src/jalview/gui/AnnotationLabels.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import java.awt.*;\r
  22 import java.awt.event.*;\r
  23 import java.awt.image.*;\r
  24 import javax.swing.*;\r
  25 \r
  26 import jalview.datamodel.*;\r
  27 \r
  28 public class AnnotationLabels\r
  29     extends JPanel implements MouseListener,\r
  30     MouseMotionListener, ActionListener\r
  31 {\r
  32   static String ADDNEW = "Add New Row";\r
  33   static String HIDE = "Hide This Row";\r
  34   static String DELETE = "Delete This Row";\r
  35   static String SHOWALL = "Show All Hidden Rows";\r
  36   static String OUTPUT_TEXT = "Show Values In Textbox";\r
  37   boolean active = false;\r
  38   Image image;\r
  39   AlignmentPanel ap;\r
  40   boolean resizing = false;\r
  41   int oldY;\r
  42   int mouseX;\r
  43   int selectedRow = 0;\r
  44   int scrollOffset = 0;\r
  45 \r
  46   public AnnotationLabels(AlignmentPanel ap)\r
  47   {\r
  48     this.ap = ap;\r
  49 \r
  50     java.net.URL url = getClass().getResource("/images/idwidth.gif");\r
  51     Image temp = null;\r
  52 \r
  53     if (url != null)\r
  54     {\r
  55       temp = java.awt.Toolkit.getDefaultToolkit().createImage(url);\r
  56     }\r
  57 \r
  58     try\r
  59     {\r
  60       MediaTracker mt = new MediaTracker(this);\r
  61       mt.addImage(temp, 0);\r
  62       mt.waitForID(0);\r
  63     }\r
  64     catch (Exception ex)\r
  65     {\r
  66     }\r
  67 \r
  68     BufferedImage bi = new BufferedImage(temp.getHeight(this),\r
  69                                          temp.getWidth(this),\r
  70                                          BufferedImage.TYPE_INT_RGB);\r
  71     Graphics2D g = (Graphics2D) bi.getGraphics();\r
  72     g.rotate(Math.toRadians(90));\r
  73     g.drawImage(temp, 0, -bi.getWidth(this), this);\r
  74     image = (Image) bi;\r
  75 \r
  76     addMouseListener(this);\r
  77     addMouseMotionListener(this);\r
  78   }\r
  79 \r
  80   public void setScrollOffset(int y)\r
  81   {\r
  82     scrollOffset = y;\r
  83     repaint();\r
  84   }\r
  85 \r
  86   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  87   {\r
  88     int dif = 0;\r
  89     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
  90 \r
  91     if (evt.getActionCommand().equals(ADDNEW))\r
  92     {\r
  93       String label = JOptionPane.showInputDialog(this,\r
  94                                                  "Label for annotation");\r
  95       if (label == null)\r
  96         label = "";\r
  97 \r
  98       ap.av.alignment.addAnnotation(new AlignmentAnnotation(label,\r
  99           "New description",\r
 100           new Annotation[ap.av.alignment.getWidth()]));\r
 101 \r
 102       dif = aa[aa.length-1].height;\r
 103     }\r
 104     else if (evt.getActionCommand().equals(HIDE))\r
 105     {\r
 106       aa[selectedRow].visible = false;\r
 107 \r
 108       if (aa[selectedRow].label.equals("Conservation"))\r
 109       {\r
 110         ap.av.showConservation = false;\r
 111       }\r
 112 \r
 113       if (aa[selectedRow].label.equals("Quality"))\r
 114       {\r
 115         ap.av.showQuality = false;\r
 116       }\r
 117 \r
 118       if (aa[selectedRow].label.equals("Consensus"))\r
 119       {\r
 120         ap.av.showIdentity = false;\r
 121       }\r
 122 \r
 123       dif = aa[selectedRow].height*-1;\r
 124     }\r
 125     else if (evt.getActionCommand().equals(DELETE))\r
 126     {\r
 127       ap.av.alignment.deleteAnnotation(aa[selectedRow]);\r
 128       dif = aa[selectedRow].height*-1;\r
 129     }\r
 130     else if (evt.getActionCommand().equals(SHOWALL))\r
 131     {\r
 132       for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
 133       {\r
 134         if(!aa[i].visible)\r
 135          {\r
 136            dif+=aa[i].height;\r
 137            aa[i].visible = true;\r
 138          }\r
 139       }\r
 140     }\r
 141     else if (evt.getActionCommand().equals(OUTPUT_TEXT))\r
 142     {\r
 143       CutAndPasteTransfer cap = new CutAndPasteTransfer();\r
 144       Desktop.addInternalFrame(cap,\r
 145                                ap.alignFrame.getTitle() + " - " +\r
 146                                aa[selectedRow].label, 500,\r
 147                                100);\r
 148       cap.setText(aa[selectedRow].toString());\r
 149     }\r
 150 \r
 151     ap.annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
 152 \r
 153     Dimension d = ap.annotationScroller.getPreferredSize();\r
 154     ap.annotationScroller.setPreferredSize(new Dimension(d.width, d.height+dif));\r
 155     d = ap.annotationSpaceFillerHolder.getPreferredSize();\r
 156     ap.annotationSpaceFillerHolder.setPreferredSize(new Dimension(\r
 157         d.width, d.height+dif));\r
 158 \r
 159       ap.addNotify();\r
 160 \r
