src/jalview/gui/AnnotationLabels.java

   1 \r
   2 package jalview.gui;\r
   3 \r
   4 import javax.swing.*;\r
   5 import java.awt.event.*;\r
   6 import java.awt.*;\r
   7 import java.awt.image.*;\r
   8 import jalview.datamodel.*;\r
   9 import jalview.io.FormatAdapter;\r
  10 \r
  11 public class AnnotationLabels extends JPanel implements MouseListener, MouseMotionListener, ActionListener\r
  12 {\r
  13   boolean active = false;\r
  14   Image image;\r
  15   AlignmentPanel ap ;\r
  16   boolean resizing = false;\r
  17   int oldY, mouseX;\r
  18   static String ADDNEW = "Add New Row";\r
  19   static String HIDE = "Hide This Row";\r
  20   static String DELETE = "Delete This Row";\r
  21   static String SHOWALL="Show All Hidden Rows";\r
  22   static String OUTPUT_TEXT="Show Values In Textbox";\r
  23   int selectedRow = 0;\r
  24   int scrollOffset = 0;\r
  25 \r
  26   public AnnotationLabels(AlignmentPanel ap)\r
  27   {\r
  28     this.ap = ap;\r
  29 \r
  30     java.net.URL url = getClass().getResource("/images/idwidth.gif");\r
  31     Image temp = null;\r
  32     if (url != null)\r
  33       temp = java.awt.Toolkit.getDefaultToolkit().createImage(url);\r
  34 \r
  35     try\r
  36     {\r
  37       MediaTracker mt = new MediaTracker(this);\r
  38       mt.addImage(temp, 0);\r
  39       mt.waitForID(0);\r
  40     }\r
  41     catch (Exception ex) {}\r
  42 \r
  43     BufferedImage bi = new BufferedImage(temp.getHeight(this), temp.getWidth(this),\r
  44                                          BufferedImage.TYPE_INT_RGB);\r
  45     Graphics2D g = (Graphics2D) bi.getGraphics();\r
  46     g.rotate(Math.toRadians(90));\r
  47     g.drawImage(temp, 0, -bi.getWidth(this), this);\r
  48     image = (Image) bi;\r
  49 \r
  50     addMouseListener(this);\r
  51     addMouseMotionListener(this);\r
  52   }\r
  53 \r
  54   public void setScrollOffset(int y)\r
  55   {\r
  56     scrollOffset = y;\r
  57     repaint();\r
  58   }\r
  59 \r
  60   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  61   {\r
  62     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
  63 \r
  64     if(evt.getActionCommand().equals(ADDNEW))\r
  65     {\r
  66       String label = JOptionPane.showInputDialog(this, "Label for annotation");\r
  67       if(label==null)\r
  68         label = "";\r
  69       ap.av.alignment.addAnnotation(new AlignmentAnnotation\r
  70                                       (label,\r
  71                                        "New description",\r
  72                                        new Annotation[ap.av.alignment.getWidth()]));\r
  73     }\r
  74    else if(evt.getActionCommand().equals(HIDE))\r
  75    {\r
  76      aa[selectedRow].visible = false;\r
  77      if(aa[selectedRow].label.equals("Conservation"))\r
  78        ap.av.showConservation = false;\r
  79      if(aa[selectedRow].label.equals("Quality"))\r
  80        ap.av.showQuality = false;\r
  81      if(aa[selectedRow].label.equals("Consensus"))\r
  82        ap.av.showIdentity = false;\r
  83    }\r
  84    else if(evt.getActionCommand().equals(DELETE))\r
  85    {\r
  86      ap.av.alignment.deleteAnnotation(aa[selectedRow]);\r
  87    }\r
  88    else if(evt.getActionCommand().equals(SHOWALL))\r
  89    {\r
  90        for(int i=0; i<aa.length; i++)\r
  91          aa[i].visible = true;\r
  92    }\r
  93    else if(evt.getActionCommand().equals(OUTPUT_TEXT))\r
  94    {\r
  95      CutAndPasteTransfer cap = new CutAndPasteTransfer();\r
  96      Desktop.addInternalFrame(cap, ap.alignFrame.getTitle()+" - "+ aa[selectedRow].label, 500, 100);\r
  97      cap.setText( aa[selectedRow].toString() );\r
  98    }\r
  99 \r
 100    ap.annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 101    ap.repaint();\r
 102 \r
 103   }\r
 104 \r
 105   public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
 106   {\r
 107     int y = evt.getY() - scrollOffset;\r
 108 \r
 109       AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
