMENT ME!\r
 920    *\r
 921    * @param pg DOCUMENT ME!\r
 922    * @param pwidth DOCUMENT ME!\r
 923    * @param pheight DOCUMENT ME!\r
 924    * @param pi DOCUMENT ME!\r
 925    *\r
 926    * @return DOCUMENT ME!\r
 927    *\r
 928    * @throws PrinterException DOCUMENT ME!\r
 929    */\r
 930   public int printWrappedAlignment(Graphics pg, int pwidth, int pheight,\r
 931                                    int pi)\r
 932       throws PrinterException\r
 933   {\r
 934 \r
 935     int annotationHeight = 0;\r
 936     AnnotationLabels labels = null;\r
 937     if (av.showAnnotation)\r
 938     {\r
 939       annotationHeight = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 940       labels = new AnnotationLabels(av);\r
 941     }\r
 942 \r
 943     int hgap = av.charHeight;\r
 944     if (av.scaleAboveWrapped)\r
 945       hgap += av.charHeight;\r
 946 \r
 947     int cHeight = av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight\r
 948         + hgap\r
 949         + annotationHeight;\r
 950 \r
 951     int idWidth = calculateIdWidth().width + 4;\r
 952 \r
 953     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
 954     if (av.hasHiddenColumns)\r
 955       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
 956 \r
 957 \r
 958     int resWidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(pwidth -\r
 959         idWidth);\r
 960 \r
 961     int totalHeight = cHeight * (maxwidth / resWidth + 1);\r
 962 \r
 963     pg.setColor(Color.white);\r
 964     pg.fillRect(0, 0, pwidth, pheight);\r
 965     pg.setFont(av.getFont());\r
 966 \r
 967     ////////////////\r
 968     // Draw the ids\r
 969     pg.setColor(Color.black);\r
 970 \r
 971     pg.translate(0, -pi * pheight);\r
 972 \r
 973     pg.setClip(0, pi * pheight, pwidth, pheight);\r
 974 \r
 975     int ypos = hgap;\r
 976     Font italic = new Font(av.getFont().getName(), Font.ITALIC,\r
 977                            av.getFont().getSize());\r
 978     pg.setFont(italic);\r
 979 \r
 980     do\r
 981     {\r
 982       for (int i = 0; i < av.alignment.getHeight(); i++)\r
 983       {\r
 984         SequenceI s = av.alignment.getSequenceAt(i);\r
 985         String string = s.getDisplayId( av.getShowJVSuffix());\r
 986 \r
 987         pg.drawString(string, 0,\r
 988                       ( (i * av.charHeight) + ypos + av.charHeight) -\r
 989                       (av.charHeight / 5));\r
 990       }\r
 991       if (labels != null)\r
 992       {\r
 993         pg.translate(-3,\r
 994                      ypos +\r
 995                      (av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight));\r
 996 \r
 997         pg.setFont(av.getFont());\r
 998         labels.drawComponent(pg, idWidth);\r
 999         pg.setFont(italic);\r
1000         pg.translate(+3,\r
1001                      -ypos -\r
1002                      (av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight));\r
1003       }\r
1004 \r
1005       ypos += cHeight;\r
1006     }\r
1007     while (ypos < totalHeight);\r
1008 \r
1009     pg.translate(idWidth, 0);\r
1010 \r
1011     seqPanel.seqCanvas.drawWrappedPanel(pg, pwidth - idWidth, totalHeight, 0);\r
1012 \r
1013     if ( (pi * pheight) < totalHeight)\r
1014     {\r
1015       return Printable.PAGE_EXISTS;\r
1016 \r
1017     }\r
1018     else\r
1019     {\r
1020       return Printable.NO_SUCH_PAGE;\r
1021     }\r
1022   }\r
1023 \r
1024   void makeAlignmentImage(int type, File file)\r
1025   {\r
1026     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
1027     if (av.hasHiddenColumns)\r
1028       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth);\r
1029 \r
1030     int height = ( (av.alignment.getHeight() + 1) * av.charHeight) + 30;\r
1031     int width = idPanel.getWidth() + (maxwidth * av.charWidth);\r
1032     if (idPanel.getWidth() == 0)\r
1033     {\r
