src/jalview/gui/DasSourceBrowser.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.jbgui.*;\r
  22 import javax.swing.table.AbstractTableModel;\r
  23 import javax.swing.event.*;\r
  24 import jalview.util.TableSorter;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 import javax.swing.*;\r
  27 import java.util.*;\r
  28 \r
  29 \r
  30 import org.biojava.dasobert.dasregistry.DasCoordinateSystem;\r
  31 import org.biojava.dasobert.dasregistry.DasSource;\r
  32 import org.biojava.dasobert.dasregistry.Das1Source;\r
  33 import java.awt.BorderLayout;\r
  34 \r
  35 public class DasSourceBrowser extends GDasSourceBrowser\r
  36     implements Runnable, ListSelectionListener\r
  37 {\r
  38   static DasSource[] dasSources = null;\r
  39 \r
  40   Hashtable localSources = null;\r
  41 \r
  42   Vector selectedSources;\r
  43 \r
  44   public DasSourceBrowser()\r
  45   {\r
  46     registryURL.setText(jalview.bin.Cache.getDefault("DAS_REGISTRY_URL",\r
  47         "http://www.spice-3d.org/dasregistry/das1/sources") );\r
  48 \r
  49     setSelectedFromProperties();\r
  50 \r
  51     displayFullDetails(null);\r
  52     table.setSelectionMode(ListSelectionModel.SINGLE_SELECTION);\r
  53 \r
  54     filter1.addListSelectionListener(this);\r
  55     filter2.addListSelectionListener(this);\r
  56     filter3.addListSelectionListener(this);\r
  57 \r
  58     //Ask to be notified of selection changes.\r
  59     ListSelectionModel rowSM = table.getSelectionModel();\r
  60     rowSM.addListSelectionListener(new ListSelectionListener()\r
  61     {\r
  62       public void valueChanged(ListSelectionEvent e)\r
  63       {\r
  64         //Ignore extra messages.\r
  65         if (e.getValueIsAdjusting())\r
  66           return;\r
  67 \r
  68         ListSelectionModel lsm = (ListSelectionModel) e.getSource();\r
  69         if (!lsm.isSelectionEmpty())\r
  70         {\r
  71           int selectedRow = lsm.getMinSelectionIndex();\r
  72           displayFullDetails(table.getValueAt(selectedRow, 0).toString());\r
  73         }\r
  74       }\r
  75     });\r
  76 \r
  77     table.addMouseListener(new MouseAdapter()\r
  78         {\r
  79           public void mouseClicked(MouseEvent evt)\r
  80           {\r
  81             if(evt.getClickCount()==2\r
  82                || SwingUtilities.isRightMouseButton(evt))\r
  83               editRemoveLocalSource(evt);\r
  84           }\r
  85         });\r
  86 \r
  87     if(dasSources==null)\r
  88     {\r
  89     Thread worker = new Thread(this);\r
  90     worker.start();\r
  91     }\r
  92     else\r
  93      {\r
  94        init();\r
  95      }\r
  96   }\r
  97 \r
  98   void init()\r
  99   {\r
 100     int dSize = dasSources.length;\r
 101     Object[][] data = new Object[dSize][2];\r
 102     for (int i = 0; i < dSize; i++)\r
 103     {\r
 104       data[i][0] = dasSources[i].getNickname();\r
 105       data[i][1] = new Boolean(selectedSources.contains(dasSources[i].\r
 106           getNickname()));\r
 107     }\r
 108 \r
 109     refreshTableData(data);\r
 110     setCapabilities(dasSources);\r
 111 \r
 112     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 113         {\r
 114           public void run()\r
 115           {\r
 116             TableSorter sorter = (TableSorter)table.getModel();\r
 117             sorter.setSortingStatus(1, TableSorter.DESCENDING);\r
 118             sorter.setSortingStatus(1, TableSorter.NOT_SORTED);\r
 119           }\r
 120         });\r
 121 \r
 122     progressBar.setIndeterminate(false);\r
 123     progressBar.setVisible(false);\r
 124     addLocal.setVisible(true);\r
 125     refresh.setVisible(true);\r
 126   }\r
 127 \r
 128 \r
