src/jalview/gui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.gui;
  20
  21 import jalview.datamodel.*;
  22
  23 import jalview.io.*;
  24
  25 import jalview.jbgui.*;
  26
  27 import java.awt.*;
  28 import java.awt.datatransfer.*;
  29 import java.awt.event.*;
  30
  31 import javax.swing.*;
  32
  33
  34 /**
  35  * DOCUMENT ME!
  36  *
  37  * @author $author$
  38  * @version $Revision$
  39  */
  40 public class CutAndPasteTransfer extends GCutAndPasteTransfer
  41 {
  42
  43   AlignViewport viewport;
  44
  45   public CutAndPasteTransfer()
  46   {
  47     SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()
  48     {
  49       public void run()
  50       {
  51         textarea.requestFocus();
  52       }
  53     });
  54
  55   }
  56
  57     /**
  58      * DOCUMENT ME!
  59      */
  60     public void setForInput(AlignViewport viewport)
  61     {
  62       this.viewport = viewport;
  63       getContentPane().add(inputButtonPanel, java.awt.BorderLayout.SOUTH);
  64     }
  65
  66     /**
  67      * DOCUMENT ME!
  68      *
  69      * @return DOCUMENT ME!
  70      */
  71     public String getText()
  72     {
  73         return textarea.getText();
  74     }
  75
  76     /**
  77      * DOCUMENT ME!
  78      *
  79      * @param text DOCUMENT ME!
  80      */
  81     public void setText(String text)
  82     {
  83         textarea.setText(text);
  84     }
  85
  86     public void appendText(String text)
  87     {
  88       textarea.append(text);
  89     }
  90
  91
  92     public void save_actionPerformed(ActionEvent e)
  93     {
  94       JalviewFileChooser chooser = new JalviewFileChooser(
  95           jalview.bin.Cache.getProperty(
  96               "LAST_DIRECTORY"));
  97
  98       chooser.setAcceptAllFileFilterUsed(false);
  99       chooser.setFileView(new JalviewFileView());
 100       chooser.setDialogTitle("Save Text to File");
 101       chooser.setToolTipText("Save");
 102
 103       int value = chooser.showSaveDialog(this);
 104
 105       if (value == JalviewFileChooser.APPROVE_OPTION)
 106       {
 107         try
 108         {
 109           java.io.PrintWriter out = new java.io.PrintWriter(
 110               new java.io.FileWriter(chooser.getSelectedFile()));
 111
 112           out.print(getText());
 113           out.close();
 114         }
 115         catch (Exception ex)
 116         {
 117           ex.printStackTrace();
 118         }
 119
 120       }
 121     }
 122
 123
 124
 125     /**
 126      * DOCUMENT ME!
 127      *
 128      * @param e DOCUMENT ME!
 129      */
 130     public void copyItem_actionPerformed(ActionEvent e)
 131     {
 132         textarea.getSelectedText();
 133         Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 134         c.setContents(new StringSelection(textarea.getSelectedText()), null);
 135     }
 136
 137     /**
 138      * DOCUMENT ME!
 139      *
 140      * @param e DOCUMENT ME!
 141      */
 142     public void pasteMenu_actionPerformed(ActionEvent e)
 143     {
 144         Clipboard c = Toolkit.getDefaultToolkit().getSystemClipboard();
 145         Transferable contents = c.getContents(this);
 146
 147         if (contents == null)
 148         {
 149             return;
 150         }
 151
 152         try
 153         {
 154             textarea.append((String) contents.getTransferData(
 155                     DataFlavor.stringFlavor));
 156         }
 157         catch (Exception ex)
 158         {
 159         }
 160     }
 161
 162     /**
 163      * DOCUMENT ME!
 164      *
 165      * @param e DOCUMENT ME!
 166      */
 167     public void ok_actionPerformed(ActionEvent e)
 168     {
 169         String format = new IdentifyFile().Identify(getText(), "Paste");
 170         SequenceI[] sequences = null;
 171
 172         if (FormatAdapter.isValidFormat(format))
 173         {
 174           try{
 175             sequences = new FormatAdapter().readFile(getText(), "Paste", format);
 176           }catch(java.io.IOException ex)
 177           {
 178             JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,
 179                                                   "Couldn't read the pasted text.\n" +ex.toString(),
 180                                                   "Error parsing text",
 181                                                   JOptionPane.WARNING_MESSAGE);
 182           }
 183         }
 184
 185         if (sequences != null)
 186         {
 187           if(viewport!=null)
 188           {
 189             for(int i=0; i<sequences.length; i++)
 190               viewport.getAlignment().addSequence(sequences[i]);
 191
 192             viewport.firePropertyChange("alignment", null, viewport.getAlignment().getSequences());
 193           }
 194           else
 195           {
 196             AlignFrame af = new AlignFrame(new Alignment(sequences));
 197             af.currentFileFormat = format;
 198             Desktop.addInternalFrame(af, "Cut & Paste input - " + format,
 199                                      AlignFrame.NEW_WINDOW_WIDTH,
 200                                      AlignFrame.NEW_WINDOW_HEIGHT);
 201             af.statusBar.setText("Successfully pasted alignment file");
 202
 203             try
 204             {
 205               af.setMaximum(jalview.bin.Cache.getDefault("SHOW_FULLSCREEN", false));
 206             }
 207             catch (Exception ex)
 208             {
 209             }
 210           }
 211         }
 212     }
 213
 214     /**
 215      * DOCUMENT ME!
 216      *
 217      * @param e DOCUMENT ME!
 218      */
 219     public void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)
 220     {
 221         try
 222         {
 223             this.setClosed(true);
 224         }
 225         catch (Exception ex)
 226         {
 227         }
 228     }
 229
 230     public void textarea_mousePressed(MouseEvent e)
 231     {
 232       if(SwingUtilities.isRightMouseButton(e))
 233       {
 234         JPopupMenu popup = new JPopupMenu("Edit");
 235         JMenuItem item = new JMenuItem("Copy");
 236         item.addActionListener(new ActionListener()
 237             {public void actionPerformed(ActionEvent e)
 238                   {
 239                     copyItem_actionPerformed(e);
 240                   }
 241             });
 242         popup.add(item);
 243         item = new JMenuItem("Paste");
 244         item.addActionListener(new ActionListener()
 245             {public void actionPerformed(ActionEvent e)
 246                   {
 247                     pasteMenu_actionPerformed(e);
 248                   }
 249             });
 250         popup.add(item);
 251         popup.show(this, e.getX()+10, e.getY()+textarea.getY()+40);
 252
 253       }
 254     }
 255
 256 }