src/jalview/gui/AnnotationLabels.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import java.awt.*;\r
  22 import java.awt.event.*;\r
  23 import java.awt.image.*;\r
  24 import javax.swing.*;\r
  25 \r
  26 import jalview.datamodel.*;\r
  27 \r
  28 public class AnnotationLabels\r
  29     extends JPanel implements MouseListener,\r
  30     MouseMotionListener, ActionListener\r
  31 {\r
  32   static String ADDNEW = "Add New Row";\r
  33   static String HIDE = "Hide This Row";\r
  34   static String DELETE = "Delete This Row";\r
  35   static String SHOWALL = "Show All Hidden Rows";\r
  36   static String OUTPUT_TEXT = "Show Values In Textbox";\r
  37   boolean active = false;\r
  38   Image image;\r
  39   AlignmentPanel ap;\r
  40   boolean resizing = false;\r
  41   int oldY;\r
  42   int mouseX;\r
  43   int selectedRow = 0;\r
  44   int scrollOffset = 0;\r
  45 \r
  46   public AnnotationLabels(AlignmentPanel ap)\r
  47   {\r
  48     this.ap = ap;\r
  49 \r
  50     java.net.URL url = getClass().getResource("/images/idwidth.gif");\r
  51     Image temp = null;\r
  52 \r
  53     if (url != null)\r
  54     {\r
  55       temp = java.awt.Toolkit.getDefaultToolkit().createImage(url);\r
  56     }\r
  57 \r
  58     try\r
  59     {\r
  60       MediaTracker mt = new MediaTracker(this);\r
  61       mt.addImage(temp, 0);\r
  62       mt.waitForID(0);\r
  63     }\r
  64     catch (Exception ex)\r
  65     {\r
  66     }\r
  67 \r
  68     BufferedImage bi = new BufferedImage(temp.getHeight(this),\r
  69                                          temp.getWidth(this),\r
  70                                          BufferedImage.TYPE_INT_RGB);\r
  71     Graphics2D g = (Graphics2D) bi.getGraphics();\r
  72     g.rotate(Math.toRadians(90));\r
  73     g.drawImage(temp, 0, -bi.getWidth(this), this);\r
  74     image = (Image) bi;\r
  75 \r
  76     addMouseListener(this);\r
  77     addMouseMotionListener(this);\r
  78   }\r
  79 \r
  80   public void setScrollOffset(int y)\r
  81   {\r
  82     scrollOffset = y;\r
  83     repaint();\r
  84   }\r
  85 \r
  86   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  87   {\r
  88     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
  89 \r
  90     if (evt.getActionCommand().equals(ADDNEW))\r
  91     {\r
  92       String label = JOptionPane.showInputDialog(this,\r
  93                                                  "Label for annotation");\r
  94 \r
  95       if (label == null)\r
  96       {\r
  97         label = "";\r
  98       }\r
  99 \r
 100       ap.av.alignment.addAnnotation(new AlignmentAnnotation(label,\r
 101           "New description",\r
 102           new Annotation[ap.av.alignment.getWidth()]));\r
 103     }\r
 104     else if (evt.getActionCommand().equals(HIDE))\r
 105     {\r
 106       aa[selectedRow].visible = false;\r
 107 \r
 108       if (aa[selectedRow].label.equals("Conservation"))\r
 109       {\r
 110         ap.av.showConservation = false;\r
 111       }\r
 112 \r
 113       if (aa[selectedRow].label.equals("Quality"))\r
 114       {\r
 115         ap.av.showQuality = false;\r
 116       }\r
 117 \r
 118       if (aa[selectedRow].label.equals("Consensus"))\r
 119       {\r
 120         ap.av.showIdentity = false;\r
 121       }\r
 122     }\r
 123     else if (evt.getActionCommand().equals(DELETE))\r
 124     {\r
 125       ap.av.alignment.deleteAnnotation(aa[selectedRow]);\r
 126     }\r
 127     else if (evt.getActionCommand().equals(SHOWALL))\r
 128     {\r
 129       for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
 130       {\r
 131         aa[i].visible = true;\r
 132       }\r
 133     }\r
 134     else if (evt.getActionCommand().equals(OUTPUT_TEXT))\r
 135     {\r
 136       CutAndPasteTransfer cap = new CutAndPasteTransfer();\r
 137       Desktop.addInternalFrame(cap,\r
 138                                ap.alignFrame.getTitle() + " - " +\r
 139                                aa[selectedRow].label, 500,\r
 140                                100);\r
 141       cap.setText(aa[selectedRow].toString());\r
 142     }\r
 143 \r
 144     ap.annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 145     ap.repaint();\r
 146   }\r
 147 \r
 148   public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
 149   {\r
 150     int y = evt.getY() - scrollOffset;\r
 151 \r
 152     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
 153 \r
 154     if ( (aa == null) || (aa.length == 0))\r
 155     {\r