 129   public void refreshTableData(Object[][] data)\r
 130   {\r
 131     TableSorter sorter = new TableSorter(new DASTableModel(data));\r
 132     sorter.setTableHeader(table.getTableHeader());\r
 133     table.setModel(sorter);\r
 134   }\r
 135 \r
 136   void displayFullDetails(String nickName)\r
 137   {\r
 138 \r
 139     StringBuffer text = new StringBuffer(\r
 140         "<HTML><font size=\"2\" face=\"Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif\">");\r
 141 \r
 142     if (nickName == null)\r
 143     {\r
 144       fullDetails.setText(text +\r
 145                           "Select a DAS service from the table"\r
 146                           + " to read a full description here.</font></html>");\r
 147       return;\r
 148     }\r
 149 \r
 150     int dSize = dasSources.length;\r
 151     for (int i = 0; i < dSize; i++)\r
 152     {\r
 153       if (!dasSources[i].getNickname().equals(nickName))\r
 154         continue;\r
 155 \r
 156       DasSource ds = dasSources[i];\r
 157 \r
 158       text.append("<font color=\"#0000FF\">Id:</font> " + dasSources[i].getId() +\r
 159                   "<br>");\r
 160       text.append("<font color=\"#0000FF\">Nickname:</font> " +\r
 161                   dasSources[i].getNickname() + "<br>");\r
 162       text.append("<font color=\"#0000FF\">URL:</font> " + dasSources[i].getUrl() +\r
 163                   "<br>");\r
 164 \r
 165       text.append("<font color=\"#0000FF\">Admin Email:</font> <a href=\"mailto:"\r
 166                   +dasSources[i].getAdminemail()\r
 167                   +"\">"+dasSources[i].getAdminemail()+"</a>" +\r
 168                   "<br>");\r
 169 \r
 170 \r
 171       text.append("<font color=\"#0000FF\">Registered at:</font> " + dasSources[i].getRegisterDate() +\r
 172                         "<br>");\r
 173 \r
 174       text.append("<font color=\"#0000FF\">Last successful test:</font> " + dasSources[i].getLeaseDate() +\r
 175                         "<br>");\r
 176 \r
 177       text.append("<font color=\"#0000FF\">Labels:</font> ");\r
 178       for(int s=0; s<dasSources[i].getLabels().length; s++)\r
 179       {\r
 180         text.append( dasSources[i].getLabels()[s]);\r
 181         if(s<dasSources[i].getLabels().length-1)\r
 182           text.append(",");\r
 183         text.append(" ");\r
 184       }\r
 185       text.append("<br>");\r
 186 \r
 187 \r
 188 \r
 189       text.append("<font color=\"#0000FF\">Capabilities:</font> ");\r
 190       String[] scap = dasSources[i].getCapabilities();\r
 191       for (int j = 0; j < scap.length; j++)\r
 192       {\r
 193         text.append(scap[j]);\r
 194         if (j < scap.length - 1)\r
 195           text.append(", ");\r
 196       }\r
 197       text.append("<br>");\r
 198 \r
 199       text.append("<font color=\"#0000FF\">Coordinates:</font> ");\r
 200       DasCoordinateSystem[] dcs = ds.getCoordinateSystem();\r
 201       for (int j = 0; j < dcs.length; j++)\r
 202       {\r
 203         text.append("(" + dcs[j].getUniqueId() + ") "\r
 204                     + dcs[j].getCategory() + ", " + dcs[j].getName());\r
 205         if (dcs[j].getNCBITaxId() != 0)\r
 206           text.append(", " + dcs[j].getNCBITaxId());\r
 207         if (dcs[j].getOrganismName().length() > 0)\r
 208           text.append(", " + dcs[j].getOrganismName());\r
 209 \r
 210         text.append("<br>");\r
 211       }\r
 212 \r
 213       text.append("<font color=\"#0000FF\">Description:</font> " +\r
 214                   dasSources[i].getDescription() + "<br>");\r
 215 \r
 216 \r
 217       if (dasSources[i].getHelperurl()!=null\r
 218           && dasSources[i].getHelperurl().length() > 0)\r
 219       {\r