1034       width += calculateIdWidth().getWidth() + 4;\r
1035     }\r
1036 \r
1037     if (av.getWrapAlignment())\r
1038     {\r
1039       height = getWrappedHeight();\r
1040       if (System.getProperty("java.awt.headless") != null\r
1041           && System.getProperty("java.awt.headless").equals("true"))\r
1042       {\r
1043         width = alignFrame.getWidth() - 22;\r
1044       }\r
1045       else\r
1046         width = seqPanel.getWidth() + idPanel.getWidth();\r
1047 \r
1048     }\r
1049     else if (av.getShowAnnotation())\r
1050     {\r
1051       height += annotationPanel.adjustPanelHeight() + 3;\r
1052     }\r
1053 \r
1054     jalview.util.ImageMaker im;\r
1055     if(type==jalview.util.ImageMaker.PNG)\r
1056       im  = new jalview.util.ImageMaker(this,\r
1057                                         jalview.util.ImageMaker.PNG,\r
1058                                         "Create PNG image from alignment",\r
1059                                         width, height, file, null);\r
1060     else\r
1061       im = new jalview.util.ImageMaker(this,\r
1062                                         jalview.util.ImageMaker.EPS,\r
1063                                        "Create EPS file from alignment",\r
1064                                         width, height, file, alignFrame.getTitle() );\r
1065 \r
1066     try\r
1067     {\r
1068       if (av.getWrapAlignment())\r
1069       {\r
1070         if(im.getGraphics()!=null)\r
1071         {\r
1072           printWrappedAlignment(im.getGraphics(), width, height, 0);\r
1073           im.writeImage();\r
1074         }\r
1075       }\r
1076       else\r
1077       {\r
1078         if(im.getGraphics()!=null)\r
1079         {\r
1080           printUnwrapped(im.getGraphics(), width, height, 0);\r
1081           im.writeImage();\r
1082         }\r
1083       }\r
1084     }\r
1085     catch (OutOfMemoryError err)\r
1086     {\r
1087       System.out.println("########################\n"\r
1088                          + "OUT OF MEMORY " + file + "\n"\r
1089                          + "########################");\r
1090 \r
1091       JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,\r
1092                                             "Out of Memory Creating Image!!"\r
1093                                             +\r
1094                                             "\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory."\r
1095                                             , "Out of memory",\r
1096                                             JOptionPane.WARNING_MESSAGE);\r
1097       System.out.println("Create IMAGE: " + err);\r
1098       System.gc();\r
1099 \r
1100     }\r
1101     catch (Exception ex)\r
1102     {\r
1103       ex.printStackTrace();\r
1104     }\r
1105   }\r
1106   /**\r
1107    * DOCUMENT ME!\r
1108    */\r
1109   public void makeEPS(File epsFile)\r
1110   {\r
1111     makeAlignmentImage(jalview.util.ImageMaker.EPS, epsFile);\r
1112   }\r
1113 \r
1114   /**\r
1115    * DOCUMENT ME!\r
1116    */\r
1117   public void makePNG(File pngFile)\r
1118   {\r
1119     makeAlignmentImage(jalview.util.ImageMaker.PNG, pngFile);\r
1120   }\r
1121 \r
1122   public void makePNGImageMap(File imgMapFile, String imageName)\r
1123   {\r
1124     ///////ONLY WORKS WITH NONE WRAPPED ALIGNMENTS\r
1125     //////////////////////////////////////////////\r
1126     int idWidth = calculateIdWidth().width + 4;\r
1127     FontMetrics fm = getFontMetrics(av.getFont());\r
1128     int scaleHeight = av.charHeight + fm.getDescent();\r
1129 \r
1130     // Gen image map\r
1131     //////////////////////////////////\r
1132     if (imgMapFile != null)\r
1133     {\r
1134       try\r
1135       {\r
1136         int s, sSize = av.alignment.getHeight(),\r
1137             res, alwidth = av.alignment.getWidth(), g, gSize, f, fSize, sy;\r
1138         StringBuffer text = new StringBuffer();\r