 156       JPopupMenu pop = new JPopupMenu("Annotations");\r
 157       JMenuItem item = new JMenuItem(ADDNEW);\r
 158       item.addActionListener(this);\r
 159       pop.add(item);\r
 160       pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 161 \r
 162       return;\r
 163     }\r
 164 \r
 165     int height = 0;\r
 166 \r
 167     for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
 168     {\r
 169       if (!aa[i].visible)\r
 170       {\r
 171         continue;\r
 172       }\r
 173 \r
 174       height += aa[i].height;\r
 175 \r
 176       if (y < height)\r
 177       {\r
 178         selectedRow = i;\r
 179 \r
 180         break;\r
 181       }\r
 182     }\r
 183 \r
 184     JPopupMenu pop = new JPopupMenu("Annotations");\r
 185     JMenuItem item = new JMenuItem(ADDNEW);\r
 186     item.addActionListener(this);\r
 187     pop.add(item);\r
 188     item = new JMenuItem(HIDE);\r
 189     item.addActionListener(this);\r
 190     pop.add(item);\r
 191     item = new JMenuItem(DELETE);\r
 192     item.addActionListener(this);\r
 193     pop.add(item);\r
 194     item = new JMenuItem(SHOWALL);\r
 195     item.addActionListener(this);\r
 196     pop.add(item);\r
 197     item = new JMenuItem(OUTPUT_TEXT);\r
 198     item.addActionListener(this);\r
 199     pop.add(item);\r
 200     pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 201 \r
 202     oldY = evt.getY();\r
 203   }\r
 204 \r
 205   public void mouseReleased(MouseEvent evt)\r
 206   {\r
 207     active = false;\r
 208     repaint();\r
 209   }\r
 210 \r
 211   public void mouseEntered(MouseEvent evt)\r
 212   {\r
 213     active = true;\r
 214     repaint();\r
 215   }\r
 216 \r
 217   public void mouseExited(MouseEvent evt)\r
 218   {\r
 219     active = false;\r
 220     repaint();\r
 221   }\r
 222 \r
 223   public void mouseDragged(MouseEvent evt)\r
 224   {\r
 225     active = true;\r
 226 \r
 227     Dimension d = ap.annotationScroller.getPreferredSize();\r
 228     int dif = evt.getY() - oldY;\r
 229 \r
 230     dif /= ap.av.charHeight;\r
 231     dif *= ap.av.charHeight;\r
 232 \r
 233     if ( (d.height - dif) > 20)\r
 234     {\r
 235       ap.annotationScroller.setPreferredSize(new Dimension(d.width,\r
 236           d.height - dif));\r
 237       d = ap.annotationSpaceFillerHolder.getPreferredSize();\r
 238       ap.annotationSpaceFillerHolder.setPreferredSize(new Dimension(\r
 239           d.width, d.height - dif));\r
 240       ap.repaint();\r
 241     }\r
 242 \r
 243     ap.addNotify();\r
 244   }\r
 245 \r
 246   public void mouseMoved(MouseEvent evt)\r
 247   {\r
 248   }\r
 249 \r
 250   public void mouseClicked(MouseEvent evt)\r
 251   {\r
 252   }\r
 253 \r
 254   public void paintComponent(Graphics g1)\r
 255   {\r
 256     Graphics2D g = (Graphics2D) g1;\r
 257     g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,\r
 258                        RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);\r
 259 \r
 260     drawComponent(g);\r
 261   }\r
 262 \r
 263   public void drawComponent(Graphics2D g)\r
 264   {\r
 265     FontMetrics fm = g.getFontMetrics(g.getFont());\r
 266     g.setColor(Color.white);\r
 267     g.fillRect(0, 0, getWidth(), getHeight());\r
 268 \r
 269     g.translate(0, scrollOffset);\r
 270     g.setColor(Color.black);\r
 271 \r
 272     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
 273     int y = g.getFont().getSize();\r
 274     int x = 0;\r
 275 \r
 276     if (aa != null)\r
 277     {\r
 278       for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
 279       {\r
 280         if (!aa[i].visible)\r
 281         {\r
 282           continue;\r
 283         }\r
 284 \r
 285         x = getWidth() - fm.stringWidth(aa[i].label) - 3;\r
 286 \r
 287         if (aa[i].isGraph)\r
 288         {\r
 289           y += (aa[i].height / 3);\r
 290         }\r
 291 \r
 292         g.drawString(aa[i].label, x, y);\r
 293 \r
 294         if (aa[i].isGraph)\r
 295         {\r
 296           y += ( (2 * aa[i].height) / 3);\r
 297         }\r
 298         else\r
 299         {\r
 300           y += aa[i].height;\r
 301         }\r
 302       }\r
 303     }\r
 304 \r
 305     if (active)\r
 306     {\r
 307       if (image != null)\r
 308       {\r
 309         g.drawImage(image, 2, 0, this);\r
 310       }\r
 311     }\r
 312 \r
 313     if ( (aa == null) || (aa.length < 1))\r
 314     {\r
 315       g.drawString("Right click", 2, 8);\r
 316       g.drawString("to add annotation", 2, 18);\r
 317     }\r
 318   }\r
 319 }\r