 220         text.append("<font color=\"#0000FF\"><a href=\"" +\r
 221                     dasSources[i].getHelperurl()\r
 222                     + "\">Go to site</a></font<br>");\r
 223       }\r
 224 \r
 225       text.append("</font></html>");\r
 226 \r
 227       break;\r
 228     }\r
 229 \r
 230     fullDetails.setText(text.toString());\r
 231     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 232     {\r
 233       public void run()\r
 234       {\r
 235         fullDetailsScrollpane.getVerticalScrollBar().setValue(0);\r
 236       }\r
 237     });\r
 238   }\r
 239 \r
 240 \r
 241   public void run()\r
 242   {\r
 243     System.out.println("das source browser running");\r
 244     addLocal.setVisible(false);\r
 245     refresh.setVisible(false);\r
 246     progressBar.setVisible(true);\r
 247     progressBar.setIndeterminate(true);\r
 248 \r
 249     dasSources = jalview.io.DasSequenceFeatureFetcher.getDASSources();\r
 250 \r
 251     appendLocalSources();\r
 252 \r
 253     init();\r
 254   }\r
 255 \r
 256   public Vector getSelectedSources()\r
 257   {\r
 258     Vector selected = new Vector();\r
 259     for (int r = 0; r < selectedSources.size(); r++)\r
 260     {\r
 261         for (int i = 0; i < dasSources.length; i++)\r
 262         {\r
 263           if (dasSources[i].getNickname().equals(\r
 264               selectedSources.elementAt(r)))\r
 265           {\r
 266             selected.addElement(dasSources[i]);\r
 267             break;\r
 268           }\r
 269         }\r
 270     }\r
 271 \r
 272     return selected;\r
 273   }\r
 274 \r
 275   public DasSource[] getDASSource()\r
 276   {\r
 277     if(dasSources==null)\r
 278     {\r
 279      dasSources = jalview.io.DasSequenceFeatureFetcher.getDASSources();\r
 280      appendLocalSources();\r
 281     }\r
 282 \r
 283     return dasSources;\r
 284   }\r
 285 \r
 286   public void refresh_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 287   {\r
 288     saveProperties(jalview.bin.Cache.applicationProperties);\r
 289 \r
 290     Thread worker = new Thread(this);\r
 291     worker.start();\r
 292   }\r
 293 \r
 294   private void setCapabilities(DasSource[] sources)\r
 295   {\r
 296     Vector authority = new Vector();\r
 297     Vector type = new Vector();\r
 298     Vector label = new Vector();\r
 299 \r
 300     authority.addElement("Any");\r
 301     type.addElement("Any");\r
 302     label.addElement("Any");\r
 303     label.addElement("NOT IMPLEMENTED YET");\r
 304     filter3.setEnabled(false);\r
 305 \r
 306     for (int i = 0; i < sources.length; i++)\r
 307     {\r
 308       DasSource ds = sources[i];\r
 309 \r
 310       DasCoordinateSystem[] dcs = ds.getCoordinateSystem();\r
 311 \r
 312       for (int j = 0; j < dcs.length; j++)\r
 313       {\r
 314         if (!type.contains(dcs[j].getCategory()))\r
 315           type.addElement(dcs[j].getCategory());\r
 316 \r
 317         if (!authority.contains(dcs[j].getName()))\r
 318           authority.addElement(dcs[j].getName());\r
 319       }\r
 320 \r
 321       String[] slabels = ds.getLabels();\r
 322       for (int s = 0; s < slabels.length; s++)\r
 323       {\r
 324         if (!label.contains(slabels[s]))\r
 325         {\r
 326           label.addElement(slabels[s]);\r
 327         }\r
 328       }\r
 329 \r
 330     }\r
 331 \r
 332     filter1.setListData(authority);\r
 333     filter2.setListData(type);\r
 334     filter3.setListData(label);\r
 335 \r
 336     javax.swing.SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 337     {\r
 338       public void run()\r
 339       {\r
 340         filter1.setSelectedIndex(0);\r
 341         filter2.setSelectedIndex(0);\r
