src/jalview/gui/ScalePanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package jalview.gui;\r
  20 \r
  21 import jalview.datamodel.*;\r
  22 \r
  23 import java.awt.*;\r
  24 import java.awt.event.*;\r
  25 \r
  26 import javax.swing.*;\r
  27 \r
  28 \r
  29 /**\r
  30  * DOCUMENT ME!\r
  31  *\r
  32  * @author $author$\r
  33  * @version $Revision$\r
  34  */\r
  35 public class ScalePanel extends JPanel\r
  36 {\r
  37     protected int offy = 4;\r
  38 \r
  39     /** DOCUMENT ME!! */\r
  40     public int width;\r
  41     protected AlignViewport av;\r
  42     AlignmentPanel ap;\r
  43     boolean stretchingGroup = false;\r
  44     int min; //used by mouseDragged to see if user\r
  45     int max; //used by mouseDragged to see if user\r
  46 \r
  47     // wants to delete columns\r
  48     public ScalePanel(AlignViewport av, AlignmentPanel ap)\r
  49     {\r
  50         this.av = av;\r
  51         this.ap = ap;\r
  52 \r
  53         addMouseListener(new MouseAdapter()\r
  54             {\r
  55                 public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
  56                 {\r
  57                     doMousePressed(evt);\r
  58                 }\r
  59 \r
  60                 public void mouseReleased(MouseEvent evt)\r
  61                 {\r
  62                     doMouseReleased(evt);\r
  63                 }\r
  64             });\r
  65         addMouseMotionListener(new MouseMotionAdapter()\r
  66             {\r
  67                 public void mouseDragged(MouseEvent evt)\r
  68                 {\r
  69                     doMouseDragged(evt);\r
  70                 }\r
  71             });\r
  72     }\r
  73 \r
  74     /**\r
  75      * DOCUMENT ME!\r
  76      *\r
  77      * @param evt DOCUMENT ME!\r
  78      */\r
  79     public void doMousePressed(MouseEvent evt)\r
  80     {\r
  81         int x = evt.getX();\r
  82         int res = (x / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
  83         SequenceGroup sg = null;\r
  84 \r
  85         min = res;\r
  86         max = res;\r
  87 \r
  88         if (av.getColumnSelection().contains(res))\r
  89         {\r
  90             av.getColumnSelection().removeElement(res);\r
  91             ap.annotationPanel.removeEditableColumn(res);\r
  92         }\r
  93         else\r
  94         {\r
  95             av.getColumnSelection().addElement(res);\r
  96             sg = new SequenceGroup();\r
  97 \r
  98             for (int i = 0; i < av.alignment.getSequences().size(); i++)\r
  99             {\r
 100                 sg.addSequence(av.alignment.getSequenceAt(i), false);\r
 101             }\r
 102 \r
 103             sg.setStartRes(res);\r
 104             sg.setEndRes(res);\r
 105         }\r
 106 \r
 107         av.setSelectionGroup(sg);\r
 108         ap.repaint();\r
 109     }\r
 110 \r
 111     /**\r
 112      * DOCUMENT ME!\r
 113      *\r
 114      * @param evt DOCUMENT ME!\r
 115      */\r
 116     public void doMouseReleased(MouseEvent evt)\r
 117     {\r
 118         int x = evt.getX();\r
 119         int res = (x / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
 120 \r
 121         if (av.getColumnSelection() != null)\r
 122         {\r
 123             for (int i = 0; i < av.getColumnSelection().size(); i++)\r
 124             {\r
 125                 ap.annotationPanel.addEditableColumn(av.getColumnSelection()\r
 126                                                        .columnAt(i));\r
 127             }\r
 128         }\r
 129 \r
 130         if (!stretchingGroup)\r
 131         {\r
 132             ap.repaint();\r
 133 \r
 134             return;\r
 135         }\r
 136 \r
 137         SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 138 \r
 139         if (res > sg.getStartRes())\r
 140         {\r
 141             sg.setEndRes(res);\r
 142         }\r
 143         else if (res < sg.getStartRes())\r
 144         {\r
 145             sg.setStartRes(res);\r
 146         }\r
 147 \r
 148         stretchingGroup = false;\r
 149         ap.repaint();\r
 150     }\r
 151 \r
 152     /**\r
 153      * DOCUMENT ME!\r
 154      *\r
 155      * @param evt DOCUMENT ME!\r
 156      */\r
 157     public void doMouseDragged(MouseEvent evt)\r
 158     {\r
 159         int x = evt.getX();\r