1139         PrintWriter out = new PrintWriter(new FileWriter(imgMapFile));\r
1140         out.println(jalview.io.HTMLOutput.getImageMapHTML());\r
1141         out.println("<img src=\"" + imageName +\r
1142                     "\" border=\"0\" usemap=\"#Map\" >"\r
1143                     + "<map name=\"Map\">");\r
1144 \r
1145         for (s = 0; s < sSize; s++)\r
1146         {\r
1147           sy = s * av.charHeight + scaleHeight;\r
1148 \r
1149           SequenceI seq = av.alignment.getSequenceAt(s);\r
1150           SequenceFeature [] features = seq.getDatasetSequence().getSequenceFeatures();\r
1151           SequenceGroup[] groups = av.alignment.findAllGroups(seq);\r
1152           for(res =0; res<alwidth; res++)\r
1153           {\r
1154             text = new StringBuffer();\r
1155             Object obj = null;\r
1156             if(av.alignment.isNucleotide())\r
1157               obj = ResidueProperties.nucleotideName.get(seq.getCharAt(res)+"" );\r
1158             else\r
1159               obj = ResidueProperties.aa2Triplet.get(\r
1160                     seq.getCharAt(res) + "");\r
1161 \r
1162               if (obj == null)\r
1163                   continue;\r
1164 \r
1165             String triplet = obj.toString();\r
1166             int alIndex = seq.findPosition(res);\r
1167             gSize = groups.length;\r
1168             for (g = 0; g < gSize; g++)\r
1169             {\r
1170               if(text.length()<1)\r
1171               {\r
1172                 text.append("<area shape=\"rect\" coords=\""\r
1173                   + (idWidth + res * av.charWidth) + ","\r
1174                   + sy + ","\r
1175                   + (idWidth + (res + 1) * av.charWidth) + ","\r
1176                   + (av.charHeight + sy) + "\""\r
1177                   + " onMouseOver=\"toolTip('"\r
1178                   + alIndex + " " + triplet );\r
1179               }\r
1180 \r
1181               if(groups[g].getStartRes()<res && groups[g].getEndRes()>res)\r
1182                 text.append("<br><em>" + groups[g].getName() + "</em>");\r
1183             }\r
1184 \r
1185             if (features != null)\r
1186             {\r
1187               if(text.length()<1)\r
1188               {\r
1189                 text.append("<area shape=\"rect\" coords=\""\r
1190                   + (idWidth + res * av.charWidth) + ","\r
1191                   + sy + ","\r
1192                   + (idWidth + (res + 1) * av.charWidth) + ","\r
1193                   + (av.charHeight + sy) + "\""\r
1194                   + " onMouseOver=\"toolTip('"\r
1195                   + alIndex + " " + triplet );\r
1196               }\r
1197                 fSize = features.length;\r
1198                 for (f = 0; f < fSize; f++)\r
1199                 {\r
1200 \r
1201                   if ( (features[f].getBegin() <= seq.findPosition(res)) &&\r
1202                       (features[f].getEnd() >= seq.findPosition(res)))\r
1203                   {\r
1204                     if (features[f].getType().equals("disulfide bond"))\r
1205                     {\r
1206                       if (features[f].getBegin() == seq.findPosition(res)\r
1207                           || features[f].getEnd() == seq.findPosition(res))\r
1208                       {\r
1209                         text.append("<br>disulfide bond " + features[f].getBegin() + ":" +\r
1210                                        features[f].getEnd());\r
1211                       }\r
1212                     }\r
1213                     else\r
1214                     {\r
1215                       text.append("<br>");\r
1216                       text.append(features[f].getType());\r
1217                       if (features[f].getDescription() != null && !features[f].getType().equals(features[f].getDescription()))\r