 110        if(aa==null || aa.length==0)\r
 111        {\r
 112             JPopupMenu pop = new JPopupMenu("Annotations");\r
 113             JMenuItem item = new JMenuItem(ADDNEW);\r
 114             item.addActionListener(this);\r
 115             pop.add(item);\r
 116             pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 117             return;\r
 118        }\r
 119 \r
 120        int height = 0;\r
 121        for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
 122        {\r
 123          if(!aa[i].visible)\r
 124            continue;\r
 125 \r
 126          height += aa[i].height;\r
 127          if(y<height)\r
 128          {\r
 129            selectedRow = i;\r
 130            break;\r
 131          }\r
 132        }\r
 133 \r
 134       JPopupMenu pop = new JPopupMenu("Annotations");\r
 135       JMenuItem item = new JMenuItem(ADDNEW);\r
 136       item.addActionListener(this);\r
 137       pop.add(item);\r
 138       item = new JMenuItem(HIDE);\r
 139       item.addActionListener(this);\r
 140       pop.add(item);\r
 141       item = new JMenuItem(DELETE);\r
 142       item.addActionListener(this);\r
 143       pop.add(item);\r
 144       item = new JMenuItem(SHOWALL);\r
 145       item.addActionListener(this);\r
 146       pop.add(item);\r
 147       item = new JMenuItem(OUTPUT_TEXT);\r
 148       item.addActionListener(this);\r
 149       pop.add(item);\r
 150       pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 151 \r
 152     oldY = evt.getY();\r
 153   }\r
 154 \r
 155   public void mouseReleased(MouseEvent evt){ active = false; repaint(); }\r
 156   public void mouseEntered(MouseEvent evt) { active = true;  repaint();}\r
 157   public void mouseExited(MouseEvent evt)  { active = false; repaint();}\r
 158   public void mouseDragged(MouseEvent evt)\r
 159   {\r
 160     active = true;\r
 161     Dimension d = ap.annotationScroller.getPreferredSize();\r
 162     int dif = evt.getY() - oldY;\r
 163 \r
 164     dif /= ap.av.charHeight;\r
 165     dif *= ap.av.charHeight;\r
 166 \r
 167     if(d.height-dif>20)\r
 168     {\r
 169       ap.annotationScroller.setPreferredSize(new Dimension(d.width,d.height - dif));\r
 170       d = ap.annotationSpaceFillerHolder.getPreferredSize();\r
 171       ap.annotationSpaceFillerHolder.setPreferredSize(new Dimension(d.width,d.height - dif));\r
 172       ap.repaint();\r
 173     }\r
 174     ap.addNotify();\r
 175   }\r
 176 \r
 177   public void mouseMoved(MouseEvent evt)   {}\r
 178   public void mouseClicked(MouseEvent evt) {}\r
 179 \r
 180   public void paintComponent(Graphics g1)\r
 181   {\r
 182     Graphics2D g = (Graphics2D)g1;\r
 183     g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);\r
 184 \r
 185     drawComponent(g);\r
 186   }\r
 187 \r
 188   public void drawComponent(Graphics2D g)\r
 189   {\r
 190     FontMetrics fm = g.getFontMetrics(g.getFont());\r
 191     g.setColor(Color.white);\r
 192     g.fillRect(0,0, getWidth(), getHeight());\r
 193 \r
 194     g.translate(0, scrollOffset);\r
 195     g.setColor(Color.black);\r
 196 \r
 197    AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
 198    int y = g.getFont().getSize();\r
 199    int x = 0;\r
 200 \r
 201    if(aa!=null)\r
 202    for(int i=0; i<aa.length; i++)\r
 203    {\r
 204      if(!aa[i].visible)\r
 205        continue;\r
 206 \r
 207      x = getWidth() - fm.stringWidth(aa[i].label)-3;\r
 208 \r
 209      if(aa[i].isGraph)\r
 210        y+=(aa[i].height/3);\r
 211 \r
 212      g.drawString(aa[i].label, x, y);\r
 213 \r
 214      if(aa[i].isGraph)\r
 215        y+=(2*aa[i].height/3);\r
 216     else\r
 217        y+=aa[i].height;\r
 218    }\r
 219 \r
 220    if (active)\r
 221    {\r
 222      if (image != null)\r
 223        g.drawImage(image, 2, 0, this);\r
 224    }\r
 225 \r
 226    if (aa == null || aa.length<1)\r
 227    {\r
 228      g.drawString("Right click", 2, 8);\r
 229      g.drawString("to add annotation", 2, 18);\r
 230    }\r
 231 \r
 232 \r
 233 \r
 234   }\r
 235 \r
 236 }\r