 342         filter3.setSelectedIndex(0);\r
 343       }\r
 344     });\r
 345   }\r
 346 \r
 347   public void amendLocal(boolean newSource)\r
 348   {\r
 349     String url = "http://localhost:8080/", nickname = "";\r
 350 \r
 351     if(!newSource)\r
 352     {\r
 353       int selectedRow = table.getSelectionModel().getMinSelectionIndex();\r
 354       nickname = table.getValueAt(selectedRow, 0).toString();\r
 355       url = ((DasSource)localSources.get(nickname)).getUrl();\r
 356     }\r
 357 \r
 358     JTextField nametf = new JTextField(nickname, 40);\r
 359     JTextField urltf = new JTextField(url, 40);\r
 360 \r
 361     JPanel panel = new JPanel(new BorderLayout());\r
 362     JPanel pane12 = new JPanel(new BorderLayout());\r
 363     pane12.add(new JLabel("Nickname: "), BorderLayout.CENTER);\r
 364     pane12.add(nametf, BorderLayout.EAST);\r
 365     panel.add(pane12, BorderLayout.NORTH);\r
 366     pane12 = new JPanel(new BorderLayout());\r
 367     pane12.add(new JLabel("URL: "), BorderLayout.CENTER);\r
 368     pane12.add(urltf, BorderLayout.EAST);\r
 369     panel.add(pane12, BorderLayout.SOUTH);\r
 370 \r
 371 \r
 372     int reply = JOptionPane.showInternalConfirmDialog(Desktop.desktop,\r
 373         panel, "Enter Nickname & URL of Local DAS Source",\r
 374         JOptionPane.OK_CANCEL_OPTION);\r
 375 \r
 376        if (reply != JOptionPane.OK_OPTION )\r
 377        {\r
 378            return;\r
 379        }\r
 380 \r
 381        if(!urltf.getText().endsWith("/"))\r
 382          urltf.setText(urltf.getText()+"/");\r
 383 \r
 384        Das1Source local = new Das1Source();\r
 385 \r
 386        local.setUrl(urltf.getText());\r
 387        local.setNickname(nametf.getText());\r
 388 \r
 389 \r
 390        if(localSources==null)\r
 391          localSources = new Hashtable();\r
 392 \r
 393        localSources.put(local.getNickname(), local);\r
 394 \r
 395        if(!newSource && !nickname.equals(nametf.getText()))\r
 396        {\r
 397          localSources.remove(nickname);\r
 398        }\r
 399 \r
 400        int size = dasSources.length;\r
 401        int adjust = newSource ? 1 : 0;\r
 402 \r
 403        Object[][] data = new Object[size+adjust][2];\r
 404        for (int i = 0; i < size; i++)\r
 405        {\r
 406          if(!newSource && dasSources[i].getNickname().equals(nickname))\r
 407          {\r
 408            ((DasSource)dasSources[i]).setNickname(local.getNickname());\r
 409            ((DasSource)dasSources[i]).setUrl(local.getUrl());\r
 410            data[i][0] = local.getNickname();\r
 411            data[i][1] = new Boolean(true);\r
 412          }\r
 413          else\r
 414          {\r
 415            data[i][0] = dasSources[i].getNickname();\r
 416            data[i][1] = new Boolean(selectedSources.contains(dasSources[i].\r
 417                getNickname()));\r
 418          }\r
 419        }\r
 420 \r
 421        if(newSource)\r
 422        {\r
 423          data[size][0] = local.getNickname();\r
 424          data[size][1] = new Boolean(true);\r
 425          selectedSources.add(local.getNickname());\r
 426        }\r
 427 \r
 428        DasSource [] tmp = new DasSource[size+adjust];\r
 429 \r
 430        System.arraycopy(dasSources, 0, tmp, 0, size);\r
 431 \r
 432        if(newSource)\r
 433          tmp[size] = local;\r
 434 \r
 435        dasSources = tmp;\r
 436 \r
 437        refreshTableData(data);\r
 438 \r
 439        SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 440        {\r
 441          public void run()\r
 442          {\r
 443            scrollPane.getVerticalScrollBar().setValue(\r
 444                scrollPane.getVerticalScrollBar().getMaximum()\r
 445                );\r
