JAL-1632 add score model params to PCAModel and PCA constructors
[jalview.git] / src / jalview / gui / CutAndPasteHtmlTransfer.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.gui;
22
23 import jalview.io.JalviewFileChooser;
24 import jalview.io.JalviewFileView;
25 import jalview.jbgui.GCutAndPasteHtmlTransfer;
26 import jalview.util.MessageManager;
27 import jalview.viewmodel.AlignmentViewport;
28
29 import java.awt.Toolkit;
30 import java.awt.datatransfer.Clipboard;
31 import java.awt.datatransfer.StringSelection;
32 import java.awt.event.ActionEvent;
33 import java.awt.event.ActionListener;
34 import java.awt.event.KeyEvent;
35 import java.awt.event.KeyListener;
36 import java.awt.event.MouseEvent;
37 import java.io.StringWriter;
38
39 import javax.swing.JMenuItem;
40 import javax.swing.JPopupMenu;
41 import javax.swing.SwingUtilities;
42 import javax.swing.event.HyperlinkEvent;
43 import javax.swing.event.HyperlinkEvent.EventType;
44 import javax.swing.event.HyperlinkListener;
45
46 /**
47  * Cut'n'paste files into the desktop See JAL-1105
48  * 
49  * @author $author$
50  * @version $Revision$
51  */
52 public class CutAndPasteHtmlTransfer extends GCutAndPasteHtmlTransfer
53 {
54
55   AlignmentViewport viewport;
56
57   public CutAndPasteHtmlTransfer()
58   {
59     super();
60     displaySource.setSelected(false);
61     textarea.addKeyListener(new KeyListener()
62     {
63
64       @Override
65       public void keyTyped(KeyEvent arg0)
66       {
67         // if (arg0.isControlDown() && arg0.getKeyCode()==KeyEvent.VK_C)
68         // {
69         // copyItem_actionPerformed(null);
70         // }
71         arg0.consume();
72       }
73
74       @Override
75       public void keyReleased(KeyEvent arg0)
76       {
77         // TODO Auto-generated method stub
78
79       }
80
81       @Override
82       public void keyPressed(KeyEvent arg0)
83       {
84         // TODO Auto-generated method stub
85
86       }
87     });
88     textarea.setEditable(false);
89     textarea.addHyperlinkListener(new HyperlinkListener()
90     {
91
92       @Override
93       public void hyperlinkUpdate(HyperlinkEvent e)
94       {
95         if (e.getEventType().equals(EventType.ACTIVATED))
96         {
97           Desktop.showUrl(e.getURL().toExternalForm());
98         }
99       }
100     });
101     SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
102     {
103       @Override
104       public void run()
105       {
106         textarea.requestFocus();
107       }
108     });
109
110   }
111
112   /**
113    * DOCUMENT ME!
114    */
115   public void setForInput(AlignmentViewport viewport)
116   {
117     this.viewport = viewport;
118     if (viewport != null)
119     {
120       ok.setText(MessageManager.getString("action.add"));
121     }
122
123     getContentPane().add(inputButtonPanel, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
124   }
125
126   /**
127    * DOCUMENT ME!
128    * 
129    * @return DOCUMENT ME!
130    */
131   public String getText()
132   {
133     return textarea.getText();
134   }
135
136   /**
137    * Set contents of HTML Display pane
138    * 
139    * @param text
140    *          HTML text
141    */
142   public void setText(String text)
143   {
144     textarea.setText(text);
145   }
146
147   @Override
148   public void save_actionPerformed(ActionEvent e)
149   {
150     JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(
151             jalview.bin.Cache.getProperty("LAST_DIRECTORY"));
152
153     chooser.setAcceptAllFileFilterUsed(false);
154     chooser.setFileView(new JalviewFileView());
155     chooser.setDialogTitle(MessageManager
156             .getString("label.save_text_to_file"));
157     chooser.setToolTipText(MessageManager.getString("action.save"));
158
159     int value = chooser.showSaveDialog(this);
160
161     if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)
162     {
163       try
164       {
165         java.io.PrintWriter out = new java.io.PrintWriter(
166                 new java.io.FileWriter(chooser.getSelectedFile()));
167
168         out.print(getText());
169         out.close();
170       } catch (Exception ex)
171       {
172         ex.printStackTrace();
173       }
174
175     }
176   }
177
178   @Override
179   public void toggleHtml_actionPerformed(ActionEvent e)
180   {
181     String txt = textarea.getText();
182     textarea.setContentType(displaySource.isSelected() ? "text/text"
183             : "text/html");
184     textarea.setText(txt);
185   }
186
187   /**
188    * DOCUMENT ME!
189    * 
190    * @param e
191    *          DOCUMENT ME!
192    */
193   @Override
194   public void copyItem_actionPerformed(ActionEvent e)
195   {
196     Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
197     StringWriter sw = new StringWriter();
198     try
199     {
200       textarea.getEditorKit().write(sw, textarea.getDocument(),
201               textarea.getSelectionStart(),
202               textarea.getSelectionEnd() - textarea.getSelectionStart());
203     } catch (Exception x)
204     {
205     }
206     ;
207     StringSelection ssel = new StringSelection(sw.getBuffer().toString());
208     c.setContents(ssel, ssel);
209   }
210
211   /**
212    * DOCUMENT ME!
213    * 
214    * @param e
215    *          DOCUMENT ME!
216    */
217   @Override
218   public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
219   {
220     try
221     {
222       this.setClosed(true);
223     } catch (Exception ex)
224     {
225     }
226   }
227
228   @Override
229   public void textarea_mousePressed(MouseEvent e)
230   {
231     // isPopupTrigger is on mousePressed (Mac) or mouseReleased (Windows)
232     if (e.isPopupTrigger())
233     {
234       JPopupMenu popup = new JPopupMenu(
235               MessageManager.getString("action.edit"));
236       JMenuItem item = new JMenuItem(
237               MessageManager.getString("action.copy"));
238       item.addActionListener(new ActionListener()
239       {
240         @Override
241         public void actionPerformed(ActionEvent e)
242         {
243           copyItem_actionPerformed(e);
244         }
245       });
246       popup.add(item);
247       popup.show(this, e.getX() + 10, e.getY() + textarea.getY() + 40);
248
249     }
250   }
251
252 }