 161 \r
 162   }\r
 163 \r
 164   public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
 165   {\r
 166     oldY = evt.getY();\r
 167   }\r
 168 \r
 169   public void mouseReleased(MouseEvent evt)\r
 170   {\r
 171     active = false;\r
 172     repaint();\r
 173   }\r
 174 \r
 175   public void mouseEntered(MouseEvent evt)\r
 176   {\r
 177     active = true;\r
 178     repaint();\r
 179   }\r
 180 \r
 181   public void mouseExited(MouseEvent evt)\r
 182   {\r
 183     active = false;\r
 184     repaint();\r
 185   }\r
 186 \r
 187   public void mouseDragged(MouseEvent evt)\r
 188   {\r
 189     active = true;\r
 190 \r
 191     Dimension d = ap.annotationScroller.getPreferredSize();\r
 192     int dif = evt.getY() - oldY;\r
 193 \r
 194     dif /= ap.av.charHeight;\r
 195     dif *= ap.av.charHeight;\r
 196 \r
 197     if ( (d.height - dif) > 20)\r
 198     {\r
 199       ap.annotationScroller.setPreferredSize(new Dimension(d.width,\r
 200           d.height - dif));\r
 201       d = ap.annotationSpaceFillerHolder.getPreferredSize();\r
 202       ap.annotationSpaceFillerHolder.setPreferredSize(new Dimension(\r
 203           d.width, d.height - dif));\r
 204       ap.repaint();\r
 205     }\r
 206 \r
 207     ap.addNotify();\r
 208   }\r
 209 \r
 210   public void mouseMoved(MouseEvent evt)\r
 211   {\r
 212   }\r
 213 \r
 214   public void mouseClicked(MouseEvent evt)\r
 215   {\r
 216     int y = evt.getY() - scrollOffset;\r
 217     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
 218 \r
 219     if ( (aa == null) || (aa.length == 0))\r
 220     {\r
 221       JPopupMenu pop = new JPopupMenu("Annotations");\r
 222       JMenuItem item = new JMenuItem(ADDNEW);\r
 223       item.addActionListener(this);\r
 224       pop.add(item);\r
 225       pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 226 \r
 227       return;\r
 228     }\r
 229 \r
 230     int height = 0;\r
 231 \r
 232     for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
 233     {\r
 234       if (!aa[i].visible)\r
 235       {\r
 236         continue;\r
 237       }\r
 238 \r
 239       height += aa[i].height;\r
 240 \r
 241       if (y < height)\r
 242       {\r
 243         selectedRow = i;\r
 244 \r
 245         break;\r
 246       }\r
 247     }\r
 248 \r
 249     JPopupMenu pop = new JPopupMenu("Annotations");\r
 250     JMenuItem item = new JMenuItem(ADDNEW);\r
 251     item.addActionListener(this);\r
 252     pop.add(item);\r
 253     item = new JMenuItem(HIDE);\r
 254     item.addActionListener(this);\r
 255     pop.add(item);\r
 256     item = new JMenuItem(DELETE);\r
 257     item.addActionListener(this);\r
 258     pop.add(item);\r
 259     item = new JMenuItem(SHOWALL);\r
 260     item.addActionListener(this);\r
 261     pop.add(item);\r
 262     item = new JMenuItem(OUTPUT_TEXT);\r
 263     item.addActionListener(this);\r
 264     pop.add(item);\r
 265     pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
 266   }\r
 267 \r
 268   public void paintComponent(Graphics g1)\r
 269   {\r
 270     Graphics2D g = (Graphics2D) g1;\r
 271     g.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,\r
 272                        RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);\r
 273 \r
 274     drawComponent(g);\r
 275   }\r
 276 \r
 277   public void drawComponent(Graphics2D g)\r
 278   {\r
 279     FontMetrics fm = g.getFontMetrics(g.getFont());\r
 280     g.setColor(Color.white);\r
 281     g.fillRect(0, 0, getWidth(), getHeight());\r
 282 \r
 283     g.translate(0, scrollOffset);\r
 284     g.setColor(Color.black);\r
 285 \r
 286     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
 287     int y = g.getFont().getSize();\r
 288     int x = 0;\r
 289 \r
 290     if (aa != null)\r
 291     {\r
 292       for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
 293       {\r
 294         if (!aa[i].visible)\r
 295         {\r
 296           continue;\r
 297         }\r
 298 \r
 299         x = getWidth() - fm.stringWidth(aa[i].label) - 3;\r
 300 \r
 301         if (aa[i].isGraph)\r
 302         {\r
 303           y += (aa[i].height / 3);\r
 304         }\r
 305 \r
 306         g.drawString(aa[i].label, x, y);\r
 307 \r
 308         if (aa[i].isGraph)\r
 309         {\r
 310           y += ( (2 * aa[i].height) / 3);\r
 311         }\r
 312         else\r
 313         {\r
 314           y += aa[i].height;\r
 315         }\r
 316       }\r
 317     }\r
 318 \r
 319     if (active)\r
 320     {\r
 321       if (image != null)\r
 322       {\r
 323         g.drawImage(image, 2, 0, this);\r
 324       }\r
 325     }\r
 326 \r
 327     if ( (aa == null) || (aa.length < 1))\r
 328     {\r
 329       g.drawString("Right click", 2, 8);\r
 330       g.drawString("to add annotation", 2, 18);\r
 331     }\r
 332   }\r
 333 }\r