 446          }\r
 447        });\r
 448 \r
 449        displayFullDetails(local.getNickname());\r
 450      }\r
 451 \r
 452     public void editRemoveLocalSource(MouseEvent evt)\r
 453     {\r
 454       int selectedRow = table.getSelectionModel().getMinSelectionIndex();\r
 455       if(selectedRow==-1)\r
 456         return;\r
 457 \r
 458       String nickname = table.getValueAt(selectedRow, 0).toString();\r
 459 \r
 460       if (!localSources.containsKey(nickname))\r
 461       {\r
 462         JOptionPane.showInternalMessageDialog(Desktop.desktop,\r
 463         "You can only edit or remove local DAS Sources!",\r
 464          "Public DAS source - not editable",\r
 465          JOptionPane.WARNING_MESSAGE);\r
 466         return;\r
 467       }\r
 468 \r
 469 \r
 470       Object[] options = {"Edit", "Remove", "Cancel"};\r
 471       int choice = JOptionPane.showInternalOptionDialog(Desktop.desktop,\r
 472     "Do you want to edit or remove "+nickname+"?",\r
 473     "Edit / Remove Local DAS Source",\r
 474     JOptionPane.YES_NO_CANCEL_OPTION,\r
 475     JOptionPane.QUESTION_MESSAGE,\r
 476     null,\r
 477     options,\r
 478     options[2]);\r
 479 \r
 480       switch(choice)\r
 481       {\r
 482         case 0: amendLocal(false);   break;\r
 483         case 1:\r
 484           localSources.remove(nickname);\r
 485           selectedSources.remove(nickname);\r
 486           Object[][] data = new Object[dasSources.length-1][2];\r
 487           DasSource [] tmp = new DasSource[dasSources.length-1];\r
 488           int index = 0;\r
 489           for (int i = 0; i < dasSources.length; i++)\r
 490           {\r
 491             if (dasSources[i].getNickname().equals(nickname))\r
 492             {\r
 493               continue;\r
 494             }\r
 495             else\r
 496             {\r
 497               tmp[index] = dasSources[i];\r
 498               data[index][0] = dasSources[i].getNickname();\r
 499               data[index][1] = new Boolean(selectedSources.contains(dasSources[i].\r
 500                   getNickname()));\r
 501               index++;\r
 502             }\r
 503           }\r
 504            dasSources = tmp;\r
 505            refreshTableData(data);\r
 506            SwingUtilities.invokeLater(new Runnable()\r
 507            {\r
 508              public void run()\r
 509              {\r
 510                scrollPane.getVerticalScrollBar().setValue(\r
 511                    scrollPane.getVerticalScrollBar().getMaximum()\r
 512                    );\r
 513              }\r
 514            });\r
 515 \r
 516           break;\r
 517       }\r
 518     }\r
 519 \r
 520     void appendLocalSources()\r
 521     {\r
 522       if(localSources==null)\r
 523         return;\r
 524 \r
 525       int size = dasSources!=null ? dasSources.length : 0;\r
 526       int lsize = localSources.size();\r
 527 \r
 528       Object[][] data = new Object[size+lsize][2];\r
 529       for (int i = 0; i < size; i++)\r
 530       {\r
 531         data[i][0] = dasSources[i].getNickname();\r
 532         data[i][1] = new Boolean(selectedSources.contains(dasSources[i].\r
 533             getNickname()));\r
 534       }\r
 535 \r
 536       DasSource [] tmp = new DasSource[size+lsize];\r
 537       if(dasSources!=null)\r
 538         System.arraycopy(dasSources, 0, tmp, 0, size);\r
 539 \r
 540       Enumeration en = localSources.keys();\r
 541       int index = size;\r
 542       while(en.hasMoreElements())\r
 543       {\r
 544         String key = en.nextElement().toString();\r
 545         data[index][0] = key;\r
 546         data[index][1] = new Boolean(false);\r
 547         tmp[index] = new Das1Source();\r