1218                         text.append(" " + features[f].getDescription());\r
1219 \r
1220                       if (features[f].getValue("status") != null )\r
1221                       {\r
1222                         text.append(" (" + features[f].getValue("status") + ")");\r
1223                       }\r
1224                     }\r
1225                   }\r
1226 \r
1227                 }\r
1228               }\r
1229               if(text.length()>1)\r
1230               {\r
1231                 text.append("')\"; onMouseOut=\"toolTip()\";  href=\"#\">");\r
1232                 out.println(text.toString());\r
1233               }\r
1234             }\r
1235           }\r
1236         out.println("</map></body></html>");\r
1237         out.close();\r
1238 \r
1239       }\r
1240       catch (Exception ex)\r
1241       {\r
1242         ex.printStackTrace();\r
1243       }\r
1244     } ///////////END OF IMAGE MAP\r
1245 \r
1246   }\r
1247 \r
1248   int getWrappedHeight()\r
1249   {\r
1250     int seqPanelWidth = seqPanel.seqCanvas.getWidth();\r
1251 \r
1252     //If headless, seqPanel will have 0 width\r
1253     if (System.getProperty("java.awt.headless") != null\r
1254               && System.getProperty("java.awt.headless").equals("true"))\r
1255     {\r
1256       int idWidth = calculateIdWidth().width + 4;\r
1257       seqPanelWidth = alignFrame.getWidth() - idWidth;\r
1258     }\r
1259 \r
1260     int chunkWidth = seqPanel.seqCanvas.getWrappedCanvasWidth(\r
1261         seqPanelWidth\r
1262           );\r
1263 \r
1264     int hgap = av.charHeight;\r
1265     if (av.scaleAboveWrapped)\r
1266       hgap += av.charHeight;\r
1267 \r
1268     int annotationHeight = 0;\r
1269     if (av.showAnnotation)\r
1270     {\r
1271       annotationHeight = annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
1272     }\r
1273 \r
1274     int cHeight = av.getAlignment().getHeight() * av.charHeight\r
1275         + hgap\r
1276         + annotationHeight;\r
1277 \r
1278     int maxwidth = av.alignment.getWidth();\r
1279     if (av.hasHiddenColumns)\r
1280       maxwidth = av.getColumnSelection().findColumnPosition(maxwidth) - 1;\r
1281 \r
1282 \r
1283     int height = ( (maxwidth / chunkWidth) + 1) * cHeight;\r
1284 \r
1285     return height;\r
1286   }\r
1287 \r
1288   /**\r
1289    * DOCUMENT ME!\r
1290    *\r
1291    * @author $author$\r
1292    * @version $Revision$\r
1293    */\r
1294   class Preview\r
1295       extends JFrame\r
1296   {\r
1297     /**\r
1298      * Creates a new Preview object.\r
1299      *\r
1300      * @param image DOCUMENT ME!\r
1301      */\r
1302     public Preview(Image image)\r
1303     {\r
1304       setResizable(true);\r
1305       setSize(image.getWidth(this), image.getHeight(this));\r
1306       setVisible(true);\r
1307       getContentPane().setLayout(new BorderLayout());\r
1308       getContentPane().add(new PreviewPanel(image), BorderLayout.CENTER);\r
1309       validate();\r
1310       repaint();\r
1311     }\r
1312   }\r
1313 \r
1314   /**\r
1315    * DOCUMENT ME!\r
1316    *\r
1317    * @author $author$\r
1318    * @version $Revision$\r
1319    */\r
1320   class PreviewPanel\r
1321       extends JPanel\r
1322   {\r
1323     Image image;\r
1324 \r
1325     /**\r
1326      * Creates a new PreviewPanel object.\r
1327      *\r
1328      * @param image DOCUMENT ME!\r
1329      */\r
1330     public PreviewPanel(Image image)\r
1331     {\r
1332       this.image = image;\r
1333     }\r
1334 \r
1335     /**\r
1336      * DOCUMENT ME!\r
1337      *\r
1338      * @param g DOCUMENT ME!\r
1339      */\r
1340     public void paintComponent(Graphics g)\r
1341     {\r
1342       if (image != null)\r
1343       {\r
1344         g.drawImage(image, 0, 0, this);\r
1345       }\r
1346       else\r
1347       {\r
1348         System.out.println("DEBUG:image is null");\r
1349       }\r
1350     }\r
1351   }\r
1352 }\r