 160         int res = (x / av.getCharWidth()) + av.getStartRes();\r
 161 \r
 162         if (res < min)\r
 163         {\r
 164             min = res;\r
 165         }\r
 166 \r
 167         if (res > max)\r
 168         {\r
 169             max = res;\r
 170         }\r
 171 \r
 172         SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
 173 \r
 174         if (sg != null)\r
 175         {\r
 176             stretchingGroup = true;\r
 177 \r
 178             if (!av.getColumnSelection().contains(res))\r
 179             {\r
 180                 av.getColumnSelection().addElement(res);\r
 181             }\r
 182 \r
 183             if (res > sg.getStartRes())\r
 184             {\r
 185                 sg.setEndRes(res);\r
 186             }\r
 187             else if (res < sg.getStartRes())\r
 188             {\r
 189                 sg.setStartRes(res);\r
 190             }\r
 191 \r
 192             for (int i = min; i <= max; i++)\r
 193             {\r
 194                 if ((i < sg.getStartRes()) || (i > sg.getEndRes()))\r
 195                 {\r
 196                     av.getColumnSelection().removeElement(i);\r
 197                     ap.annotationPanel.removeEditableColumn(res);\r
 198                 }\r
 199                 else\r
 200                 {\r
 201                     av.getColumnSelection().addElement(i);\r
 202                 }\r
 203             }\r
 204 \r
 205             ap.repaint();\r
 206         }\r
 207     }\r
 208 \r
 209     /**\r
 210      * DOCUMENT ME!\r
 211      *\r
 212      * @param g DOCUMENT ME!\r
 213      */\r
 214     public void paintComponent(Graphics g)\r
 215     {\r
 216         drawScale(g, av.getStartRes(), av.getEndRes(), getWidth(), getHeight());\r
 217     }\r
 218 \r
 219     // scalewidth will normally be screenwidth,\r
 220     public void drawScale(Graphics g, int startx, int endx, int width,\r
 221         int height)\r
 222     {\r
 223         Graphics2D gg = (Graphics2D) g;\r
 224         gg.setFont(av.getFont());\r
 225         gg.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING,\r
 226             RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);\r
 227 \r
 228         //Fill in the background\r
 229         gg.setColor(Color.white);\r
 230         gg.fillRect(0, 0, width, height);\r
 231         gg.setColor(Color.black);\r
 232 \r
 233         //Fill the selected columns\r
 234         ColumnSelection cs = av.getColumnSelection();\r
 235         gg.setColor(new Color(220, 0, 0));\r
 236 \r
 237         for (int i = 0; i < cs.size(); i++)\r
 238         {\r
 239             int sel = cs.columnAt(i);\r
 240 \r
 241             if ((sel >= startx) && (sel <= endx))\r
 242             {\r
 243                 gg.fillRect((sel - startx) * av.charWidth, 0, av.charWidth,\r
 244                     getHeight());\r
 245             }\r
 246         }\r
 247 \r
 248         // Draw the scale numbers\r
 249         gg.setColor(Color.black);\r
 250 \r
 251         int scalestartx = (startx / 10) * 10;\r
 252 \r
 253         FontMetrics fm = gg.getFontMetrics(av.getFont());\r
 254         int y = av.charHeight - fm.getDescent();\r
 255 \r
 256         if ((scalestartx % 10) == 0)\r
 257         {\r
 258             scalestartx += 5;\r
 259         }\r
 260 \r
 261         for (int i = scalestartx; i < endx; i += 5)\r
 262         {\r
 263             if ((i % 10) == 0)\r
 264             {\r
 265                 gg.drawString(String.valueOf(i),\r
 266                     (i - startx - 1) * av.charWidth, y);\r
 267                 gg.drawLine((int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 268                     (av.charWidth / 2)), y + 2,\r
 269                     (int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 270                     (av.charWidth / 2)), y + (fm.getDescent() * 2));\r
 271             }\r
 272             else\r
 273             {\r
 274                 gg.drawLine((int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 275                     (av.charWidth / 2)), y + fm.getDescent(),\r
 276                     (int) (((i - startx - 1) * av.charWidth) +\r
 277                     (av.charWidth / 2)), y + (fm.getDescent() * 2));\r
 278             }\r
 279         }\r
 280     }\r
 281 }\r