 548         tmp[index].setNickname(key);\r
 549         tmp[index].setUrl( ((DasSource)localSources.get(key)).getUrl() );\r
 550 \r
 551         index++;\r
 552       }\r
 553 \r
 554          dasSources = tmp;\r
 555 \r
 556          refreshTableData(data);\r
 557   }\r
 558 \r
 559   public void valueChanged(ListSelectionEvent evt)\r
 560   {\r
 561     //Called when the MainTable selection changes\r
 562     if (evt.getValueIsAdjusting())\r
 563     {\r
 564       return;\r
 565     }\r
 566 \r
 567     displayFullDetails(null);\r
 568 \r
 569     // Filter the displayed data sources\r
 570     int dSize = dasSources.length;\r
 571     ArrayList names = new ArrayList();\r
 572     ArrayList selected = new ArrayList();\r
 573     DasSource ds;\r
 574 \r
 575     //The features filter is not visible, but we must still\r
 576     //filter the das source list here.\r
 577     //July 2006 - only 6 sources fo not serve features\r
 578     Object [] dummyFeatureList = new Object[]{"features"};\r
 579 \r
 580     // capabilities.get\r
 581     for (int i = 0; i < dSize; i++)\r
 582     {\r
 583       ds = dasSources[i];\r
 584 \r
 585       if (!selectedInList(dummyFeatureList, ds.getCapabilities())\r
 586       ||  !selectedInList(filter3.getSelectedValues(),\r
 587                           ds.getLabels()))\r
 588       {\r
 589         continue;\r
 590       }\r
 591 \r
 592       DasCoordinateSystem[] dcs = ds.getCoordinateSystem();\r
 593       for (int j = 0; j < dcs.length; j++)\r
 594       {\r
 595         if (selectedInList(dummyFeatureList,ds.getCapabilities())\r
 596         &&\r
 597             selectedInList(filter1.getSelectedValues(),\r
 598                            new String[]\r
 599                            {dcs[j].getName()})\r
 600             && selectedInList(filter2.getSelectedValues(),\r
 601                               new String[]\r
 602                               {dcs[j].getCategory()}))\r
 603         {\r
 604           names.add(ds.getNickname());\r
 605           selected.add(new Boolean(\r
 606               selectedSources.contains(ds.getNickname())));\r
 607           break;\r
 608         }\r
 609       }\r
 610     }\r
 611 \r
 612     dSize = names.size();\r
 613     Object[][] data = new Object[dSize][2];\r
 614     for (int d = 0; d < dSize; d++)\r
 615     {\r
 616       data[d][0] = names.get(d);\r
 617       data[d][1] = selected.get(d);\r
 618     }\r
 619 \r
 620     refreshTableData(data);\r
 621   }\r
 622 \r
 623   boolean selectedInList(Object [] selection, String[] items)\r
 624   {\r
 625     for (int i = 0; i < selection.length; i++)\r
 626     {\r
 627       if (selection[i].equals("Any"))\r
 628         return true;\r
 629 \r
 630       for (int j = 0; j < items.length; j++)\r
 631       {\r
 632         if (selection[i].equals(items[j]))\r
 633           return true;\r
 634       }\r
 635     }\r
 636 \r
 637     return false;\r
 638   }\r
 639 \r
 640   void setSelectedFromProperties()\r
 641   {\r
 642      String active = jalview.bin.Cache.getDefault("DAS_ACTIVE_SOURCE", "uniprot");\r
 643      StringTokenizer st = new StringTokenizer(active, "\t");\r
 644      selectedSources = new Vector();\r
 645      while(st.hasMoreTokens())\r
 646      {\r
 647        selectedSources.addElement(st.nextToken());\r
 648      }\r
 649 \r
 650      String local = jalview.bin.Cache.getProperty("DAS_LOCAL_SOURCE");\r
 651      if(local!=null)\r
 652      {\r
 653        if(localSources == null)\r
 654          localSources = new Hashtable();\r
 655 \r
 656        st = new StringTokenizer(local, "\t");\r
 657        while(st.hasMoreTokens())\r
 658        {\r
 659          String token = st.nextToken();\r
 660          int bar = token.indexOf("|");\r
 661          Das1Source source = new Das1Source();\r
 662 \r
 663          source.setUrl(token.substring(bar + 1));\r
 664          source.setNickname(token.substring(0, bar));\r
 665 \r
 666          localSources.put(source.getNickname(), source);\r
 667        }\r
 668      }\r
 669   }\r
 670 \r
 671   public void saveProperties(Properties properties)\r
 672   {\r
 673     properties.setProperty("DAS_REGISTRY_URL", registryURL.getText());\r
 674 \r
 675     StringBuffer sb = new StringBuffer();\r
 676     for(int r=0; r<table.getModel().getRowCount(); r++)\r
 677     {\r
 678       if( ((Boolean)table.getValueAt(r,1)).booleanValue())\r
 679       {\r
 680         sb.append(table.getValueAt(r,0)+"\t");\r
 681       }\r
 682     }\r
 683 \r
 684     properties.setProperty("DAS_ACTIVE_SOURCE", sb.toString() );\r
 685 \r
 686     if(localSources!=null)\r
 687     {\r
 688       sb = new StringBuffer();\r
 689       Enumeration en = localSources.keys();\r
 690       while(en.hasMoreElements())\r
 691       {\r
 692         String token = en.nextElement().toString();\r
 693         sb.append(token+"|"\r
 694                   + ((DasSource)localSources.get(token)).getUrl()\r
 695                   +"\t");\r
 696       }\r
 697 \r
 698       properties.setProperty("DAS_LOCAL_SOURCE", sb.toString());\r
 699     }\r
 700 \r
 701   }\r
 702 \r
 703   class DASTableModel\r
 704       extends AbstractTableModel\r
 705   {\r
 706 \r
 707     public DASTableModel(Object[][] data)\r
 708     {\r
 709       this.data = data;\r
 710     }\r
 711 \r
 712     private String[] columnNames = new String[]  {"Nickname", "Use Source"};\r
 713 \r
 714     private Object[][] data;\r
 715 \r
 716     public int getColumnCount()\r
 717     {\r
 718       return columnNames.length;\r
 719     }\r
 720 \r
 721     public int getRowCount()\r
 722     {\r
 723       return data.length;\r
 724     }\r
 725 \r
 726     public String getColumnName(int col)\r
 727     {\r
 728       return columnNames[col];\r
 729     }\r
 730 \r
 731     public Object getValueAt(int row, int col)\r
 732     {\r
 733       return data[row][col];\r
 734     }\r
 735 \r
 736     /*\r
 737      * JTable uses this method to determine the default renderer/\r
 738      * editor for each cell.  If we didn't implement this method,\r
 739      * then the last column would contain text ("true"/"false"),\r
 740      * rather than a check box.\r
 741      */\r
 742     public Class getColumnClass(int c)\r
 743     {\r
 744       return getValueAt(0, c).getClass();\r
 745     }\r
 746 \r
 747     /*\r
 748      * Don't need to implement this method unless your table's\r
 749      * editable.\r
 750      */\r
 751     public boolean isCellEditable(int row, int col)\r
 752     {\r
 753       //Note that the data/cell address is constant,\r
 754       //no matter where the cell appears onscreen.\r
 755       return col == 1;\r
 756 \r
 757     }\r
 758 \r
 759     /*\r
 760      * Don't need to implement this method unless your table's\r
 761      * data can change.\r
 762      */\r
 763     public void setValueAt(Object value, int row, int col)\r
 764     {\r
 765       data[row][col] = value;\r
 766       fireTableCellUpdated(row, col);\r
 767 \r
 768       String name = getValueAt(row,0).toString();\r
 769       boolean selected = ((Boolean)value).booleanValue();\r
 770 \r
 771       if(selectedSources.contains(name) && !selected)\r
 772         selectedSources.remove(name);\r
 773 \r
 774       if(!selectedSources.contains(name) && selected)\r
 775         selectedSources.add(name);\r
 776     }\r
 777   }\r
 778 }\r
 779 \r
 780 \r